Two-dimensional separations of the genome and proteome of neuroblastoma cells

Electrophoresis

Volumn 17, Issue 11, 1996, Pages 1741-1751

  Wimmer, K ^a   Kuick, Rork ^a   Thoraval, D ^a   Hanash, Samir M ^a,b  

^a UNIVERSITY OF MICHIGAN MEDICAL SCHOOL   (United States)

^b Box 0510   (United States)

Author keywords

Genome; Neuroblostoma cells; Proteome; Two dimensional polyacrylamide gel electrophoresis

Indexed keywords

CELL CULTURE; CELL PROLIFERATION; DNA; ELECTROPHORESIS; GELS; GENES; GENOME; TUMORS;

DNA FRAGMENT; GENOME; GENOMIC FRAGMENTS; GENOMICS; MULTI COPIES; NEUROBLASTOMA CELLS; NEUROBLASTOMAS; NEUROBLOSTOMA CELL; TWO-DIMENSIONAL POLYACRYLAMIDE GEL ELECTROPHORESIS; TWO-DIMENSIONAL SEPARATIONS;

PROTEINS;

CYCLINE; DNA FRAGMENT; HEAT SHOCK PROTEIN; NUCLEOSIDE DIPHOSPHATE KINASE;

ANIMAL CELL; ARTICLE; CANCER; COMPUTER ANALYSIS; CONTROLLED STUDY; GENE AMPLIFICATION; GENETIC ANALYSIS; HUMAN; HUMAN CELL; NEUROBLASTOMA CELL; NONHUMAN; PROTEIN ANALYSIS; TECHNIQUE; TWO DIMENSIONAL GEL ELECTROPHORESIS;

EID: 0029802493     PISSN: 01730835     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/elps.1150171112     Document Type: Article

References (78)

