Mechanistic studies of the 5-iodouracil chromophore relevant to its use in nucleoprotein photo-cross-linking

Journal of the American Chemical Society

Volumn 118, Issue 24, 1996, Pages 5796-5803

  Norris, Christopher L ^a   Meisenheimer, Poncho L ^a   Koch, Tad H ^a  

^a UNIVERSITY OF COLORADO   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

5 BROMOURIDINE; IODOURACIL; PHENYLALANINE DERIVATIVE; TYROSINE DERIVATIVE; UNCLASSIFIED DRUG; URACIL DERIVATIVE;

ARTICLE; DNA CROSS LINKING; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE; PHOTOCHEMISTRY; QUANTUM CHEMISTRY;

EID: 0030036934     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja9607852     Document Type: Article

References (38)

1. Budowsky, E. I.; Abdurashidova, G. G. Prog. Nucl. Res. 1989, 37, 1. Abdurashidova, G. G.; Tsvetkova, E. A.; Budowsky, E. I. Nucl. Acids Res. 1991, 19, 1909. Allen, T. D.; Wick, K. L.; Matthews, K. S. J. Biol. Chem. 1991, 266, 6113. Wower, J.; Hixson, S. S.; Zimmermann, R. A. Biochemistry 1988, 27, 8114. Lee, D. K.; Evans, R. K.; Blanco, J.; Gottesfeld, J.; Johnson, J. D. J. Biol. Chem. 1991, 266, 16478. Sontheimer, E. J. Mol. Biol. Rep. 1994, 20, 35.
2. Budowsky, E. I.; Abdurashidova, G. G. Prog. Nucl. Res. 1989, 37, 1. Abdurashidova, G. G.; Tsvetkova, E. A.; Budowsky, E. I. Nucl. Acids Res. 1991, 19, 1909. Allen, T. D.; Wick, K. L.; Matthews, K. S. J. Biol. Chem. 1991, 266, 6113. Wower, J.; Hixson, S. S.; Zimmermann, R. A. Biochemistry 1988, 27, 8114. Lee, D. K.; Evans, R. K.; Blanco, J.; Gottesfeld, J.; Johnson, J. D. J. Biol. Chem. 1991, 266, 16478. Sontheimer, E. J. Mol. Biol. Rep. 1994, 20, 35.
3. Budowsky, E. I.; Abdurashidova, G. G. Prog. Nucl. Res. 1989, 37, 1. Abdurashidova, G. G.; Tsvetkova, E. A.; Budowsky, E. I. Nucl. Acids Res. 1991, 19, 1909. Allen, T. D.; Wick, K. L.; Matthews, K. S. J. Biol. Chem. 1991, 266, 6113. Wower, J.; Hixson, S. S.; Zimmermann, R. A. Biochemistry 1988, 27, 8114. Lee, D. K.; Evans, R. K.; Blanco, J.; Gottesfeld, J.; Johnson, J. D. J. Biol. Chem. 1991, 266, 16478. Sontheimer, E. J. Mol. Biol. Rep. 1994, 20, 35.
4. Budowsky, E. I.; Abdurashidova, G. G. Prog. Nucl. Res. 1989, 37, 1. Abdurashidova, G. G.; Tsvetkova, E. A.; Budowsky, E. I. Nucl. Acids Res. 1991, 19, 1909. Allen, T. D.; Wick, K. L.; Matthews, K. S. J. Biol. Chem. 1991, 266, 6113. Wower, J.; Hixson, S. S.; Zimmermann, R. A. Biochemistry 1988, 27, 8114. Lee, D. K.; Evans, R. K.; Blanco, J.; Gottesfeld, J.; Johnson, J. D. J. Biol. Chem. 1991, 266, 16478. Sontheimer, E. J. Mol. Biol. Rep. 1994, 20, 35.
5. Budowsky, E. I.; Abdurashidova, G. G. Prog. Nucl. Res. 1989, 37, 1. Abdurashidova, G. G.; Tsvetkova, E. A.; Budowsky, E. I. Nucl. Acids Res. 1991, 19, 1909. Allen, T. D.; Wick, K. L.; Matthews, K. S. J. Biol. Chem. 1991, 266, 6113. Wower, J.; Hixson, S. S.; Zimmermann, R. A. Biochemistry 1988, 27, 8114. Lee, D. K.; Evans, R. K.; Blanco, J.; Gottesfeld, J.; Johnson, J. D. J. Biol. Chem. 1991, 266, 16478. Sontheimer, E. J. Mol. Biol. Rep. 1994, 20, 35.
6. Budowsky, E. I.; Abdurashidova, G. G. Prog. Nucl. Res. 1989, 37, 1. Abdurashidova, G. G.; Tsvetkova, E. A.; Budowsky, E. I. Nucl. Acids Res. 1991, 19, 1909. Allen, T. D.; Wick, K. L.; Matthews, K. S. J. Biol. Chem. 1991, 266, 6113. Wower, J.; Hixson, S. S.; Zimmermann, R. A. Biochemistry 1988, 27, 8114. Lee, D. K.; Evans, R. K.; Blanco, J.; Gottesfeld, J.; Johnson, J. D. J. Biol. Chem. 1991, 266, 16478. Sontheimer, E. J. Mol. Biol. Rep. 1994, 20, 35.
