Designing bacteria for the degradation of nitro- and chloroaromatic pollutants

Naturwissenschaften

Volumn 83, Issue 5, 1996, Pages 201-213

  Pieper, D H ^a,b   Timmis, K N ^a,b   Ramos, J L ^a,b  

^a HELMHOLTZ CENTRE FOR INFECTION RESEARCH   (Germany)

^b NONE

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BACTERIUM; BIOTECHNOLOGY; DRUG TOXICITY; NONHUMAN; POLLUTANT; REVIEW;

EID: 0029992893     PISSN: 00281042     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1007/BF01143325     Document Type: Review

References (123)

1. Haas, R., Schreiber, I., Löw, E. von, Stork, G.: Fresenius J. Anal. Chem. 338, 41 (1990)
2. Travis, C. C., Hattemer-Frey, H. A., Silbergeld, E.: Environ. Sci. Technol. 23, 1061 (1989)
3. van der Meer, J. R., DeVos, W. M., Harayama, S., Zehnder, A. J. B.: Microbiol. Rev. 56, 677 (1992)
4. Timmis, K. N., Steffan, R. J., Unterman, R.: Ann. Rev. Microbiol. 48, 525 (1994)
5. Commandeur, L. C. M., Parsons, J. R.: Biodegradation 1, 207 (1990)
6. Hardman, D. J.: Crit. Rev. Biotech. 11, 1 (1991)
7. Higson, F. K.: Adv. Appl. Microbiol. 37, 1 (1992)
8. Marvin-Sikkema, F. D., de Sont, J. A. M.: Appl. Microbiol. Biotechnol. 42, 499 (1994)
9. Zeyer, J., Kocher, H. P.: J. Bacteriol. 170, 1789 (1988)
10. Ecker, S., Widmann, T., Lenke, H., Fischer, P., Bruhn, C., Knackmuss, H. J.: Arch. Microbiol. 158, 149 (1992)
11. Groenewegen, P. E. J., de Bont, J. A. M.: ibid. 158, 381 (1992)
12. Suen, W. C., Spain, J. C.: J. Bacteriol. 175, 1831 (1993)
13. Haigler, B. E., Nishino, S. F., Spain, J. C.: ibid. 176, 3433 (1994)
14. Romanov, V., Hausinger, R. P.: ibid. 176, 3368 (1994)
15. Haddock, J. D., Horton, J. R., Gibson, D. T.: ibid. 177, 20 (1995)
16. van den Tweel, W. J. J., Kok, J. B., de Bont, J. A. M.: Appl. Environ. Microbiol. 53, 810 (1987)
17. Lenke, H., Knackmuss, H. J.: ibid. 58, 2933 (1992)
18. Löffler, F., Müller, R., Lingens, F.: Biol. Chem. Hoppe-Seyler 373, 1001 (1992)
19. Rhys-Williams, W., Taylor, S. C., Williams, P.: J. Gen. Microbiol. 139, 1967 (1993)
20. Hernandez, B. S., Higson, F. K., Kondrat, R., Focht, D. D.: Appl. Environ. Microbiol. 57, 3361 (1991)
21. Fetzner, S., Müller, R., Lingens, F.: J. Bacteriol. 174, 279 (1992)
22. Seeger, M., Timmis, K. N., Hofer, B.: FEMS Lett. 133, 259 (1995)
23. Dorn, E., Knackmuss, H. J.: Biochem. J. 174, 73 (1978)
24. Dorn, E., Knackmuss, H. J.: ibid. 174, 85 (1978)
25. Schmidt, E., Knackmuss, H. J.: ibid. 192, 339 (1980)
26. Schmidt, E., Remberg, G., Knackmuss, H. J.: ibid. 192, 331 (1980)
27. Weissenfels, W. D., Klewer, H. J., Langhoff, J.: Appl. Microbiol. Biotechnol. 36, 689 (1992)
28. Boyle, A. W., Silvin, C. J., Hassett, J. P., Nakas, J. P., Tanenbaum, S. W.: Biodegradation 2, 285 (1992)
29. Brenner, V., Arensdorf, J. J., Focht, D. D.: ibid. 5, 359 (1994)
