Structure of actinomycin D bound with (GAAGCTTC)2 and (GATGCTTC)2 and its binding to the (CAG)(n):(CTG)(n) triplet sequence as determined by NMR analysis

Journal of the American Chemical Society

Volumn 118, Issue 37, 1996, Pages 8791-8801

  Lian, Chenyang ^a   Robinson, Howard ^a   Wang, Andrew H J ^a  

^a UNIVERSITY OF ILLINOIS AT URBANA CHAMPAIGN   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DACTINOMYCIN;

ARTICLE; DNA BINDING; DNA STRUCTURE; IN VITRO STUDY; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE;

EID: 0029815513     PISSN: 00027863     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja961631p     Document Type: Article

References (42)

1. (a) Aivasashvilli, V. A.; Beabealashvilli, R. S. FEBS Lett. 1983, 160, 124-128.
2. (b) Lane, M. J.; Dabrowiak, J. C.; Vournakis, J. N. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1983, 80, 3260-3264.
3. (c) Fox, K. R.; Waring, M. J. Nucleic Acids Res. 1984, 12, 9271-9285.
4. (d) Phillips, D. R.; Crothers, D. M. Biochemistry 1986, 25, 7355-7362.
5. (e) Goodisman, J.; Rehfuss, R.; Ward, B.; Dabrowiak, J. C. Biochemistry 1992, 31, 1046-1058.
6. (a) Patel, D. J. Biochemistry 1974, 13, 2396-2402.
7. (b) Liu, X.: Chen, H.; Patel, D. J. J. Biomol. NMR 1991, 1, 323-347.
8. (c) Brown, D. R.; Kurz, M.; Kearns, D. R.: Hsu, V. L. Biochemistry 1994, 33, 651-664.
9. (a) Sobell, H. M.; Jain, S. C.; Sakore, T. D.; Nordman, C. E. Nature (New Biol.) 1971, 231, 200-205.
10. (b) Sobell, H. M.; Jain, S. C. J. Mol. Biol. 1972, 68, 21-34.
11. (c) Kamitori, S.; Takusagawa, F. J. Mol. Biol. 1992, 225, 445-456.
12. (d) Kamitori, S.; Takusagawa, F. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 4154-4165.
13. Rill, R. L.; Marsch. G. A.; Graves, D. E. J. Biomol. Struct. Dynam. 1989, 7, 591-605.
14. Bailey, S. A.; Graves, D. E.; Rill, R.; Marsch, G. Biochemistry 1993, 32, 5881-5887.
15. Bailey, S. A.; Graves, D. E.; Rill, R. Biochemistry 1994, 33, 11493-11500.
16. Chen, F.-M. Biochemistry 1988, 27, 6393-6397.
17. (a) Fu, Y.-H.; Kuhl, D. P. A.; Pizzuti, A.; Pierreti, M.; Sutcliffe, S. S.: Richards, S.; Verkerk, A. J. M. H.; Holden, J. J. A.; Fenwick, T. G., Jr.; Warren, S. T.; Oostra, B. A.; Nelson, D. L.; Caskey, C. T. Cell 1991, 67, 1047-1058.
18. (b) Verkerk, A. J. M. H.; Pieretti, M.; Sutcliffe, J. S.; Fu, Y.-H.; Kuhl, D. P. A.; Pizzuti, A.; Reiner, O.; Richards, S.; Victoria, M. F.; Zhang, F.; Bussen, B. E.; van Ommen, G-J. B.; Blonden, L. A. J.; Riggins, G. J.; Chastain, J. L.; Kunst, C. B.; Galjaard, H.; Caskey, C. T.; Nelson, D. L.; Oostra, B. A.; Warren, S. T. Cell 1991, 65, 905-914.
19. (a) The Huntington's Disease Collaborative Research Group. Cell 1993, 72, 971-983.
20. (b) LaSpada, A. R.; Wilson, E. M.; Lubahn, D. B.; Harding, A. E.; Fischbeck, K. H. Nature 1991, 352, 77-99.
21. (a) Brook, J. D.; McCurrash, A. E.; Harley, H. G.; Buckler, A. J.; Church, D.; Aburatani, H.; Hunter, K.; Stanton, V. P.; Thirion, J.-P.; Hudson, T.; Sohn, R.; Zemelman, B.; Snell, R. G.; Rundle, S. A.; Crow, S.; Davies, J.; Shelbourne, P.; Buxton, J.; Jones, C.; Juvonen, V.; Johnson, K.; Harper, P. S.; Shaw, D. J.; Housman, D. E. Cell 1992, 68, 799-808.
22. (b) Mahadevan, M.; Tsilfidis, C.; Sabourin, L.; Shutler, G.; Amemiya, C.; Jansen, G.; Neville, C.; Narang, M.; Barcelo, J.; O'Hoy, K.; Leblond, S.; Earle-Macdonald, J.; de Jong, P. J.; Wieringa, B.; Korneluk, R. G. Science 1992, 255, 1253-1255.
23. (a) Caskey, C. T.; Pizzuti, A.; Fu, Y.-H.; Fenwick, T. G., Jr.; Nelson, D. L. Science 1992, 256, 784-789.
24. (b) Nelson, D. L.; Warren, S. T. Nature Genet. 1993, 4, 107-108.
25. (c) Martin, J. B. Sceince 1993, 262, 674-676.
26. (d) Miwa, S. Nature Genet. 1994, 6, 3-4.
27. (e) Richards, T. I.; Sutherland, G. R. Cell 1992, 70, 709-712.
28. Leach, D. R. F. BioEssays 1994, 16, 893-900.
29. (a) Chen, X.; Mariappan, S. S. V.; Catasti, P.; Ratliff, R.; Moyzis, R. K.; Laayoun, A.; Smith, S. S.; Bradbury, E. M.; Gupta, G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1995, 92, 5199-5203.
30. (b) Mitas, M.; Yu, A.; Dill, J.; Kamp, T. J.; Chambers, E. J.; Haworth, I. S. Nucleic Acids Res. 1995, 23, 1050-1059.
31. (c) Zhu, L. M.; Chou, S. H.; Xu, J. D; Reid, B. R. Nature Struct. Biol. 1995, 2, 1012-1017.
32. (d) Smith, G. K.; Jie, J.; Fox, G. E.; Gao, X. L. Nucleic Acids Res. 1995, 23, 4303-4311.
33. (e) Mariappan, S. V. S.; Catasti, P.; Chen, X.; Ratliff, R.; Moyzis, R. K.; Bradbury, E. M.; Gupta, G. Nucleic Acids Res. 1996, 24, 784-792.
34. (f) Gacy, A. M.; Goellner, G.; Juranic, N.; Macura, S.; McMurray, C. T. Cell 1995, 81, 533-540.
35. (g) Mariappan, S. V. S.; Garcia, A. E.; Gupta, G. Nucleic Acids Res. 1996, 24, 775-783.
36. Robinson, H.; Wang, A. H.-J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1993, 90, 5224-5228.
37. Hore, P. J. J. Magn. Res. 1983, 54, 539-542.
38. Robinson, H.; Wang, A. H.-J. Biochemistry 1992, 31, 3524-3533.
39. Brunger, A. T. X-PLOR, 1993, version 3.1, The Howard Hughes Medical Institute and Yale University, New Haven, CT.
40. Wang, A. H.-J. Current Opin. Struct. Biol. 1992, 2, 361-368.
41. Werner, M. H.: Gronenborn, A. M.; Clore, G. M. Science 1996, 271, 778-784.
42. Gao, X.; Huang, X.; Smith, G. K.; Zheng, M.; Liu, H. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 8883-8884.