Modeling the tungsten sites of inactive and active forms of hyperthermophilic Pyrococcus furiosus aldehyde ferredoxin oxidoreductase

Journal of the American Chemical Society

Volumn 118, Issue 6, 1996, Pages 1387-1397

  Das, Samar K ^a   Biswas, Dulali ^a   Maiti, Rabindranath ^a   Sarkar, Sabyasachi ^a  

^a INDIAN INSTITUTE OF TECHNOLOGY KANPUR   (India)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

FERREDOXIN NICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE REDUCTASE; METALLOPROTEIN; OXIDOREDUCTASE; TUNGSTEN; UNCLASSIFIED DRUG;

ARTICLE; ENZYME ACTIVE SITE; ENZYME STRUCTURE; INFRARED SPECTROPHOTOMETRY; MASS SPECTROMETRY; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE; SPECTROPHOTOMETRY; THERMOPHILIC BACTERIUM;

EID: 0029928922     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja9511580     Document Type: Article

References (73)

1. Woeses, C. R.; Kandler, O.; Wheelis, M. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1990, 87, 4576.
2. (b) Stetter, K. O. Nature 1982, 300, 258.
3. (c) Stetter, K. O. In The Thermaphiles, General, Molecular andi Applied Microbiology: Brock, T. D., Ed.; John Wiles: New York, 1986: p 39.
4. (d) Kelly, R. M.; Demmine, J. N. Biotechnol. Prog. 1988, 4, 47.
5. (e) Stetter, K. O.; Fiala, G.; Huber, R.; Segerer, G. FEMS Microbiol. Rev. 1990, 75, 117.
6. (a) Bryant, F. O.; Adams, M. W. W. J. Biol. Chem. 1989, 264, 507.
7. (b) Mukund, S.; Adams, M. W. W. J. Biol. Chem. 1993, 268, 13592: 1990, 265, 11508: 1991, 266, 14208.
8. (b) Mukund, S.; Adams, M. W. W. J. Biol. Chem. 1993, 268, 13592: 1990, 265, 11508: 1991, 266, 14208.
9. (b) Mukund, S.; Adams, M. W. W. J. Biol. Chem. 1993, 268, 13592: 1990, 265, 11508: 1991, 266, 14208.
10. (c) Adams, M. W. W. Adv. Inorg. Chem. 1992, 38, 341.
11. (d) Adams, M. W. W. Annu. Rev. Microbiol. 1993, 47, 627.
12. (e) Adams, M. W. W. In Encyclopedia of Inorganic Chemistry; King, R. B., Ed.; John Wiley: Chichester, L. K., 1994; p 4284.
13. Bray, R. C. Adv. Enzymol. Relat. Areas Mol. Biol. 1980, 51, 107.
14. (b) Bray, R. C. Q. Rev. Biophys. 1988, 21, 299.
15. (a) Fiala, G.; Stetter, K. O. Arch. Microbiol. 1986, 145, 56.
16. (b) Schicho, R. N.; Ma, K.; Adams, M. W. W.; Kelly, R. M. J. Bacteriol. 1993, 175, 1823.
17. (c) Ma, K.; Schicho, R. N.; Kelly, R. M.; Adams, M. W. W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 90, 5341.
18. Johnson, J. L.; Rajagopalan, K. V.; Mukund, S.; Adams, M. W. W. J. Biol. Chem. 1993, 268, 4848.
19. George, G. N.; Prince, R. C.; Mukund, S.; Adams, M. W. W. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 3521.
20. White, H.; Feicht, R.; Huber, C.; Lottspeich, F.; Simon, H. Biol. Chem. Hoppe-Seyler 1991, 372, 999.