30. Blasco, R., Wittich, R. M., Mallavarapu, M., Timmis, K. N., Pieper, D. H.: J. Biol. Chem. 270, 29229 (1995)
31. Pieper, D. H., Winkler, R., Sandermann, H.: Angew. Chem. 104, 60 (1992)
32. Cartwright, N. J., Cain, R. B.: Biochem. J. 71, 248 (1959)
33. Cartwright, N. J., Cain, R. B.: ibid. 73, 305 (1959)
34. Ke, Y. H., Gee, L. L., Durham, N. N.: J. Bacteriol. 77, 593 (1959)
35. Cain, R. B.: J. Gen. Microbiol. 42, 197 (1966)
36. Zeyer, J., Kearney, P. C.: J. Agric. Food Chem. 32, 238 (1984)
37. Zeyer, J., Kocher, H. P., Timmis, K. N.: Appl. Environ. Microbiol. 52, 334 (1986)
38. Spain, J. C., Gibson, D. T.: ibid. 57, 812 (1991)
39. Dickel, O., Knackmuss, H. J.: Arch. Microbiol. 157, 76 (1991)
40. Spanggord, R. J., Spain, J. C., Nishino, S. F., Mortelmans, K. E.: Appl. Environ. Microbiol. 57, 3200 (1991)
41. Haigler, B. E., Spain, J. C.: ibid. 59, 2239 (1993)
42. Nishino, S. F., Spain, J. C.: ibid. 59, 2520 (1993)
43. Hill, D. J., Phelps, T. J., Palumbo, A. V., White, D. C., Strandberg, G. W., Donaldson, T. L.: Appl. Biochem. Biotech. 21-22, 233 (1989)
44. Harkness, M. R., McDermott, J. B., Abramowicz, D. A., Salvo, J. J., Flanagan, W. P., Stephens, M. L., Mondello, F. J., May, R. J., Lobos, J. H., Carroll, K. M., Brennan, M. J., Bracco, A. A., Fish, K. M., Warner, G. L., Wilson, P. R., Dietrich, D. K., Lin, D. T., Morgan, C. B., Gately, W. L.: Science 259, 503 (1993)
45. Don, R. H., Pemberton, J. M.: J. Bacteriol. 145, 681 (1991)
46. Chatterjee, D. K., Chakrabarty, A. M.: ibid. 153, 532 (1983)
47. Weisshaar, M. P., Franklin, F. C. H., Reineke, W.: ibid. 169, 394 (1987)
48. van der Meer, J. R., van Neerven, A. R. W., de Vries, E. J., de Vos, W. M., Zehnder, A. J. B.: ibid. 173, 6 (1991)
49. Reineke, W., Knackmuss, H. J.: Nature 277, 285 (1978)
50. Latorre, J., Reineke, W., Knackmuss, H. J.: Arch. Microbiol. 140, 159 (1984)
51. Rubio, M. A., Engesser, K. H., Knackmuss, H. J.: ibid. 145, 116 (1986)
52. Oltmanns, R., Rast, H. G., Reineke, W.: Appl. Microbiol. Biotechnol. 28, 609 (1988)
53. Reineke, W., Wessels, S. W., Rubio, M. A., Latorre, J., Schwien, U., Schmidt, E., Schlömann, M., Knackmuss, H. J.: FEMS Microbiol. Lett. 14, 291 (1982)
54. Brinkmann, U., Reineke, W.: ibid. 96, 81 (1992)
55. Rojo, F., Pieper, D. H., Engesser, K. H., Knackmuss, H. J., Timmis, K. N.: Science 238, 1395 (1987)
56. Reineke, W., Knackmuss, H. J.: J. Bacteriol 142, 467 (1980)
57. Bartels, I., Knackmuss, H. J., Reineke, W.: Appl. Environ. Microbiol. 47, 500 (1984)
58. Jeenes, D. L., Reineke, W., Knackmuss, H. J., Williams, P. A.: J. Bacteriol. 150, 180 (1982)
59. Pieper, D. H., Engesser, K. H., Don, R. H., Timmis, K. N., Knackmuss, H. J.: FEMS Microbiol. Lett. 29, 63 (1985)
60. Pieper, D. H., Stadler-Fritzsche, K., Knackmuss, H. J., Engesser, K. H., Bruce, N. C., Cain, R. B.: Biochem. J. 271, 529 (1990)
61. Ahmed, M., Focht, D. D.: Can. J. Microbiol. 19, 47 (1973)
