Evidence for a proximal histidine interaction in the structure of cytochromes c' in solution: A resonance Raman study

Biochemistry

Volumn 35, Issue 28, 1996, Pages 9224-9234

  Othman, Samya ^a   Richaud, Pierre ^b   Verméglio, André ^b   Desbois, Alain ^a  

^a CENTRE D ETUDES DE SACLAY   (France)

^b Centre d'Etudes de Cadarache   (France)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CYTOCHROME C; HISTIDINE;

ARTICLE; DENITRIFICATION; NONHUMAN; PHOTOSYNTHESIS; PHOTOTROPHIC BACTERIUM; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN PURIFICATION; RAMAN SPECTROMETRY; RHODOBACTER SPHAEROIDES; RHODOSPIRILLUM; SEQUENCE ANALYSIS;

AMINO ACID SEQUENCE; BINDING SITES; CYTOCHROME C GROUP; HEME; HISTIDINE; HYDROGEN BONDING; MOLECULAR SEQUENCE DATA; OXIDATION-REDUCTION; RHODOBACTER SPHAEROIDES; RHODOSPIRILLUM; SPECTRUM ANALYSIS, RAMAN;

EID: 0029942847     PISSN: 00062960     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/bi952818g     Document Type: Article

References (90)

1. Alden, R. G., Crawford, B. A., Doolen, R., Ondrias, M. R., & Shelmitt, J. A. (1989) J. Am. Chem. Soc. 111, 2070-2072.
2. Ambler, R. P., Bartsch, R. G., Daniel, M., Kamen, M. D., McLellan, L., Meyer, T. E., & Van Beeumen, J. (1981) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 11, 6854-6857.
3. Argade, P., Sassaroli, M., Rousseau, D. L., Inubushi, T., Ikeda-Saito, M., & Lapidot, A. (1984) J. Am. Chem. Soc. 106, 6593-6596.
4. Banci, L., Bertini, I., Turano, P., & Vicens Oliver, M. (1992) Eur. J. Biochem. 204, 107-112.
5. Bangcharoenpaurpong, O., Schomacker, K. T., & Champion, P. M. (1984) J. Am. Chem. Soc. 106, 5688-5698.
6. Barakat, R., & Strekas, T. C. (1982) Biochim. Biophys. Acta 679, 393-399.
7. Bertini, I., Briganti, F., Monnanni, R., Scozzafava, A., Carlozzi, P., & Materassi, R. (1990) Arch. Biochem. Biophys. 282, 84-90.
8. Bolognesi, M., Onesti, S., Gatti, G., Coda, A., Ascenzi, P., & Brunori, M. (1989) J. Mol. Biol. 205, 529-544.
9. Dasgupta, S., Rousseau, D. L., Anni, H., & Yonetani, T. (1989) J. Biol. Chem. 264, 654-662.
10. Desbois, A. (1994) Biochimie 76, 694-707.
11. Desbois, A., & Lutz, M. (1981) Biochim. Biophys. Acta 671, 168-176.
12. Desbois. A., & Lutz, M. (1992) Eur. Biophys. J. 20, 321-335.
13. Desbois, A., Lutz, M., & Banerjee, R. (1981) Biochim. Biophys. Acta 671, 177-183.
14. Desbois, A., Henry, Y., & Lutz, M. (1984a) Biochim. Biophys. Acta 785, 148-160.
15. Desbois, A., Mazza, G., Stetzkowski, F., & Lutz, M. (1984b) Biochim. Biophys. Acta 785, 161-176.
16. Dolphin, D. H., Sams, J. R., & Tsin, T. B. (1977) Inorg. Chem. 16, 711-713.
17. Ehrenberg, A., & Kamen, M. D. (1965) Biochim. Biophys. Acta 102, 333-340.
18. Emptage, M. H., Xavier, A. V., Wood, J. M., Alsaadi, B. M., Moore, G. R., Pitt, R. C., Williams, R. J. P., Ambler, R. P., & Bartsch, R. G. (1981) Biochemistry 20, 58-64.
19. Evangelista-Kirkup, R., Crisanti, M., Poulos, T. L., & Spiro, T. G. (1985) FEBS Lett. 190, 221-226.
20. Evans, S. V., & Brayer, G. D. (1990) J. Mol. Biol. 213, 885-897.
21. Finzel, B. C., Poulos, T. L., & Kraut, J. (1984) J. Biol. Chem. 259, 13027-13036.
22. Finzel, B. C., Weber, P. C., Hardman, K. D., & Salemme, F. R. (1985) J. Mol. Biol. 186, 627-643.
23. Gemeroth, L. (1993) Doctoral Thesis, Max Planck Institute, University of Frankfurt, Frankfurt, Germany.
24. Hashimoto, S., Teraoka, J., Inubushi, T., Yonetani, T., & Kitagawa, T. (1986) J. Biol. Chem. 261, 11110-11118.