21. (a) Schmitz, R. A.; Richter, M.; Linder, D.; Thauer, R. K. Eur. J. Biochem. 1992, 207, 559.
22. (b) Schmitz, R. A.; Albracht, S. P. J.; Thauer, R. K. Eur. J. Biochem. 1992, 209, 1013.
23. Deaton, J. C.; Solomon, E. I.; Dunfor, C. N.; Wetherbee, P. J.; Burgess, B. K.; Jacobs, D. B. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1984, 121, 1042.
24. (a) Personal Communications from Professor D. C. Rees and Professor M. W. W. Adams.
25. (b) Chan, M. K.; Mukund, S.; Kletzin, A.; Adams, M. W. W.; Rees, D. C. Science 1995, 267, 1463.
26. Das, S. K.; Bis«,as, D.; Chaudhury, P. K.; Sarkar, S. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 9061.
27. Eagle, A. A.; Harben, S. M.; Tiekink, E. R. T.; Young, G. C. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 9749.
28. Ueyama, N.; Oku, H.; Nakamura, A. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 7310.
29. (a) Chen, G. J.-J.; McDonald, J. W.; Newton, W. E. Inorg. Chim. Acta 1976, 19, L67.
30. (b) Yu, S.-B.; Holm, R. H. Inorg. Chem. 1989, 28, 4385.
31. (c) Cervilla, A.; Llopis, E.; Ribera, A.; Domenech, A.; Sinn, E. J. Chem. Soc., Dalton Trans. 1994, 3511.
32. (a) Harmer, M. A.; Halbert, T. R.; Pan, W. H.; Coyle, C. L.; Cohen, S. A.; Stiefel, E. I. Polyhedron 1986, 5, 341.
33. (b) Broomhead, J. A.; Enemark, J. H.; Hamner, B.; Onega, R. B.; Pienkowski, W. Aust. J. Chem. 1987, 40, 381.
34. (c) Ansari, M. A.; Chandrasekaran, J.; Sarkar, S. Inorg. Chem. 1988, 27, 763.
35. (a) Listemann, M. L.; Shrock, R. R.; Dewan, J. C.; Kolodziej, R. M. Inorg. Chem. 1988, 27, 264.
36. (b) Piepgrass, K.; Pope, M. T. J. Am. Chem. Soc. 1989, 111, 753.
37. Sarkar, S.; Das, S. K. Proc. Indian Acad. Sci. (Chem. Sci.) 1992, 104, 533.
38. Stiefel, E. I.; Bennett, L. E.; Dori, Z.; Crawford, T. H.; Simo, C.; Gray, H. B. Inorg. Chem. 1970, 9, 281.
39. McCleverty, J. A.; Locke, J.; Wharton, E. J. J. Chem. Soc. A 1968, 816.
40. XTAL3.2 Reference Manual; Hall, S. R., Flack, H. D., Stewart, J. M., Eds.; University of Western Australia: Geneva and Maryland, 1992.
41. Pope, M. T.; Still, E. R.; Williams, R. J. P. In Molybdenum and Molybdenum Containing Enzymes; Coughlan, M. P., Ed.; Pergamon Press: Oxford, U. K. 1980: p 1.
42. Jowitt, R. N.; Mitchell, P. C. H. J. Chem. Soc. 1969, 1476.
43. Lozano, R.; Alarcon, E.; Doadrio, A. L.; Doadrio, A. Polyhedron 1983, 2, 435
44. o′ of dithionite varies with concentration, see: Lambath, D. O.; Palmer, G. J. Biol. Chem. 1973, 248, 6095. For pH effect, see: Mayhow, S. G. Eur. J. Biochem. 1978, 85, 535.
