Assignment of 15N, 13C(α), 13C(β), and HN resonances in an 15N,13C,2H labeled 64 kDa trp repressor-operator complex using triple-resonance NMR spectroscopy and 2H-decoupling

Journal of the American Chemical Society

Volumn 118, Issue 28, 1996, Pages 6570-6579

  Shan, Xi ^a   Gardner, Kevin H ^b   Muhandiram, D R ^b   Rao, N S ^b   Arrowsmith, Cheryl H ^a   Kay, Lewis E ^b  

^a UNIVERSITY OF TORONTO   (Canada)

^b UNIVERSITY OF TORONTO   (Canada)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DNA; REPRESSOR PROTEIN;

ARTICLE; COMPLEX FORMATION; ESCHERICHIA COLI; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE; OPERATOR GENE; REPRESSOR GENE;

EID: 0029934934     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja960627a     Document Type: Article

References (57)

1. Zhang, H.; Zhao, D.; Revington, M.; Lee, W.; Jia, X.; Arrowsmith, C. H.; Jardetzky, O. J. Mol. Biol. 1994, 229, 735.
2. Grzesiek, S.; Anglister, J.; Ren, H.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 4369.
3. Kushlan, D. M.; LeMaster, D. M. J. Biomol. NMR 1993, 3, 701.
4. Yamazaki, T.; Lee, W.; Revington, M.; Mattiello, D. L.; Dahlquist, F. W.; Arrowsmith, C. H. Kay, L. E. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 6464.
5. Yamazaki, T.; Lee, W.; Arrowsmith, C. H.; Muhandiram, D. R.; Kay, L. E. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 11655.
6. Nietlispach, D.; Clowes, R. T.; Broadhurst, R. W.; Ito, Y.; Keeler, J.; Kelly, M.; Ashurst, J.; Oschkinat, H.; Domaille, P. J.; Laue, E. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 407.
7. Venters, R. A.; Huang, C. C.; Farmer, B. T., II; Trolard, R.; Spicer, L. D.; Fierke. C. A. J. Biomol. NMR. 1995, 5, 339.
8. Farmer, B. T., II; Venters, R. A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 4187.
9. Zhou, M. M.; Ravichandran, K. S.; Olejniczak, E. T.; Petros, A. M.; Meadows, R. P.; Sattler, M.; Harlan, J. E.; Wades, W. S.; Burakoff, S. J.; Fesik, S. W. Nature 1995, 378, 584.
10. Crespi, H. L.; Rosenberg, R. M.; Katz, J. J. Science 1968, 161, 795.
11. Markley, J. L.; Putter, I.; Jardetzky, O. Science 1968, 161, 1249.
12. LeMaster, D. M.; Richards, F. M. Biochemistry 1988, 27, 142.
13. Torchia, D. A.; Sparks, S. W.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1988, 110, 2320.
14. Venters, R. A.; Metzler, W. J.; Spicer, L. D.; Mueller, L.; Farmer, B. T., II. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 9592.
15. Grzesiek, S.; Wingfield, P.; Stahl, S.; Kaufman, J. D.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 9594.
16. Arrowsmith, C. H.; Pachter, R.; Altman, R. B.; Iyer, S. B.; Jardetzky, O. Biochemistry 1990, 29, 6332.
17. Kumamoto, A.; Miller, W.; Gunsalus, R. Genes Dev. 1987, 1, 556.
18. Liu, Y. C.; Matthews, K. S. J. Biol. Chem. 1993, 268, 23239.
19. Yang, J.; Gunasekera, A.; Lavoi, T. A.; Jin, L.; Lewis, D. E. A.; Carey, J. J. Mol. Biol. 1996, in press.
20. Lawson, C. L.; Carey, J. Nature 1993, 366, 178.
21. Cavanagh, J.; Palmer, A. G.; Wright, P. E.; Rance, M. J. Magn. Reson. 1991, 91, 429.