25. Hoard, J. L. (1985) in Porphyrins and Metalloporphyrins (Smith, K. M., Ed.) pp 317-380, Elsevier, Amsterdam.
26. Hobbs, J. D., Larsen, R. W., Meyer, T. E., Hazzard, J. H., Cusanovich, M. A., & Ondrias, M. R. (1990) Biochemistry 29, 4166-4174.
27. Hori, H., & Kitagawa, T. (1980) J. Am. Chem. Soc. 102, 3608-3613.
28. Horio, T., & Kamen, M. D. (1961) Biochim. Biophys. Acta 48, 266-286.
29. Hu, S., Morris, I. K., Singh, J. P., Smith, K. M., & Spiro, T. G. (1993) J. Am. Chem. Soc. 115, 12446-12458.
30. Imai, Y., Imai, K., Sato, R., & Horio, T. (1969a) J. Biochem. 65, 225-237.
31. Imai, Y., Imai, K., Ikeda, K., Hamaguchi, K., & Horio, T. (1969b) J. Biochem. 65, 629-637.
32. Jameson, G. B., Molinaro, F. S., Ibers, J. A., Collman, J. P., Brauman, J. I., Rose, E., & Suslick, K. S. (1980) J. Am. Chem. Soc. 102, 3224-3237.
33. Kamen, M. D., & Horio, T. (1970) Annu. Reu. Biochem. 39, 673-700.
34. Kitagawa, T. (1988) in Biological Applications of Roman Spectroscopy (Spiro, T. G., Ed.) Vol. 3, pp 97-131, Wiley, New York.
35. Kitagawa, T., & Ozaki, Y. (1987) Struct. Bonding (Berlin) 64, 71-114.
36. Kitagawa, T., Ozaki, Y., Kyogoku, Y., & Horio, T. (1979) Biochim. Biophys. Acta 495, 1-11.
37. Korszun, Z. R., Bunker, G., Khalid, S., Scheidt, W. R., Cusanovich, M. A., & Meyer, T. E. (1989) Biochemistry 28, 1515-1517.
38. Kuila, D., Tien, M., Fee, J. A., & Ondrias, M. R. (1985) Biochemistry 24, 3394-3397.
39. Kunishima, N., Fukuyama, K., Matsubara, H., Hatanaka, H., Shibano, Y., & Amachi, T. (1994) J. Mol. Biol. 235, 331-344.
40. La Mar, G. N., Jackson, J. T., Dugad, L. B., Cusanovich, M. A., & Bartsch, R. G. (1990) J. Biol. Chem. 265, 16173-16180.
41. Maltempo, M. M. (1974) J. Chem. Phys. 61, 2540-2547.
42. Maltempo, M. M., & Moss, T. H. (1976) Q. Rev. Biophys. 9, 181-215.
43. Maltempo, M. M., Ohlsson, P.-I., Paul, K.-G., Petterson, L., & Ehrenberg, A. (1979) Biochemistry 18, 2935-2941.
44. McGourty, J. L., La Mar, G. N., Smith, K. M., Ascoli, F., Chiancone, E., Pandey, R. K., & Singh, J. P. (1989) Eur. J. Biochem. 184, 53-61.
45. Meyer, T. E., & Kamen, M. D. (1982) Adv. Protein Chem. 35, 105-212.
46. Meyer, T. E., & Cusanovich, M. A. (1985) Biochim. Biophys. Acta 807, 308-319.
47. Momenteau, M., Scheidt, W. R., Eigenbrot, C. W., & Reed, C. A. (1988) J. Am. Chem. Soc. 110, 1207-1215.
48. Monkara, F., Bingham, S. J., Kadir, F. H. A., McEwan, A. G., Thomson, A. J., Thurgood, A. G. P., & Moore, G. R. (1992) Biochim. Biophys. Acta 1100, 184-188.
49. Moore, G. R., & Pettigrew, G. W. (1990) in Cytochromes c: Evolutionary, Structural and Physicochemical Aspects, pp 27-253, Springer-Verlag, Berlin.
50. Moore, G. R., McClune, G. J., Clayden, N. J., Williams, R. J. P., Alsaadi, B. M., Ångström, J., Ambler, R. P., Van Beeumen, J., Tempst, P., Bartsch, R. G., Meyer, T. E., & Kamen, M. D. (1982) Eur. J. Biochem. 123, 73-80.
51. Moore, G. R., Williams, R. J. P., Peterson, J., Thomson, A. J., & Mathews, F. S. (1985) Biochim. Biophys. Acta 829, 83-96.
52. Morais, J., Palma, P. N., Frazao, C., Caldeira, J., LeGall, J., Moura, I., Moura, J. J. G., & Carrondo, M. A. (1995) Biochemistry 34, 12830-12841.
53. Moss, T. H., Bearden, A. J., Bartsch, R. G., & Cusanovich, M. A. (1968) Biochemistry 7, 1583-1590.
54. Mylrajan, M., Valli, K., Wariishi, H., Gold, M. H., & Loehr, T. M. (1990) Biochemistry 29, 9617-9623.
55. Nagai, K., Kitagawa, T., & Morimoto, H. (1980) J. Mol. Biol. 136, 271-289.
