Inhibition of viral polymerases by chain-terminating substrates: A kinetic analysis

Methods in Enzymology

Volumn 275, Issue , 1996, Pages 398-424

  Wilson, Jeanne E ^a   Porter, David J T ^a   Reardon, John E ^a  

^a NONE

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DNA POLYMERASE;

DISSOCIATION; DNA SYNTHESIS; ENZYME ACTIVITY; ENZYME INHIBITION; ENZYME KINETICS; PRIORITY JOURNAL; REVIEW; VIRUS REPLICATION;

EID: 0029833963     PISSN: 00766879     EISSN: None     Source Type: Book Series    
DOI: 10.1016/S0076-6879(96)75024-3     Document Type: Article

References (54)

1. P. A. Furman, P. De Miranda, M. H. St. Clair, and G. B. Elion, Antimicrob. Agents Chemother. 20, 518 (1981).
2. L. L. Bondoc, W. M. Shannon, J. A. Secrist, III, R. Vince, and A. Fridland, Biochemistry 29, 9839 (1990).
3. N. R. Hartman, R. Yarchoan, J. M. Pluda, R. V. Thomas, K. S. Marczyk, S. Broder, and D. G. Johns, Clin. Pharmacol. Ther. 47, 647 (1990).
4. H. Nakashima, J. Balzarini, R. Pauwels, D. Schols, J. Desmyter, and E. De Clercq, J. Virol. Methods 29, 197 (1990).
5. P. A. Furman, J. A. Fyfe, M. H. St. Clair, K. Weinhold, J. L. Rideout, G. A. Freeman, S. Nusinoff-Lehrman, D. P. Bolognesi, S. Broder, H. Mitsuya, and D. W. Barry, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83, 8333 (1986).
6. C. Kidson, P. C. Chan, T. Edwards, J. Mansbridge, W. J. Peacock, and R. D. Brock, "The Eukaryote Chromosome." Australian National Univ. Press, Canberra, 1975.
7. N. Byars and C. Kidson, Biochemistry 14, 3159 (1975).
8. P. V. McGuirt, J. E. Shaw, G. B. Elion, and P. A. Furman, Antimicrob. Agents Chemother. 25, 507 (1984).
9. J. E. Reardon and T. Spector, J. Biol. Chem. 264, 7405 (1989).
10. J. E. Reardon and W. H. Miller, J. Biol. Chem. 265, 20302 (1990).
11. B. Müller, T. Restle, J. Reinstein, and R. S. Goody, Biochemistry 30, 3709 (1991).
12. J. E. Reardon, Biochemistry 31, 4473 (1992).
13. W. R. McClure and T. M. Jovin, J. Biol. Chem. 250, 4073 (1975).
14. K. Tanabe, E. W. Bohn, and S. H. Wilson, Biochemistry 18, 3401 (1979).
15. S. D. Detera, S. P. Becerra, J. A. Swack, and S. H. Wilson, J. Biol. Chem. 256, 6933 (1981).
16. P. A. Fisher and D. Korn, J. Biol. Chem. 254, 11033 (1979).
17. R. D. Kuchta, V. Mizrahi, P. A. Benkovič, K. A. Johnson, and S. J. Benkovič, Biochemistry 26, 8410 (1987).
18. J. C. Hsieh, S. Zinnen, and P. Modrich, J. Biol. Chem. 268, 24607 (1993).
19. S. S. Patel, I. Wong, and K. A. Johnson, Biochemistry 30, 511 (1991).
20. M. E. Dahlberg and S. J. Benkovič, Biochemistry 30, 4835 (1991).
21. W. M. Kati, K. A. Johnson, L. F. Jerva, and K. S. Anderson, J. Biol. Chem. 267, 25988 (1992).
22. C. Majumdar, J. Abbotts, S. Broder, and S. H. Wilson, J. Biol. Chem. 263, 15657 (1988).
23. W. R. McClure and T. M. Jovin, J. Biol. Chem. 250, 4073 (1975).
24. V. Mizrahi, R. N. Henrie, J. F. Marlier, K. A. Johnson, and S. J. Benkovič, Biochemistry 24, 4010 (1985).
