Refined structure of the monoclonal antibody HyHEL-5 with its antigen hen egg-white lysozyme

Acta Crystallographica Section D: Biological Crystallography

Volumn 52, Issue 2, 1996, Pages 315-326

  Cohen, Gerson H ^a   Sheriff, Steven ^a,b   Davies, David R ^a  

^a NATIONAL INSTITUTE OF DIABETES AND DIGESTIVE AND KIDNEY DISEASES   (United States)

^b BRISTOL MYERS SQUIBB   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ANTIGEN; EGG WHITE; LYSOZYME; MONOCLONAL ANTIBODY;

HEN;

EID: 0030047926     PISSN: 09074449     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1107/S0907444995014855     Document Type: Article

References (66)

1. Amit, A. G., Mariuzza, R. A., Phillips, S. E. V. & Poljak, R. J. (1986). Science, 233, 747-753.
2. Artymiuk, P. J., Blake, C. C. F., Grace, D. E. P., Oatley, S. J., Phillips, D. C. & Sternberg, M. J. E. (1979). Nature (London), 280, 563-568.
3. Ban, N., Escobar, C., Garcia, R., Hasel, K, Day, J., Greenwood, A., McPherson, A. (1994). Proc. Natl Acad. Sci. USA, 91, 1604-1608.
4. Bentley, G. A., Boulot, G., Riottot, M. M. & Poljak, R. J. (1990). Nature (London), 348, 254-257.
5. Bernstein, F. C., Koetzle, T. F., Williams, G. J. B., Meyer, E. F. Jr, Brice, M. D., Rodgers, J. R., Kennard, O., Shimanouchi, T. & Tasumi, M. (1977). J. Mol. Biol. 112, 535-542.
6. Bhat, T. N., Bentley, G. A., Boulot, G., Greene, M. I., Tello, D., Dall'Acqua, W., Souchon, H., Schwartz, F. P., Mariuzza, R. A. & Poljak, R. J. (1994). Proc. Natl Acad. Sci. USA, 91, 1089-1093.
7. Bhat, T. N., Bentley, G. A., Fischmann, T. O., Boulot, G. & Poljak, R. J. (1990). Nature (London), 347, 483-485.
8. Bizebard, T., Gigant, B., Rigolet, P., Rasmussen, B., Diat, O., Bvsecke, P., Wharton, S. A., Skehel, J. A. & Knossow, M. (1995). Nature (London), 376, 92-94.
9. Blake, C. C. F., Johnson, L. N., Mair, G. A., North, A. C. T., Phillips, D. C. & Sarma, V. R. (1967). Proc. R. Soc. London Ser. B, 167, 365-377.
10. Bossart-Whitaker, P., Chang, C. Y., Novotny, J., Benjamin, D. C. & Sheriff, S. (1995). J. Mol. Biol. 253, 559-575.
11. Braden, B. C., Souchon, H., Eiselé, J.-L., Bentley, G. A., Bhat, T. N., Navaza, J. & Poljak, R. J. (1994). J. Mol. Biol. 243, 767-781.
12. Brooks, B., Bruccoleri, R., Olafson, B., States, D., Swaminathan, S. & Karplus, M. (1983). J. Comput. Chem. 4, 187-217.
13. Brünger, A. T. (1992). X-PLOR Manual. New Haven, CT, USA: Yale University Press.
14. Brünger, A. T., Kuriyan, J. & Karplus, M. (1987). Science, 235, 458-460.
15. Chacko, S., Silverton, E., Kam-Morgan, L., Smith-Gill, S., Cohen, G. & Davies, D. (1995). J. Mol. Biol. 245, 261-274.
16. Chambers, J. L. & Stroud, R. M. (1979). Acta Cryst. B35, 1861-1874.
17. Cheetham, J. C., Artymiuk, P. J. & Phillips, D. C. (1992). J. Mol. Biol. 224, 613-628.
18. Chitarra, V., Alzari, P. M., Bentley, G. A., Bhat, T. N., Eiselé, J.-L., Houdusse, A., Lescar, J., Souchon, H. & Poljak, R. J. (1993). Proc. Natl Acad. Sci. USA, 90, 7711-7715.
19. Cohen, G. H. (1993). J. Appl. Cryst. 26, 495-496.
20. Connolly, M. L. (1983). J. Appl. Cryst. 16, 548-558.
21. Connolly, M. L. (1993). J. Mol. Graphics, 11, 139-141.
22. Daopin, S., Davies, D. R., Schlunegger, M. P. & Grütter, M. G. (1994). Acta Cryst. D50, 85-92.
23. Davies, D. R., Padlan, E. A. & Sheriff, S. (1990). Annu. Rev. Biochem. 59, 439-473.
24. Davies, D. R., Sheriff, S. & Padlan, E. A. (1988). J. Biol. Chem. 263, 10541-10544.
25. Davies, D. R., Sheriff, S. & Padlan, E. (1989). Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. LIV, 233-238.
26. Engh, R. A. & Huber, R. (1991). Acta Cryst. A47, 392-400.
27. Evans, S. V., Rose, D. R., To, R., Young, N. M. & Bundle, D. R. (1994). J. Mol. Biol. 241, 691-705.
28. Fields, B. A., Goldbaum, F. A., Ysern, X., Poljak, R. J. & Mariuzza, R. A. (1995). Nature (London), 374, 739-742.