7. Willis, M. C.; Hicke, B. J.; Uhlenbeck, O. C.; Cech, T. R.; Koch, T. H. Science 1993, 262, 1255.
8. Hicke, B. J.; Willis, M. C.; Koch, T. H.; Cech, T. R. Biochemistry 1994, 33, 3364.
9. Stump, W. T.; Hall, K. B. RNA 1995, 1, 55.
10. Willis, M. C.; LeCuyer, K. A.; Meisenheimer, K. M.; Uhlenbeck, O. C.; Koch, T. H. Nucleic Acids Res. 1994, 22, 4947.
11. Turek, C.; Gold, L. Science 1990, 249, 505.
12. Jenseti, K. B.; Atkinson, B. L.; Willis, M. C., Koch, T. H.; Gold, L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1995, 92, 12220.
13. Ito, S.; Saito, I.; Matsuura, T. J. Am. Chem. Soc. 1980, 102, 7535.
14. Swanson, B. J.; Kutzer, J. C.; Koch, T. H. J. Am. Chem. Soc. 1981, 103, 1274.
15. Dietz, T. M.; Trebra, R. J. von; Swanson, B. J.; Koch, T. H. J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, 1793.
16. Dietz, T. M.; Koch, T. H. Photochem. Photobiol. 1987, 46, 971.
17. Dietz, T. M.; Koch, T. H. Photochem. Photobiol. 1989, 49, 121.
18. Gott, J. M.; M. C, W.; Koch, T. H.; Uhlenbeck, O. C. Biochemistry 1991, 30, 6290.
19. Norris, C.; Meisenheimer, K. M.; Koch, T. H. Photochem. Photobiol. 1996, submitted.
20. Rupp, W. D.; Prusoff, W. H. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1965, 18, 158.
21. Gilbert, E.; Schulte-Frohlinde, D. Z. Naturforsch., Teil B, 1970, 25, 492. Gilbert, E.; Wagner, G.; Schulte-Frohlinde, D. Z. Naturforsch., Teil B, 1971, 26, 209. Gilbert, E.; Wagner, G.; Schulte-Frohlinde, D. Z. Naturforsch., Teil B, 1972, 27, 501.
22. Gilbert, E.; Schulte-Frohlinde, D. Z. Naturforsch., Teil B, 1970, 25, 492. Gilbert, E.; Wagner, G.; Schulte-Frohlinde, D. Z. Naturforsch., Teil B, 1971, 26, 209. Gilbert, E.; Wagner, G.; Schulte-Frohlinde, D. Z. Naturforsch., Teil B, 1972, 27, 501.
23. Gilbert, E.; Schulte-Frohlinde, D. Z. Naturforsch., Teil B, 1970, 25, 492. Gilbert, E.; Wagner, G.; Schulte-Frohlinde, D. Z. Naturforsch., Teil B, 1971, 26, 209. Gilbert, E.; Wagner, G.; Schulte-Frohlinde, D. Z. Naturforsch., Teil B, 1972, 27, 501.
24. Görner, H. J. Photochem. Photobiol., A 1993, 72, 197.
25. Sugiyama, H.; Tsutsumi, Y.; Fujimoto, K.; Saito, I. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 4443.
26. Rahn, R. O.; Sellin, H. G. Photochem. Photobiot. 1983, 37, 661.
27. Wood, T. G.; Marongiu, M. E.; Prusoff, W. H. Biochem. Pharmacol. 1991, 41, 439.
28. Kropp, P. J.; Worsham, P. R.; Davidson, R. I.; Jones, T. H. J. Am. Chem. Soc. 1982, 104, 3972.
29. Slocum, G. H.; Kaufmann, K.; Schuster, G. B. J. Am. Chem. Soc. 1981, 103, 4625.
30. Kropp, P. J.; NcNeely, S. A.; Davis, R. D. J. Am. Chem. Soc. 1983, 105, 6907.
31. Rothman, W.; Kearns, D. R. Photochem. Photobiol. 1967, 6, 775.
32. Battacharyya, S. N.; Das, P. K. J. Chem. Soc., Faraday Trans. 2 1984, 80, 1107.
33. Görner, H. J. Photochem. Photobiol., B 1990, 5, 359.
34. Lipson, M.; Deniz, A. A.; Peters, K. S. J. Phys. Chem. 1996, 100, 3580.
35. Valegard, K., Murray, J. B., Stockley, P. G., Stonehouse, N. J.; Liljas, L. Nature 1994, 371, 623.
36. Oubridge, C.; Ito, N.; Evans, P. R.; Teo, C. H.; Nagai, K. Nature 1994, 372, 432.
37. Peters, K. S.; Snyder, G. J. Science 1988, 241, 1053.
38. Norris, C. L.; Peters, K. S. Biophys. J. 1993, 65, 1660.