62. Bopp, L. H.: J. Ind. Microbiol. 1, 23 (1986)
63. Bedard, D. L., Wagner, R. E., Brennan, M. J., Haberl, M. L., Brown, J. F.: Appl. Environ. Microbiol. 53, 1094 (1987)
64. Furukawa, K., Hayase, N., Taira, K., Tomizuka, N.: J. Bacteriol. 171, 5467 (1989)
65. Ahmad, D., Masse, R., Sylvestre, M.: Gene 86, 53 (1990)
66. Sondossi, M., Sylvestre, M., Ahmad, D.: Appl. Environ. Microbiol. 55, 485 (1992)
67. Arensdorf, J. J., Focht, D. D.: ibid. 60, 2884 (1994)
68. Brunner, W., Sutherland, F. H., Focht, D. D.: J. Environ. Qual. 14, 324 (1985)
69. Havel, J., Reineke, W.: FEMS Microbiol. Lett. 78, 163 (1991)
70. Havel, J., Reineke, W.: Appl. Microbiol. Biotechnol. 38, 129 (1992)
71. Havel, J., Reineke, W.: FEMS Microbiol. Lett. 108, 211 (1993)
72. Adams, R. H., Huang, C. M., Higson, F. K., Brenner, V., Focht, D. D.: Appl. Environ. Microbiol. 58, 647 (1992)
73. Hickey, W. J., Brenner, V., Focht, D. D.: FEMS Microbiol. Lett. 98, 175 (1992)
74. Hickey, W. J., Searles, D. B., Focht, D. D.: Appl. Environ. Microbiol. 59, 1194 (1993)
75. Wittich, R. M., Wilkes, H., Sinnwell, V., Francke, W., Fortnagel, P.: ibid. 58, 1005 (1992)
76. Wilkes, H., Wittich, R. M., Timmis, K. N., Fortnagel, P., Francke, W.: Appl. Environm. Microbiol. 62, 367 (1996)
77. Happe, B., Wittich, R. M., Timmis, K. N.: unpublished
78. Asturias, J. A., Timmis, K. N.: J. Bacteriol. 175, 4631 (1993)
79. Harayama, S., Wasserfallen, A., Cerdan, P., Rekik, M.: Pseudomonas - Molecular Biology and Biotechnology, p. 223. New York: Am. Soc. Microbiol. 1992
80. Cerdan, P., Wasserfallen, A., Rekik, M., Timmis, K. N., Harayama, S.: J. Bacteriol. 176, 6074 (1994)
81. Han, S., Eltis, L. D., Timmis, K. N., Muchmore, S. W., Bolin, J. T.: Science 270, 976 (1995)
82. Pieper, D. H., Blasco, R., Wittich, R. M., Megharaj, M., Fock, U., Prucha, M., Seeger, M., Hofer, B., Timmis, K. N.: Microbes, Environment, Biotechnology. The year of Louis Pasteur international symposia 85 (1995)
83. Vollmer, P. D., Fischer, P., Knackmuss, H. J., Schlömann, M.: J. Bacteriol. 176, 4366 (1994)
84. Lehrbach, P. R., Zeyer, J., Reineke, W., Knackmuss, H. J., Timmis, K. N.: ibid. 158, 1025 (1984)
85. Groenewegen, P. E. J., Breeuwer, P., van Helvoort, J. M. L. M., Langenhoff, A. A. M., de Vries, P. P., de Bont, J. A. M.: J. Gen. Microbiol. 138, 1599 (1992)
86. Haigler, B. E., Wallace, W. H., Spain, J. C.: Appl. Environ. Microbiol. 60, 3466 (1994)
87. Delgado, A., Wubbolts, M. G., Abril, M. A., Ramos, J. L.: ibid. 58, 415 (1992)
88. Delgado, A., Ramos, J. L.: J. Biol. Chem. 269, 8059 (1994)
89. Robertson, J. B., Spain, J. C., Haddock, J. D., Gibson, D. T.: Appl. Environ. Microbiol. 58, 2643 (1992)
90. Fock, U., Timmis, K. N., Pieper, D. H.: unpublished
91. Fetzner, S., Müller, R., Lingens, F.: Biol. Chem. Hoppe-Seyler 370, 1173 (1989)
