Chromatin structure mapping in vivo using methyltransferases

Methods in Enzymology

Volumn 274, Issue , 1996, Pages 214-233

  Kladde, Michael P ^a   Simpson, Robert T ^a  

^a NONE

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BISULFITE; METHYLTRANSFERASE; RESTRICTION ENDONUCLEASE;

ARTICLE; CHROMATIN; DEAMINATION; DNA CLEAVAGE; DNA HYBRIDIZATION; DNA METHYLATION; MINICHROMOSOME; NONHUMAN; NUCLEOSOME; POLYMERASE CHAIN REACTION; PRIORITY JOURNAL; SACCHAROMYCES CEREVISIAE; YEAST;

SACCHAROMYCES CEREVISIAE;

EID: 0029845879     PISSN: 00766879     EISSN: None     Source Type: Book Series    
DOI: 10.1016/S0076-6879(96)74019-3     Document Type: Article

References (30)

1. J. Singh and A. J. S. Klar, Genes Dev. 6, 186 (1992).
2. D. E. Gottschling, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89, 4062 (1992).
3. M. P. Kladde and R. T. Simpson, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91, 1361 (1994).
4. M. Frommer, L. E. MacDonald, D. S. Millar, C. M. Collis, F. Watt, G. W. Grigg, P. L. Molloy, and C. L. Paul, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89, 1827 (1992).
5. H. Hayatsu, Y. Wataya, K. Kai, and S. Iida, Biochemistry 9, 2858 (1970).
6. R. Shapiro, R. E. Servis, and M. Wecher, J. Am. Chem. Soc. 92, 422 (1970).
7. R. Shapiro, V. Difate, and M. Welcher, J. Am. Chem. Soc. 96, 906 (1974).
8. J. Tazi and A. Bird, Cell 60, 909 (1990).
9. A. Dean, D. S. Pederson, and R. T. Simpson, Methods Enzymol. 170, 26 (1989).
10. R. Y.-H. Wang, C. W. Gehrke, and M. Ehrlich, Nucleic Acids Res. 8, 4777 (1980).
11. P. Renbaum, D. Abrahamove, A. Fainsod, G. Wilson, S. Rottem, and A. Razin, Nucleic Acids Res. 18, 1145 (1990).
12. S. G. Oliver, Q. J. M. van der Aart, M. L. Agostini-Carbone, M. Aigle, L. Alberghina, D. Alexandraki, G. Antoine, R. Anwar, J. P. G. Ballesta, P. Benit, G. Berben, E. Bergantino, N. Biteau, P. A. Bolle, M. Bolotin-Fukuhara, A. Brown, A. J. P. Brown, J. P. Buhler, C. Carcano, G. Carignani, H. Cederberg, R. Chanet, R. Contreras, M. Crouzet, B. Daignan-Fornier, E. Defoor, M. Delgado, J. Demolder, C. Doira, E. Dubois, B. Dujon, A. Dusterhoft, D. Erdmann, M. Esteban, F. Fabre, C. Fairhead, G. Faye, H. Feldmann, W. Fiers, M. C. Francingues-Gaillard, L. Franco, L. Frontali, H. Fukuhara, L. J. Fuller, P. Galland, M. E. Gent, D. Gigot, V. Gilliquet, A. Goffeau, M. Grenson, P. Grisanti, L. A. Grivell, M. de Haan, M. Haasemann, D. Hatat, J. Hoenicka, J. Hegemann, C. J. Herbert, F. Hilger, S. Hohmann, C. P. Hollenberg, K. Huse, F. Iborra, K. J. Indge, K. Isono, C. Jacq, M. Jacquet, C. M. James, J. C. Jauniaux, Y. Jai, A. Jimenez, A. Kelly, U. Kleinhauns, P. Kreisi, G. Lanfranchi, C. Lewis, C. G. van der Linden, G. Lucchini, K. Lutzenkirchen, M. J. Maat, L. Mallet, G. Mannhaupt, E. Martegani, A. Mathieu, C. T. C. Maurer, D. McConnell, R. A. McKee, F. Messenguy, H. W. Mewes, F. Molemans, M. A. Montague, M. Muzi Falconi, L. Nevas, C. S. Newlon, D. Noone, C. Pallier, L. Panzeri, B. M. Pearson, J. Perea, P. Phillippsen, A. Pierard, R. J. Planta, P. Plevani, B. Poetsch, F. Pohl, B. Purnelle, M. Ramezani Rad, S. W. Rasmussen, A. Raynal, M. Remacha, P. Richterich, A. B. Roberts, F. Rodriguez, E. Sanz, I. Schaaff-Gerstenschlager, B. Scherens, B. Schweitzer, Y. Shu, J. Skala, P. P. Slonimski, F. Sor, C. Soustelle, R. Spiegelberg, L. I. Stateva, H. Y. Steensma, S. Steiner, A. Thierry, G. Thireos, M. Tzermia, L. A. Urrestarazu, G. Valle, I. Vetter, J. C. van Vliet-Reedijk, M. Voet, G. Volckaert, P. Vreken, H. Wang, J. R. Warmington, D. von Wettstein, B. L. Wicksteed, C. Wilson, H. Wurst, G. Xu, A. Yoshikawa, F. K. Zimmerman, and J. G. Sgouros, Nature 357, 38 (1992).
13. S. Y. Roth, A. Dean, and R. T. Simpson, Mol. Cell. Biol. 10, 2247 (1990).
14. M. Shimizu, S. Y. Roth, C. Szent-Gyorgyi, and R. T. Simpson, EMBO J. 10, 3033 (1991).
15. M. D. Rose, F. Winston, and P. Hieter, "Methods in Yeast Genetics: A Laboratory Course Manual." Cold Spring Harbor Laboratory Press, Plainview, NY, 1990.
16. G. M. Church and W. Gilbert, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 81, 1991 (1984).
17. K. J. Breslauer, R. Frank, H. Blocker, and L. A. Markey, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83, 3746 (1986).
18. R. T. Simpson, J. Biol. Chem. 254, 10123 (1979).
19. F. Thoma, L. W. Bergman, and R. T. Simpson, J. Mol. Biol. 177, 715 (1984).
20. S. P. Bell, R. Kobayashi, and B. Stillman, Science 262, 1844 (1993).
21. E. H. Bresnick, S. John, D. S. Berard, P. LeFebvre, and G. L. Hager, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87, 3977 (1990).
22. S. Seeber, C. Kessler, and F. Gotz, Gene 94, 37 (1990).
23. H. Hayatsu, Prog. Nucleic Acids Res. 16, 75 (1976).
24. J. E. Brooks, R. M. Blumenthal, and T. R. Gingeras, Nucleic Acids Res. 11, 837 (1983).
25. M. Behe and G. Felsenfeld, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 78, 1619 (1981).
26. P. Hagerman, Biochemistry 29, 1980 (1990).
27. Y. Hodges-Garcia and P. J. Hagerman, Biochemistry 31, 7595 (1992).
28. J. Klysik, S. M. Stirdivant, C. K. Singleton, W. Zacharias, and R. W. Wells, J. Mol. Biol. 168, 5171 (1983).
29. M. Hochstrasser, M. J. Ellison, V. Chau, and A. Varshavsky, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88, 4606 (1991).
30. M. R. Murphy, M. Shimizu, S. Y. Roth, A. M. Dranginis, and R. T. Simpson, Nucleic Acids Res. 21, 3295 (1993).