25. D. W. Knopf, Eur. J. Biochem. 98, 231 (1979).
26. K. Borroto-Esoda and L. R. Boone, J. Virol. 65, 1952 (1991).
27. K. Borroto-Esoda and L. R. Boone, Antiviral Res. 23, 235 (1994).
28. O. Hantz, H. S. Allaudeen, T. Ooka, E. De Clercq, and C. Trepo, Antiviral Res. 4, 187 (1984).
29. E. Nordenfelt, B. Löfgren, J. Cattopadhyaya, and B. Öberg, J. Med. Virol. 22, 231 (1987).
30. K. Reimer, E. Metthes, M. von Janta-Lipinski, and H. Meisel, Antiviral Chem. Chemother. 2, 249 (1991).
31. H. Meisel, K. Reimer, M. von Janta-Lipinski, D. Barwolff, and E. Matthes, J. Med. Virol. 30, 137 (1990).
32. M. G. Davis, J. E. Wilson, N. A. VanDraanen, W. H. Miller, G. A. Freeman, S. M. Daluge, F. L. Boyd, A. E. Aulabaugh, G. R. Painter, and L. R. Boone, in press, 1996.
33. S. Z. Hirschman, M. Gerber, and E. Garfinkel, J. Med. Virol. 2, 61 (1978).
34. J. L. Martin, C. E. Brown, N. Matthews-Davis, and J. E. Reardon, Antimicrob. Agents Chemother. 38, 2743 (1994).
35. J. E. Reardon, E. S. Furfine, and N. Cheng, J. Biol. Chem. 266, 14128 (1991).
36. N. E. Huber, J. M. McCoy, J. S. Seehra, and C. C. Richardson, J. Biol. Chem. 264, 4669 (1989).
37. J. E. Wilson, J. L. Martin, K. Borroto-Esoda, S. Hopkins, G. Painter, D. C. Liotta, and P. A. Furman, Antimicrob. Agents Chemother. 37, 1720 (1993).
38. J. F. Milligan, D. R. Groebe, G. W. Witherell, and O. C. Uhlenbeck, Nucleic Acids Res. 15, 8783 (1987).
39. F. R. Bryant, K. A. Johnson, and S. J. Benkovič, Biochemistry 22, 3537 (1983).
40. J. L. Martin, J. E. Wilson, E. S. Furfine, S. Hopkins, and P. A. Furman, J. Biol. Chem. 268, 2565 (1993).
41. F. Sanger, S. Nicklen, and A. R. Coulson, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 74, 5463 (1977).
42. M. H. St. Clair, C. A. Richards, T. Spector, K. J. Weinhold, W. H. Miller, A. J. Langlois, and P. A. Furman, Antimicrob. Agents Chemother. 31, 1972 (1987).
43. R. Gaillard, unpublished data (1995).
44. R. D. Kuchta, P. Benkovič, and S. J. Benkovič, Biochemistry 27, 6716 (1988).
45. J. E. Wilson, J. L. Martin, A. Aulabaugh, L. Wright, S. McPherson, J. K. Wakefield, C. D. Morrow, J. E. Reardon, and P. A. Furman, J. Biol. Chem. 271, 13656 (1996).
46. J. E. Reardon, unpublished results (1995).
47. W. H. Miller, S. M. Daluge, E. P. Garvey, S. Hopkins, J. E. Reardon, F. L. Boyd, and R. L. Miller, J. Biol. Chem. 267, 21220 (1992).
48. N. A. Van Draanen, S. C. Tucker, F. L. Boyd, B. W. Trotter, and J. E. Reardon, J. Biol. Chem. 267, 25019 (1992).
49. G. R. Painter, L. L. Wright, S. Hopkins, and P. A. Furman, J. Biol. Chem. 266, 19362 (1991).
50. K. A. Johnson, Methods Enzymol. 134, 677 (1986).
51. P. A. Furman, M. H. St. Clair, and T. Spector, J. Biol. Chem. 259, 9575 (1984).
52. P. A. Fisher and D. Korn, Biochemistry 20, 4560 (1981).
53. W. W. Cleland, Methods Enzymol. 63, 500 (1979).
54. E. Southern, J. Mol. Biol. 98, 503 (1975).