1. Gale, G., D'Angio, G., Uri, A., Chatten, J., Koop, C. E., Pediatrics 1982, 70, 409-413.
2. Beckwith, J. B., Perrin, E. V., Am. J. Pathol. 1963, 43, 1089-1104.
3. Guin, G. H., Gilbert, E. F., Jones, B., Am. J. Clin. Pathol. 1968, 51, 126-136.
4. Brodeur, G. M., Sekhon, G. S., Goldstein, M. N., Cancer 1977, 40, 2256-2263.
5. Brodeur, G. M., Green, A. A., Hayes, F. A. in: Evans, A. E. (Ed.), Advances in Neuroblastoma Research, Raven Press, New York 1980, pp. 73-80.
6. Caron, H., van Sluis, P., de Kraker, J., Bokkerink, J., Egeler, M., Laureys, G., Slater, R., Westerveld, A., Voûte, P. A., Versteeg, R., New Engl. J. Med. 1996, 334, 225-230.
7. Hanash, S. M., Gastroenterology 1996, 111, 250-252.
8. Look, A. T., Hayes, F. A., Nitschke, R., McWilliams, N. B., Green, A. A., New Engl. J. Med. 1984, 311, 231-235.
9. Gansler, T., Chattern, J., Varello, M., Bunin, G., Atkinson, B., Cancer 1986, 58, 2453-2458.
10. Kaneko, Y., Kanda, N., Maseki, N., Sakurai, M., Tsuchida, Y., Takeda, T., Okabe, I., Sakurai, M., Cancer Res. 1987, 47, 311-318.
11. Cowell, J. K., Rupniak, H. T., Cancer Genet. Cytogenet. 1983, 9, 273-280.
12. Biedler, J. L., Ross, R. A., Shanske, S., Spengler, B. A., in: Evans, A. E. (Ed.), Advances in Neuroblastoma Research, Raven Press, New York 1980, pp. 81-96.
13. Schwab, M., Varmus, H. E., Bishop, J. M., Nature 1985, 316, 160-162.
14. Brodeur, G. M., Seeger, R. C., Schwab, M., Varmus, H. E., Bishop, J. M., Science 1984, 224, 1121-1124.
15. Brodeur, G. M., Seeger, R., Cancer Genet. Cytogenet. 1986, 19, 101-111.
16. Anderson, N. G., Andersen, N. L., Anal. Biochem. 1978, 85, 331-340.
17. Anderson, N. L., Anderson, N. G., Anal. Biochem. 1978, 85, 341-354.
18. Hanash, S. M., Strahler, J. R., Neel, J. V., Hailat, N., Melhem, R., Keim, D. Zhu, X. X., Wagner, D., Gage, D. A., Watson, J. T., Proc. Nat. Acad. Sci. USA 1991, 88, 5709-5713.
19. Fischer, S. G, Lerman, L. S., Cell 1979, 16, 191-200.
20. Uitterlinden, A. G., Slagboom, P. E., Knook, D. L., Vijg, J., Proc. Nat. Acad. Sci. USA 1989, 86, 2742-2746.
21. Yi, M., Au, L.-C., Ichikawa, N., Ts'o, P.O.P., Nat. Acad. Sci. USA 1990, 87, 3919-3923.
22. Hatada, I., Hayashizaki, Y., Hirotsune, S., Komatsubara, H., Proc. Nat. Acad. Sci. USA 1991, 88, 9523-9527.
23. Larsen, F., Gundersen, G., Lopez, R., Prydz, H., Genomics 1992, 13, 1095-1107.
24. Lindsay, S., Bird, A. P., Nature 1987, 327, 336-338.
25. Asakawa, J., Kuick, R., Neel, J. V., Kodaira, M., Satoh, C., Hanash, S. M., Electrophoresis 1995, 16, 241-252.
26. Kuick, R., Asakawa, J., Neel, J. V., Satoh, C., Hanash, S. M., Genomics 1995, 25, 345-353.
27. Thoraval, D., Asakawa, J., Kodaira, M., Chang, C., Radany, E., Kuick, R., Lamb, B., Richardson, B., Neel, J. V., Glover, T., Hanash, S. M., Proc. Nat. Acad. Sci. USA 1996, 93, 4442-4447.
28. Kuick, R., Skolnick, M. M., Neel, J. V., Hanash, S. M., Electrophoresis 1991, 12, 736-746.
29. Skolnick, M. M., Sternberg, S. R., Neel, J. V., Clini. Chem. 1982, 28, 969-978.
30. Neel, J. V., Rosenblum, B. B., Sing, C. F., Skolnick, M. M., Hanash, S. M., Sternberg, S., in: Celis, J. E., Bravo, R. (Eds.), Methods and Applications of Two-Dimensional Gel Electrophoresis of Proteins, Academic Press, New York 1984, pp. 259-306.