29. Fischmann, T. O., Bentley, G. A., Bhat, T. N., Boulot, G., Mariuzza, R. A., Phillips, S. E. V., Tello, D. & Poljak, R. J. (1991). J. Biol. Chem. 266, 12915-12920.
30. Flocco, M. M. & Mowbray, S. L. (1994). J. Mol. Biol. 235, 709-717.
31. Ford, L. O., Johnson, L. N., Machin, P. A., Phillips, D. C. & Tjian, R. (1974). J. Mol. Biol. 88, 349-371.
32. Gelin, B. R. & Karplus, M. (1979). Biochemistry, 18, 1256-1268.
33. Grivel, J.-C. & Smith-Gill, S. J. (1996). Structure of Antigens, Vol. 3, edited by M. H. Van Regenmotel, pp. 91-154. Boca Raton, Florida: CRC Press.
34. Harata, K. (1994). Acta Cryst. D50, 250-257.
35. Hendrickson, W. A. (1985). Methods Enzymol. 115, 252-270.
36. Hibbits, K. A., Gill, D. S. & Willson, R. C. (1994). Biochemistry, 33, 3584-3590.
37. Jack, A. & Levitt, M. (1978). Acta Cryst. A34, 931-935.
38. Johnson, C. K. (1995). ORTEP: A Fortran Thermal-Ellipsoid Plot Program for Crystal Structure Illustrations. Oak Ridge National Laboratory, Report ORNL-3794. Revised.
39. Jones, T. A. (1978). J. Appl. Cryst. 11, 268-272.
40. Jones, T. A., Zou, J.-Y., Cowan, S. W. & Kjeldgaard, M. (1991). Acta Cryst. A47, 110-119.
41. Kabat, E. A., Wu, T. T., Reid-Miller, M., Perry, H. M. & Gottesman, K. S. (1987). Sequences of Immunological Interest, 4th ed. Bethesda, Maryland, USA: National Institutes of Health.
42. Kurinov, I. V. & Harrison, R. W. (1995). Acta Cryst. D51, 98-109.
43. Laskowski, R. A., MacArthur, M. W., Moss, D. S. & Thornton, J. M. (1993). J. Appl. Cryst. 26, 283-291.
44. Laskowski, R. A., Moss, D. S. & Thornton, J. M. (1993). J. Mol. Biol. 231, 1049-1067.
45. Levitt, M. & Perutz, M. F. (1988). J. Mol. Biol. 201, 751-754.
46. Luzzati, V. (1952). Acta Cryst. 5, 802-810.
47. Malby, R. L., Tulip, W. R., Harley, V. R., McKim-Breschkin, J. L., Laver, W. G., Webster, R. G. & Colman, P. M. (1994). Structure, 2, 733-746.
48. Milner-White, E. J. & Poet, R. (1987). Trends Biochem. Sci. 12, 198-192.
49. Milner-White, E. J., Ross, B. M., Ismail, R., Belhaj-Mostefa, K. & Poet, R. (1988). J. Mol. Biol. 204, 777-782.
50. Padlan, E. A., Silverton, E. W., Sheriff, S., Cohen, G. H, Smith-Gill, S. J. & Davies, D. R. (1989). Proc. Natl Acad. Sci. USA, 86, 5938-5942.
51. Paterson, Y., Englander, S. W. & Roder, H. (1990). Science, 249, 755-759.
52. Ponder, J. W. & Richards, F. M. (1987). J. Mol. Biol 193, 775-791.
53. Prasad, L., Sharma, S., Vandonselaar, M., Quail, J. W., Lee, J. S., Waygood, E. B., Wilson, K. S., Dauter, Z. & Delbaere, L. T. J. (1993). J. Biol. Chem. 268, 10705-10708.
54. Ramachandran, G. N. & Sasisekharan, V. (1968). Adv. Protein Chem. 28, 283-437.
55. Ramanadham, M., Sieker, L. C. & Jensen, L. H. (1990). Acta Cryst. B46, 63-69.
56. Sasisekharan, V. (1962). Collagen, edited by N. Ramanathan, pp. 39-78. New York: Interscience Publishers.
57. Satow, Y., Cohen, G. H., Padlan, E. A. & Davies, D. R. (1986). J. Mol. Biol. 190, 593-604.
58. Sheriff, S., Hendrickson, W. A. & Smith, J. L. (1987). J. Mol. Biol. 197, 273-296.
59. Sheriff, S., Silverton, E. W., Padlan, E. A., Cohen, G. H., Smith-Gill, S. J., Finzel, B. C. & Davies, D. R. (1987). Proc. Natl Acad. Sci. USA, 84, 8075-8079.
60. Smith-Gill, S. J., Wilson, A. C., Potter, M., Prager, E. M., Feldmann, R. J. & Mainhart, C. R. (1982). J. Immunol. 128, 314-322.
61. Strynadka, N. C. & James, M. N. G. (1991). J. Mol. Biol. 220, 401-424.
62. Tulip, W. R., Varghese, J. N., Laver, W. G., Webster, R. G. & Colman, P. M. (1992). J. Mol. Biol. 227, 122-148.
63. Tulip, W. R., Varghese, J. N., Webster, R. G., Laver, W. G. & Colman, P. M. (1992). J. Mol. Biol. 227, 149-159.
64. Wilson, K. P., Malcolm, B. A. & Matthews, B. W. (1992). J. Biol. Chem. 267, 10842-10849.
65. Wu, T. T. & Kabat, E. A. (1970). J. Exp. Med. 132, 211-250.
66. Young, A. C. M., Dewan, J. C., Nave, C. & Tilton, R. F. (1993). J. Appl. Cryst. 26, 309-319.