Tiggers and other DNA transposon fossils in the human genome

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America

Volumn 93, Issue 4, 1996, Pages 1443-1448

  Smit, Arian F A ^a,b   Riggs, Arthur D ^a  

^a CITY OF HOPE NATIONAL MEDICAL CENTER   (United States)

^b UNIVERSITY OF WASHINGTON   (United States)

Author keywords

centromere protein CENP B; interspersed repeats; mariner; pogo; Tc1

Indexed keywords

ARTICLE; DNA SEQUENCE; DNA TRANSPOSITION; DROSOPHILA; FOSSIL; HUMAN; MEDICAL GENETICS; NONHUMAN; PRIORITY JOURNAL; TRANSPOSON;

EID: 0029991222     PISSN: 00278424     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1073/pnas.93.4.1443     Document Type: Article

References (58)

1. Deininger, P. L. & Batzer, M. A. (1993) in Evolutionary Biology, eds. Hecht, M. K., Maclntyre, R. J. & Clegg, M. T. (Plenum, New York), Vol. 27, pp. 157-196.
2. Smit, A. F. A. & Riggs, A. D. (1995) Nucleic Acids Res. 23, 98-102.
3. Hutchison, C. A., III, Hardies, S. C., Loeb, D. D., Shehee, W. R. & Edgell, M. H. (1989) in MobileDNA, eds. Berg, D. E. & Howe, M. M. (Am. Soc. Microbiol., Washington, DC), pp. 593-617.
4. Smit, A. F. A., Tóth, G., Riggs, A. D. & Jurka, J. (1995) J. Mol. Biol. 246, 401-417.
5. Paulson, K. E., Deka, N., Schmid, C. W., Misra, R., Schindler, C. W., Rush, M. G., Kadyk, L. & Leinwand, L. (1985) Nature (London) 316, 359-361.
6. Smit, A. F. A. (1993) Nucleic Acids Res. 21, 1863-1872.
7. Wilkinson, D. A., Mager, D. L. & Leong, J. C. (1994) in The Retroviridae, ed. Levy, J. A. (Plenum, New York), Vol. 3, pp. 465-535.
8. Mizuuchi, K. (1992) Annu. Rev. Biochem. 61, 1011-1051.
9. Van Luenen, H. G. A. M., Colloms, S. D. & Plasterk, R. H. A. (1994) Cell 79, 293-301.
10. Calvi, B. R., Hong, T. J., Findley, S. D. & Gelbart, W. M. (1991) Cell 66, 465-471.
11. Henikoff, S. (1992) New Biol. 4, 382-388.
12. Doak, T. G., Doerder, F. P., Jahn, C. L. & Herrick, G. (1994) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91, 942-946.
13. Chen, J., Greenblatt, I. M. & Dellaporta, S. L. (1992) Genetics 130, 665-676.
14. Engels, W. R., Johnson Schlitz, D. M., Eggleston, W. B. & Sved, J. (1990) Cell 62, 515-525.
15. Carroll, D., Knutzon, D. S. & Garrett, J. E. (1989) in Mobile DNA, eds. Berg, D. E. & Howe, M. M. (Am. Soc. Microbiol., Washington, DC), pp. 567-574.
16. Ünsal, K. & Morgan, G. T. (1995) J. Mol. Biol. 248, 812-823.
17. Fedoroff, N. V. (1989) in Mobile DNA, eds. Berg, D. E. & Howe, M. M. (Am. Soc. Microbiol., Washington, DC), pp. 375-411.
18. Bureau, T. E. & Wessler, S. R. (1992) Plant Cell 4, 1283-1294.
19. Jurka, J. (1990) Nucleic Acids Res. 18, 137-141.
20. Kaplan, D. J., Jurka, J., Solus, J. F. & Duncan, C. H. (1991) Nucleic Acids Res. 19, 4731-4738.
21. Jurka, J., Kaplan, D. J., Duncan, C. H., Walichiewicz, J., Milosavljevic, A., Murali, G. & Solus, J. F. (1993) Nucleic Acids Res. 21, 1273-1279.
22. Iris, F. J., Bougueleret, L., Prieur, S., Caterina, D., Primas, G., et al. (1993) Nat. Genet. 3, 137-145.
23. Altschul, S. F., Gish, W., Miller, W., Myers, E. W. & Lipman, D. J. (1990) J. Mol. Biol. 215, 403-410.