22. Palmer, A. G.; Cavanagh, Wright, P. E. Rance, M. J. Magn. Reson. 1991, 93, 151.
23. Kay, L. E.; Keiffer, P.; Saarinen, T. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 10663.
24. Schleucher, J.; Sattler, M.; Griesinger, C. Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1993, 10, 32.
25. Muhandiram, D. R.; Kay, L. E. J. Magn. Reson. B 1994, 103, 203.
26. Kay, L. E.; Ikura, M.; Tschudin, R.; Bax, A. J. Magn. Reson. 1990, 89, 496.
27. Paluh, J. L.; Yanofsky, C. Nucleic Acids Res. 1986, 14, 7851.
28. Marmostein, R. Q.; Joachimiak, A.; Sprinzl, M.; Sigler, P. B. J. Biol. Chem. 1987, 262, 4922.
29. Delaglio, F.; Grzesiek, S.; Vuister, G. W.; Zhu, G.; Pfeifer, J.; Bax, A. J. Biomol. NMR 1995, 6, 277.
30. Garrett, D. S.; Powers, R.; Gronenborn, A. M.; Clore, G. M. J. Magn. Reson. 1991, 95, 214.
31. Marion, D.; Ikura, M.; Bax, A. J. Magn. Reson. 1989, 84, 425.
32. Zhu, G.; Bax, A. J. Magn. Reson. 1990, 90, 405.
33. Pascal, S. M.; Singer, A. U.; Gish, G.; Yamazaki, T.; Shoelson, S. E.; Pawson, T.; Kay, L. E.; Forman-Kay, J. D. Cell 1994, 77, 461.
34. Kay, L. E.; Xu, G. Y.; Yamazaki, T. J. Magn. Reson. A 1994, 109, 129.
35. Grzesiek, S.; Bax, A. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 12593.
36. Stonehouse, J.; Shaw, G., L.; Keeler, J.; Laue, E. J. Magn. Reson. A. 1994, 107, 178.
37. Farrow, N. A.; Muhandiram, D. R.; Singer, A. U.; Pascal, S. M.; Kay, C. M.; Gish, G.; Shoelson, S. E.; Pawson, T.; Forman-Kay, J. D.; Kay, L. E. Biochemistry 1992, 33, 5984.
38. Santoro, J.; King, G. C. J. Magn. Reson. 1992, 97, 202.
39. Vuister, G. W.; Bax, A. J. Magn. Reson. 1993, 101, 201.
40. Bax, A.; Pochapsky, S. J. Magn. Reson. 1992, 99, 638.
41. Muhandiram, D. R.; Yamazaki, T.; Sykes, B. D.; Kay, L. E. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 11536.
42. Emsley, L.; Bodenhausen G. Chem. Phys. Lett. 1987, 165, 469.
43. Grzesiek, S.; Bax, A. J. Biomol. NMR 1993, 3, 185.
44. Tashiro, M.; Rios, C. B.; Montelione, G. T. J. Biomol. NMR 1995, 6, 211.
45. States, D. J.; Haberkorn, R. A.; Ruben, D. J. J. Magn. Reson. 1982, 48, 286.
46. Marion, D.; Wuthrich, K. Biochem. Biophys., Res. Commun. 1983, 113, 967.
47. Zar, Z. H. Biostatistical Analysis, 2nd ed., Prentice-Hall: Englewood Cliffs, NJ. 1984.
48. Morris, G. A.; Freeman, R. J. Am. Chem. Soc. 1979, 101, 760.
49. Shaka, A. J.; Keeler, J.; Frenkiel, T.; Freeman, R. J. Magn. Reson. 1983, 52, 335.
50. Kay, L. E. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 2055.
51. McCoy, M.; Mueller, L. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 2108.
52. Boyd, J.; Scoffe, N. J. Magn. Reson. 1989, 85, 406.
53. Patt, S. L. J. Magn. Reson. 1992, 96, 94.
54. Geen, H.; Freeman R. J. Magn. Reson. 1991, 93, 93.
55. McCoy, M.; Mueller, L. J. Magn. Reson. 1992, 98, 674.
56. Marion, D.; Ikura, M.; Tschudin, R.; Bax, A. J. Magn. Reson. 1989, 85, 393.
57. Joachimiak, A.; Kelley, R. L.; Gunsalus, R. P.; Yanofsky, C.; Sigler, P. B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1983, 80, 668.