56. Oldfieid, T. J., Smerdon, S. J., Dauter, Z., Petratos, K., Wilson, K. S., & Wilkinson, A. J. (1992) Biochemistry 31, 8732-8739.
57. Ondrias, M. R., Rousseau, D. L., Shelnutt, J. A., & Simon, S. R. (1982) Biochemistry 21, 3428-3437.
58. Othman, S. (1994) Doctoral Thesis, University of Paris XI-Orsay, Orsay, France.
59. Othman, S., Le Lirzin, A., & Desbois, A. (1993) Biochemistry 32, 9781-9791.
60. Othman, S., Le Lirzin, A., & Desbois, A. (1994) Biochemistry 33, 15437-15448.
61. Petersen, J. F. W., Kadziola, A., & Larsen, S. (1994) FEBS Lett. 339, 291-296.
62. Poulos, T. L., Edwards, S. L., Wariishi, H., & Gold, M. H. (1993) J. Biol. Chem. 268, 4429-4440.
63. Rawlings, J., Stephens, P. J., Nafie, L. A., & Kamen, M. D. (1977) Biochemistry 16, 1725-1729.
64. Ren, Z., Meyer, T., & McRee, D. E. (1993) J. Mol. Biol. 234, 433-445.
65. Richardson, J. S., & Richardson, D. C (1989) in Prediction of Protein Structure and the Principles of Protein Conformation (Fasman, G. D., Ed.) pp 1-98, Plenum Press, New York.
66. Scheidt, W. R., & Gouterman, M. (1983) in Iron Porphyrins (Lever, A. B. P., & Gray, H. B., Eds.) part I, pp 89-139, Addison-Wesley, London.
67. Scheidt, W. R., Geiger, D. K., Lee, Y. J., Reed, C. A., & Lang, G. (1985) J. Am. Chem. Soc. 107, 5693-5699.
68. Scheidt, W. R., Osvath, S. R., & Lee, Y. J. (1987) J. Am. Chem. Soc. 109, 1958-1963.
69. Shelnutt, J. A., Medforth, C. J., Berber, M. D., Barkigia, K. M., & Smith, K. M. (1991) J. Am. Chem. Soc. 113, 4077-4087.
70. Smulevich, G., Mauro, J. M., Fishel, L. A., English, A. M., Kraut, J., & Spiro, T. G. (1988) Biochemistry 27, 5477-5485.
71. Smulevich, G., Paoli, M., Burke, J. F., Sanders, S. A., Thorneley, R. N. F., & Smith, A. T. (1994a) Biochemistry 33, 7398-7407.
72. Smulevich, G., Feis, A., Focardi, C., Tams, J., & Welinder, K. G. (1994b) Biochemistry 33, 15425-15432.
73. Song, S., Boffi, A., Chiancone, E., & Rousseau, D. L. (1993) Biochemistry 32, 6330-6336.
74. Spiro, T. G. (1983) in Iron Porphyrins (Lever, A. B. P., & Gray, H. B., Eds.) part II, pp 89-159, Addison-Wesley, London.
75. Spiro, T. G., & Burke, J. M. (1976) J. Am. Chem. Soc. 98, 5482-5489.
76. Spiro, T. G., & Li, X.-Y. (1988) in Biological Applications of Roman Spectroscopy (Spiro, T. G., Ed.) Vol. 3, pp 1-37, Wiley, New York.
77. Stavrov, S. S. (1993) Biophys. J. 65, 1942-1950.
78. Stein, P., Mitchell, M., & Spiro, T. G. (1980) J. Am. Chem. Soc. 102, 7795-7797.
79. Stockburger, M., Alshuth, T., Oesterhelt, D., & Gärtner, W. (1986) in Spectroscopy of Biological Systems (Clark, R. J. H., & Hester, R. E., Eds.) pp 483-535, Wiley & Sons, Chichester.
80. Strekas, T. C., & Spiro, T. G. (1974) Biochim. Biophys. Acta 351, 237-245.
81. Sundberg, R. J., & Martin, R. B. (1974) Chem. Rev. 74, 471-517.
82. Takano, T., & Dickerson, R. E. (1981) J. Mol. Biol. 153, 79-94.
83. Teraoka, J., & Kitagawa, T. (1980) J. Phys. Chem. 84, 1928-1935.
84. Teraoka, J., & Kitagawa, T. (1981) J. Biol. Chem. 256, 3969-3977.
85. Weber, P. C. (1982) Biochemistry 421, 5116-5119.
86. Weber, P. C., Howard, A., Xuong, N. H., & Salemme, F. R. (1981) J. Mol. Biol. 153, 399-424.
87. Yamamoto, Y., Nanai, N., Chûjô, R., & Suzuki, T. (1990) FEBS Lett. 264, 113-116.
88. Yamanaka, T. (1992) in The Biochemistry of Bacterial Cytochromes, pp 89-168, Japan Scientific Societies Press, Tokyo.
89. Yasui, M., Harada, S., Kai, Y., & Kasai, N. (1984) J. Mol. Biol. 177, 845-846.
90. Yasui, M., Harada, S., Kai, Y., Kasai, N., Kusunoki, M., & Matsuura, Y. (1992) J. Biochem. 111, 317-327.