92. Nadeau, L. J., Spain, J. C.: Appl. Environ. Microbiol. 61, 840 (1995)
93. Ramos, J. L., Haidour, A., Delgado, A., Duque, E., Fandila, M. D., Gil, M., Pinar, G.: (in press)
94. Duque, E., Haidour, A., Gogoy, F., Ramos, J. L.: J. Bacteriol. 175, 2278 (1993)
95. Vorbeck, C., Lenke, H., Fischer, P., Knackmuss, H. J.: ibid. 176, 932 (1994)
96. Duque, E., Ramos, J. L.: unpublished
97. Dorn, E., Hellwig, M., Reineke, W., Knackmuss, H. J.: Arch. Microbiol. 99, 61 (1974)
98. Wagner-Döbler, I., Pipke, R., Timmis, K. N., Dwyer, D. F.: Appl. Environ. Microbiol. 58, 1249 (1992)
99. Pipke, R., Wagner-Döbler, I., Timmis, K. N., Dwyer, D. F.: ibid. 58, 1259 (1992)
100. Nüßlein, K., Maris, D., Timmis, K. N., Dwyer, D. K. N., Dwyer, D. F.: ibid. 58, 3380 (1992)
101. Heuer, H., Dwyer, D. F., Timmis, K. M., Wagner-Döbler, I.: Microb. Ecol. 29, 203 (1995)
102. Krumme, M. L., Smith, R. L., Thiem, S. M., Egestorff, J. T., Tiedje, J. M., Timmis, K. N., Dwyer, D. F.: Environ. Sci. Tech. 28, 1134 (1994)
103. Sylvestre, M., Masse, R., Ayotte, C., Messier, F., Fauteux, J.: Appl. Microbiol. Biotechnol. 21, 192 (1985)
104. Hiramoto, M., Ohtake, H., Toda, K.: J. Ferment. Bioeng. 68, 68 (1989)
105. Fava, F., Marchetti, L.: Appl. Microbiol. Biotechnol. 36, 240 (1991)
106. Nörtemann, B., Baumgarten, J., Rast, H. G., Knackmuss, H. J.: Appl. Environ. Microbiol. 52, 1195 (1986)
107. Diekmann, R., Hempel, D. C.: Appl. Microbiol. Biotechnol. 32, 113 (1989)
108. Levy, S. B., Marshall, B. M.: Gene Transfer in the Environment, p. 61. New York: McGraw-Hill 1988
109. De Lorenzo, V., Timmis, K. N.: Pseudomonas - Molecular Biology and Biotechnology, p. 415. New York: Am. Soc. Microbiol. 1992
110. Herrero, M., De Lorenzo, V., Timmis, K. N.: J. Bacteriol. 172, 6557 (1990)
111. De Lorenzo, V., Herrero, M., Jakubzik, U., Timmis, K. N.: ibid. 172, 6568 (1990)
112. De Lorenzo, V.: unpublished
113. Kristensen, C. S., Eberl, L., Sanchez-Romero, J. M., Givskov, M., Molin, S., de Lorenzo, V.: J. Bacteriol. 177, 52 (1995)
114. Ramos, J. L., Stolz, A., Reineke, W., Timmis, K. N.: Proc. Nat. Acad. Sci. USA 83, 8467 (1986)
115. Mermod, N., Ramos, J. L., Lehrbach, P. R., Timmis, K. N.: J. Bacteriol. 167, 447 (1986)
116. Ramos, J. L., Gonzales-Carrero, M., Timmis, K. N.: FEBS Lett. 226, 241 (1988)
117. De Lorenzo, V., Fernandez, S., Herrero, M., Jakubzik, U., Timmis, K. N.: Gene 130, 41 (1993)
118. Ramos, J. L., Diaz, E., Dowling, D., de Lorenzo, V., Molin, S., O'Gara, F., Ramos, C., Timmis, K. N.: Bio/Technology 12, 1349 (1994)
119. Gibson, D. T., Koch, J. R., Kallo, R. E.: Biochemistry 7, 2653 (1968)
120. Worsey, M. J., Williams, P. A.: J. Bacteriol. 123, 7 (1975)
121. Reineke, W., Knackmuss, H. J.: Biochim. Biophys. Acta 542, 412 (1978)
122. Reineke, W., Knackmuss, H. J.: ibid. 542, 424 (1978)
123. Hesp, B., Calvin, M., Hosokavva, K.: J. Biol. Chem. 244, 5644 (1969)