24. Wilbur, W. J. & Lipman, D. J. (1983) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 80, 726-730.
25. Thompson, J. D., Higgins, D. G. & Gibson, T. J. (1994) Nucleic Acids Res. 22, 4673-4680.
26. Gribskov, M., McLachlan, A. D. & Eisenberg, D. (1987) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 84, 4355-4358.
27. Lutfalla, G., McInnis, M. G., Antonarakis, S. E. & Uze, G. (1995) J. Mol. Evol. 41, 338-344.
28. Streck, R. D., MacGaffey, J. E. & Beckendorf, S. K. (1986) EMBO J. 5, 3615-3623.
29. Tudor, M., Lobocka, M., Goodell, M., Pettitt, J. & O'Hare. K. (1992) Mol. Gen. Genet. 232, 126-134.
30. Bureau, T. E. & Wessler, S. R. (1994) Plant Cell 6, 907-916.
31. Li, W. & Shaw, J. E. (1993) Nucleic Acids Res. 21, 59-67.
32. Yuan, J. Y., Finney, M., Tsung, N. & Horvitz, H. R. (1991) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88, 3334-3338.
33. O'Hare, K. & Rubin, G. M. (1983) Cell 34, 25-35.
34. Deininger, P. L., Batzer, M. A., Hutchison, C. A. & Edgell, M. H. (1992) Trends Genet. 8, 307-311.
35. Deen, P. M., Terwel, D., Bussemakers, M. J., Roubos, E. W. & Martens, G. J. (1991) Eur. J. Biochem. 201, 129-137.
36. Koike, T., Inohara, N., Sato, I., Tamada, T., Kagawa, Y. & Ohta, S. (1994) Biochem. Biophys. Res. Commun. 202, 225-233.
37. Wilson, R., Ainscough, R., Anderson, K., Baynes, C., Berks, M., et al. (1994) Nature (London) 368, 32-38.
38. Warren, W. D., Atkinson, P. W. & O'Brochta, D. A. (1994) Genet. Res. 64, 87-97.
39. Radice, A. D., Bugaj, B., Fitch, D. H. & Emmons, S. W. (1994) Mol. Gen. Genet. 244, 606-612.
40. Smit, A. F. A. (1995) Dissertation (Univ. of Southern Calif., Los Angeles).
41. Robertson, H. M. (1993) Nature (London) 362, 241-245.
42. Sullivan, K. F. & Glass, C. A. (1991) Chromosoma 100, 360-370
43. Ruvolo, V., Hill, J. E. & Levitt, A. (1992) DNA Cell Biol. 11, 111-122.
44. Milne, A. A. (1928) The House at Pooh Corner (Sutton, New York).
45. Daboussi, M. J., Langin, T. & Brygoo, Y. (1992) Mol. Gen. Genet 232, 12-16.
46. Kachroo, P., Leong, S. A. & Chattoo, B. B. (1994) Mol. Gen. Genet. 245, 339-348.
47. Collins, J. J. & Anderson, P. (1994) Genetics 137, 771-781.
48. Polard, P. & Chandler, M. (1995) Mol. Microbiol. 15, 13-23
49. Hohmann, S. (1993) Mol. Gen. Genet. 241, 657-666.
50. Earnshaw, W. C., Sullivan, K. F., Machlin, P. S., Cooke, C. A., Kaiser, D. A., Pollard, T. D., Rothfield, N. F. & Cleveland, D. W. (1987) J. Cell. Biol. 104, 817-829.
51. Kitagawa, K., Masumoto, H., Ikeda, M. & Okazaki, T. (1995) Mol. Cell. Biol. 15, 1602-1612.
52. Pluta, A. F., Saitoh, N., Goldberg, I. & Earnshaw, W. C. (1992) J. Cell Biol. 116, 1081-1093.
53. Sugimoto, K., Hagishita, Y. & Himeno, M. (1994) J. Biol. Chem. 269, 24271-24276.
54. Colloms, S. D., Van Luenen, H. G. & Plasterk, R. H. (1994) Nucleic Acids Res. 22, 5548-5554.
55. Vos, J. C. & Plasterk, R. H. A. (1994) EMBO J. 13, 6125-6132.
56. Auge-Gouillou, C., Bigot, Y., Pollet, N., Hamelin, M. H., Meunier-Rotival, M. & Periquet, G. (1995) FEBS Lett. 368, 541-546.
57. Oosumi, T., Belknap, W. R. & Garlick, B. (1995) Nature (London) 378, 672.
58. Morgan, G. T. (1995) J. Mol. Biol. 254, in press.