31. Ali, I., Chan, Y., Kuick, R., Teichroew, D., Hanash, S. M., Electrophoresis 1991, 12, 747-761.
32. Skolnick, M. M., Neel, J. V., in: Harris, H., Hirschhorn, K., Advances in Human Genetics, Plenum Press, New York 1986, pp. 55-160.
33. Kuick, R. D., Neel, J. V., Strahler, J. R., Chu, E. H. Y., Bargal, R., Fox, D. A., Hanash, S. M., Proc. Nat. Acad. Sci. USA 1992, 89, 7036-7040.
34. Chu, E. H. Y., Boehnke, M., Hanash, S. M., Kuick, R. D., Lamb, B. J., Neel, J. V., Niezgoda, W., Pivirotto, S., Sundling, G., Genetics 1988, 119, 693-703.
35. Asakawa, J., Kuick, R., Neel, J. V., Kodaira, M., Satoh, C., Hanash, S. M., Proc. Nat. Acad. Sci. USA 1994, 91, 9052-9056.
36. Gilles, A.-M., Presecan, E., Vonica, A., Lascu, I., J. Biol. Chem. 1991, 266, 8784-8789.
37. Hanash, S. M., Strahler, J. R., Kuick, R., Chu, E. H. Y., Nichols, D., J. Biol. Chem. 1988, 263, 12813-12815.
38. Zhu, X. X., Kozarsky, K., Strahler, J. R., Eckerskorn, C., Lottspeich, F., Melhem, R., Lowe, J., Fox, D. A., Hanash, S. M., Atweh, G. F., J. Biol. Chem. 1989, 264, 14556-14560.
39. Ferrari, A. C., Seuanez, H. M., Hanash, S. M., Atweh, G. F., Genes, Chromosomes Canc. 1990, 2, 125-129.
40. Hailat, N., Strahler, J., Melhem, R., Zhu, X. X., Brodeur, G., Seeger, R. C., Reynolds, C. P., Hanash, S. M., Oncogene 1990, 5, 1615-1618.
41. Melhem, R. F., Zhu, X. X., Hailat, N., Strahler, J., Hanash, S. M., J. Biol. Chem. 1991, 266, 17747-17753.
42. Keim, D., Hailat, N., Hodge, D., Hanash, S. M., Blood 1990, 76, 985-990.
43. Hanash, S. M., Gagnon, M., Seeger, R. C., Baier, L., in: Evans, A. E., D'Angio, G. J., Seeger, R. C., Advances in Neuroblastoma Research: Progress in Clinical and Biological Research. Alan R. Liss, Inc. New York 1985, pp. 261-268.
44. Rosengard, A. M., Krutzsch, H. C., Shearn, A., Biggs, J. R., Barker, E., Margulies, I. M., King, C. R., Liotta, L. A., Steeg, P. S., Nature 1989, 342, 177-180.
45. Hailat, N., Keim, D. R., Melhem, R. F., Zhu, X. X., Eckerskorn, C., Brodeur, G. M., Reynolds, C. P., Seeger, R. C., Lottspeich, F., Strahler, J. R., Hanash, S. M., J. Clin. Invest. 1991, 88, 341-345.
46. Kuick, R., Hanash, S. M., Chu, E. H. Y., Strahler, J. R., Electrophoresis 1987, 8, 199-204.
47. Dearolf, C. R., Tripoulas, N., Biggs, J., Shearn, A.. Develop. Biol. 1988, 129, 169-178.
48. Strahler, J. R., Kuick, R., Hanash, S. M., in: Creighton, T., Protein Structure: A Practical Approach, IRL Press Ltd., 1989 Oxford, pp. 65-92.
49. Leone, A., Seeger, R. C., Hong, C. M., Hu, Y. Y., Arboleda, M. J., Brodeur, G. M., Stram, D., Slamon, D. J., Steeg, P. S., Oncogene 1993, 8, 855-865.
50. Zou, M., Shi, Y., al-Sedairy, S., Farid, N. R., Bri. J. Cancer 1993, 68, 385-388.
51. Nakamori, S., Ishikawa, O., Ohigashi, H., Imaoka, S., Sasaki, Y., Kameyama, M., Kabuto, T., Furukawa, H., Iwanakaga, T., Kimura, N., Int. J. Pancreatol. 1993, 14, 125-133.
52. Engel, M., Theisinger, B., Seib, T., Seitz, G., Huwer, H., Zang, K. D., Welter, C., Dooley, S., Cancer 1993, 55, 375-379.
