Identification and description of copper-thiolate vibrations in the dinuclear Cu(A) site of cytochrome c oxidase

Journal of the American Chemical Society

Volumn 118, Issue 43, 1996, Pages 10436-10445

  Andrew, Colin R ^a   Fraczkiewicz, Robert ^b   Czernuszewicz, Roman S ^b   Lappalainen, Pekka ^c   Saraste, Matti ^c   Sanders Loehr, Joann ^a  

^a OREGON HEALTH AND SCIENCE UNIVERSITY   (United States)

^b University of Houston ^*  (United States)

^c EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY   (Germany)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CYTOCHROME C OXIDASE;

ARTICLE; ENZYME STRUCTURE; MOLECULAR DYNAMICS; PARACOCCUS DENITRIFICANS; RAMAN SPECTROMETRY;

EID: 0029825113     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja960969g     Document Type: Article

References (53)

1. Babcock, G. T.; Wikström, M. Nature 1992, 356, 301-309.
2. Lappalainen, P.; Aasa, R.; Malmström, B. G.; Saraste, M. J. Biol. Chem. 1993, 268, 26416-26421.
3. von Wachenfeld, C.; de Vries, S.; van der Oost, J. FEBS Lett. 1994, 340, 109-113.
4. Fee, J. A.; Sanders, D.; Slutter, C. E.; Doan, P. E.; Aasa, R.; Karpefors, M.; Vänngård, T. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1995, 212, 77-83.
5. van der Oost, J.; Lappalainen, P.; Musacchio, A.; Warne, A.; Lemieux, L.; Rumbley, J.; Gennis, R. B.; Aasa, R.; Pascher, T.; Malmström, B. G.; Saraste, M. EMBO J. 1992, 11, 3209-3217.
6. Kelly, M.; Lappalainen, P.; Talbo, G.; Haltia, T.; van der Oost, J.; Saraste, M. J Biol. Chem. 1993, 268, 16781-16787.
7. Hay, M.; Richards, J. H.; Lu, Y. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 461-464.
8. Dennison, C.; Vijgenboom, E.; de vries, S.; van der Oost, J.; Canters, G. W. FEBS Lett. 1995, 365, 92-94.
9. Adman, E. T. Nature Struct. Biol. 1995, 2, 929-931.
10. Antholine, W. E.; Kastrau, D. H. W.; Steffens, G. C. M.; Buse. G.; Zumft, W. G.; Kroneck, P. M. H. Eur. J. Biochem. 1992, 209, 875-881.
11. Blackburn, N. J.; Barr, M. E.; Woodruff, W. H.; van der Oost. J.; de Vries, S. Biochemistry 1994, 33, 10401-10407.
12. Henkel, G.; Müller, A.; Weissgräber, S.; Buse, G.; Soulimane, T.; Steffens, G. C. M.; Molting, H.-F. Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 1995, 34, 1488-1492.
13. Farrar, J. A.; Lappalainen, P.; Zumft, W. G.; Saraste, M.; Thomson, A. J. Eur. J. Biochem. 1995, 232, 294-303.
14. Wilmanns, M.; Lappalainen, P.; Kelly, M.; Sauer-Eriksson, E.; Saraste, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1995, 92, 11955-11959.
15. Iwata, S.; Ostermeier, C.; Ludwig, B.; Michel, H. Nature 1995, 376. 660-669.
16. Tsukihara, T.; Aoyama, H.; Yamashita, E.; Tomizaki, T.; Yamaguchi, H.; Shinzawa-Itoh, K.; Nakashima, R.; Yaono, R.; Yoshikawa, S. Science 1995, 269, 1069-1074.
17. Woodruff, W. H.; Dyer, R. B.; Schoonover, J. R. In Biological Applications of Roman Spectroscopy; Spiro, T. G., Ed.: Wiley: New York, 1988; Vol. 3, pp 413-438.
18. Andrew, C. R.; Sanders-Loehr, J. Acc. Chem. Res. 1996, 29, 365-372.
19. Nestor, L.; Larrabee, J. A.; Woolery, G.; Reinhammar, B.; Spiro, T. G. Biochemistry 1984, 23, 1084-1093.
20. Han, J.; Adman, E. T.; Beppu, T.; Codd, R.; Freeman. H. C.; Huq, L.; Loehr, T. M.; Sanders-Loehr, J. Biochemistry 1991, 30, 10904-10913.
21. Andrew, C. R.; Yeom, H.; Valentine, J. S.; Karlsson, B. G.; Bonander, N.; van Pouderoyen, G.; Canters, G. W.; Loehr. T. M.; Sanders-Loehr, J. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 11489-11498.
22. Dave, B. C.; Germanas, J. P.; Czernuszewicz, R. S. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 12175-12176.
23. Andrew, C. R.; Han, J.; de Vries, S.; van der Oost, J.; Averill, B. A.; Loehr, T. M.; Sanders-Loehr, J. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 10805-10806.