45. o′ of dithionite varies with concentration, see: Lambath, D. O.; Palmer, G. J. Biol. Chem. 1973, 248, 6095. For pH effect, see: Mayhow, S. G. Eur. J. Biochem. 1978, 85, 535.
46. (a) Anbar, M.; Taube, H. J. Am. Chem. Soc. 1958, 80, 1073.
47. (b) Sfritar, J. A.; Taube, H. J. Am. Chem. Soc. 1969, 8, 2281.
48. Bennett, L. E. Prog. Inorg. Chem. 1973, 18, 1.
49. Weiner, J. H.; Cammack, R. Biochemistry 1990, 29, 8410.
50. DeHayes, L. J.; Faulkner, H. C.; Doub, W. H., Jr.; Sawyer, D. T. Inorg. Chem. 1975, 14, 2110.
51. Berg, J. M.; Holm, R. H. J. Am. Chem. Soc. 1985, 107, 917.
52. (a) Barber, M. J.; Siegal, L. M. Biochemistry 1982, 21, 1638.
53. (b) Pilato, R. S.; Stiefel, E. I. In Bioinorganic Catalysis; Reedijk, J., Ed.; Marcell Dekker, Inc: New York, 1993; p 131.
54. Mondal, M. S.; Mitra, S. Biochemistry 1994, 33, 10305.
55. Bradbury, J. R.; Masters, A. F.; McDonell, A. C.; Brunette, A. A.; Bond, A. M.; Wedd, A. G. J. Am. Chem. Soc. 1981, 103, 1959.
56. In Merck Index, 9th ed.; Merck & Co., Inc.; New Jersey, 1976: p 3393.
57. Deutsch, E.; Root, M. J.; Nosco, D. L. In Advances in Inorganic and Bioinorganic Mechanisms; Sykes, A. G., Ed.; Academic Press: London, 1982; p 269.
58. Boorman, P. M.; Chivers, T.; Mahadev, K. N.; O'Dell, B. D. Inorg. Chim. Acta 1976, 19, L35.
59. Leonard, K.; Plute, K.; Haltiwanger, R. C.; Rakowski-DuBois, M. Inorg. Chem. 1979, 18, 3246.
60. Coucouvanis, D.; Hadjikyriacou, A.; Draganjac, M.; Kanatzides, M. G.; Ileperuma, O. Polyhedron 1986, 5, 349.
61. Halbert, T. R.; Pan, W.-H.; Stiefel, E. I. J. Am. Chem. Soc. 1983, 105, 5476.
62. Das, S. K. Ph. D. Thesis, IIT Kanpur, 1994.
63. (a) Durant, R.; Garner, C. D.; Hyde, M. R.; Mabbs, F. E.; Parsons, J. R.; Richens, D. J. Less-Common Met. 1977, 54, 459.
64. (b) Holm, R. H. Coord. Chem. Rev. 1990, 100, 183.
65. (a) Rajagopalan, K. V. In Molybdenum and Molybdenum Containing Enzymes; Coughlan, M. P., Ed.; Pergamon Press: Oxford, U.K., 1980; p 243.
66. (b) Johnson, J. L.; Rajagopalan, K. V. J. Biol. Chem. 1976, 251, 5505.
67. Hanson, G. R.; Brunette, A. A.; McDonell, A. C.; Murray, K. S.; Wedd, A. G. J. Am. Chem. Soc. 1981, 103, 1953.
68. Schmitz, R. A.; Albracht, S. P. J.; Thauer, R. K. FEBS Lett. 1992, 309, 78.
69. Stiefel, E. I. In Molybdenum and Molybdenum Containing Enzymes; Coughlan, M. P., Ed.; Pergamon Press: Oxford, U. K., 1980; p 43.
70. (a) Dixon, M.; Keilin, D. Proc. R. Soc. B 1936, 119, 159.
71. (b) Massey, V.; Edmondson, D. E. J. Biol. Chem. 1970, 245, 6595.
72. Cramer, S. P.; Liu, C.-L.; Mortenson, L. E.; Spence, J. T.; Liu, S.-M.; Yamamoto, I.; Ljungdhal, L. G. J. Inorg. Biochem. 1985, 23, 119.
73. Cramer, S. P.; Solomonson, L. P.; Adams, M. W. W.; Mortenson, L. E. J. Am. Chem. Soc. 1984, 106, 1467.