24. Andrew, C. R.; Lappalainen, P.; Saraste, M.; Hay, M. T.; Lu, Y.; Dennison, C.; Canters, G. W.; Fee, J. A.; Slutter, C. E.; Nakamura, N.; Sanders-Loehr, J. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 10759-10760.
25. Qiu, D.; Dong, S.; Ybe, J. A.; Hecht, M. H.: Spiro. T. G. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 6443-6446.
26. Takahashi, S.; Ogura, T.; Shinzawa-Itoh, K.; Yoshikawa, S.; Kitagawa. T. Biochemistry 1993, 32, 3664-3670.
27. Wallace-Williams, S. E.; James, C. A.; de Vries, S.; Saraste, M.; Lappalainen, P.; van der Oost, J.; Fabian, M.; Palmer, G.; Woodruff, W. H. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 3986-3987.
28. Andrew, C. R.; Nakamura, N.; Sanders-Loehr, J.; Saraste, M. Unpublished results.
29. Jeter, R. M.; Ingraham, J. L. Arch. Microbiol. 1984, 138, 124-130.
30. Sambrook, J.; Fritsch, E. F.; Maniatis, T. Molecular Cloning: A Laboratory Manual; Cold Spring Harbor Laboratory Press: Cold Spring Harbor, NY, 1989.
31. Loehr, T. M.; Sanders-Loehr, J. Methods Enzymol. 1993, 226, 431-470.
32. Wilson, E. B.; Decius, J. C.; Cross, P. C. Molecular Vibrations: The Theory of Infrared and Raman Spectra; Dover: New York, 1955.
33. Fraczkiewicz, R. Ph.D. Thesis, University of Houston, 1996.
34. Fraczkiewicz, R.; Czernuszewicz, R. S. Manuscript in preparation.
35. Nakamoto, K. Infrared and Raman Spectra of Inorganic and Coordination Compounds; John Wiley and Sons: New York, 1986.
36. X-Mol. version 1.3.1; Minnesota Supercomputer Center, Inc.: Minneapolis. MN. 1993.
37. Thamann, T. J.; Willis, L. J.; Loehr, T. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1982, 79, 6396-6400.
38. Blair, D. F.; Campbell, G. W.; Schoonover, J. R.; Chan, S. I.; Gray, H. B.; Malmström, B. G.; Pecht, I.; Swanson, B. I.; Woodruff, W. H.; Cho, W. K.; English, A. M.; Fry, A. F.; Lum, V.; Norton, K. A. J. Am. Chem. Soc. 1985, 107, 5755-5766.
39. Sanders-Loehr, J. In Bioinorganic Chemistry of Copper; Karlin, K. D., Tyeklár, Z., Eds.; Chapman & Hall: New York, 1993, pp 51-63.
40. van Pouderoyen, G.; Andrew, C. R.; Loehr, T. M.; Sanders-Loehr, J.; Mazumdar, S.; Hill, H. A. O.; Canters, G. W. Biochemistry 1996, 35, 1397-1407.
41. den Blaauwen, T.; Hoitink, C. W. G.; Canters, G. W.; Han, J.; Loehr, T. M.; Sanders-Loehr, J. Biochemistry 1993, 32, 12455-12464.
42. Andrew, C. R.; Han, J.; den Blaauwen, T.; van Pouderoyen, G.; Veigenbaum, E.; Canters, G. W.; Sanders-Loehr, J. Manuscript in preparation.
43. Fraczkiewicz, R.; Fraczkiewicz, G.; Germanas, J.; Czernuszewicz, R. S., unpublished results.
44. Guss, J. M.; Bartunik, H. D.; Freeman, H. C. Acta Crystallogr, B 1992, 48, 790-811.
45. Guckert, J. A.; Lowery, M. D.; Solomon, E. I. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 2817-2844.
46. Wing, R. M.; Callahan, K. P. Inorg. Chem. 1969, 8, 871-874.
47. Ramirez, B. E.; Malmström, B. G.; Winkler, J. R.; Gray, H. B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1995, 92, 11949-11951.
48. Barr, M. E.; Smith, P. H.; Antholine, W. E.; Spencer, B. J. Chem. Soc. Chem. Commun. 1993, 1649-1652.
49. Harding, C.; Nelson, J.; Symons, M. C. R.; Wyatt, J. J. Chem. Soc. Chem. Commun. 1994, 2499-2500.
50. Houser, R. P.; Young, V. G., Jr.; Tolman, W. B. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 1201-1206.
51. Gamelin, D. R.; Bominaar, E. L., Kirk, M. L.; Wieghardt, K.; Solomon, E. I. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 8085-8097.
52. Gurbiel, R. J.; Fann, Y.-C; Surerus, K. K.; Werst, M. M.; Musser, S. M.; Doan, P. E.; Chan, S. I.; Fee, J. A.; Hoffman, B. M. J. Am. Chem. Soc: 1993, 115, 10888-10894.
53. Zickermann, V.; Verkhovsky, M.; Morgan, J.; Wikström, M.; Anemüller, S.; Bill, E.; Steffens, G. C. M.; Ludwig, B. Eur. J. Biochem. 1995, 234, 506-512.