53. Igawa, M., Rukstalis, D. B., Tanabe, T., Chodak, G. W., Cancer Res. 1994, 54, 1313-1318.
54. Wang, Y., Liao, P.-C., Allison, J., Gage, D., Andrews, P., Lubman, D., Hanash, S., Strahler, J., J. Biol. Chem. 1993, 268, 14269-14277.
55. Strahler, J. R., Hailat, N., Lamb, B. J., Rogers, K. P., Underhill, J., Melhem, R. F., Keim, D. R., Zhu, X.-X., Kuick, R. D., Fox, D. A., Hanash, S. M., Immunol. 1992, 149, 1191-1198.
56. Strahler, J. R., Kuick, R., Hanash, S. M., Biochem. Biophys. Commun. 1991, 175, 134-142.
57. Robbins, B. A., de la Vega, D., Ogata, K., Tan, E. M., Nakamura, R. M., Arch. Pathol. Lab. Med. 1987, 111, 841-845.
58. Takasaki, Y., Robinson, W. A., Tan, E. M., J. Nat. Cancer Inst. 1984, 73, 655-661.
59. Keim, D., Hailat, N., Kuick, R., Reynolds, C. P., Brodeur, G. M., Seeger, R. C., Hanash, S. M., Clin. Exp. Metastasis 1993, 11, 83-90.
60. Kawasaki, H., Mukai, K., Yajima, S., Tanaka, R., Takayama, J., Takasaki, Y., Ohira, M., Med. Pediatr. Oncol. 1995, 24, 300-304.
61. Ungar, D. R., Hailat, N., Strahler, J. R., Kuick, R. D., Brodeur, G. M., Seeger, R. C., Reynolds, C. P., Hanash, S. M., J. Nat. Cancer Inst. 1994, 86, 780-784.
62. Kuick, R., Asakawa, J.-I., Neel, J. V., Kodaira, M., Saloh, C., Thoraval, D., Gonzalez, I. L., Hanash, S. M., Genetics 1996, in press.
63. Thoraval, D. H., Asakawa, J.-I., Wimmer, K., Kuick, R., Lamb, B., Richardson, B., Ambros, P., Glover, T. W., Hanash, S. M., Genes, Chromosomes Cancer 1996, in press.
64. Miwa, W., Yashima, K., Sekine, T., Sekiya, T., Electrophoresis 1995, 16, 227-232.
65. Royle, N., Hill, M., Jeffreys, A., Proc. Royal Soc. London: Series B 1992, 247, 57-61.
66. Squire, J. R., Thorner, P. S., Weitzman, S., Maggi, J. D., Dirks, P., Doyle, J., Hale, M., Godbout, R., Oncogene 1995, 10, 1417-1422.
67. Tonin, P. N., Yeger, H., Stallings, R. L., Srinivasan, P. R., Lewis, W. H., Oncogene 1989, 4, 1117-1121.
68. George, R. E., Kenyon, R. M., McGuckin, A. G., Malcolm, A. J., Pearson. A. D. J., Lunec, J., Oncogene 1996, 12, 1583-1587.
69. Van Roy, N., Forus, A., Myklebost, O., Cheng, N. C., Versteeg, R., Speleman, F., Cancer Genet. Cytogenet. 1995, 82, 151-154.
70. Schwab, M., Alitalo, K., Klempnauer, J.-H., Varmus, H. E., Bishop, J. M., Gilbert, F., Brodeur, G., Goldstein, M., Trent, J., Nature 1983, 305, 245-248.
71. Willnow, V., Arch. Geschwulstforsch. 1979, 49, 211-219.
72. Wagner, H. P., Kaser, H., Eur. J. Cancer 1970, 6, 369-372.
73. Tay, D. L. M., Bhathal, P. S., Fox, R. M., J. Clin. Invest. 1990, 87, 519-527.
74. Cohn, S. L., Rademaker, A. W., Salwen, H. R., Franklin, W. A., Gonzales-Crussi, F., Rosen, S. T., Bauer, K. D., Am. J. Pathol. 1990, 136, 1043-1052.
75. Cohn, S. L., Salwen, H., Quasney, M. W., Ikegaki, N., Cowan, J. M., Herst, C. V., Kennett, R. H., Rosen, S. T., DiGuisseppe, J. A., Brodeur, G. M., Oncogene 1990, 5, 1821-1827.
76. Hammerling, U., Bjelfman, C., Pahlman, S., Oncogene 1987, 2, 73-77.
77. Fawcett, J. J., Longmire, J. L., Martin, J. C., Deaven, L. L., Cram, L. S., Methods Cell Biol. 1994, 42, 319-330.
78. Wimmer, K., Thoraval, D., Asakawa, J., Kuick, R., Kodaira. M., Lamb, B., Fawcett, J., Glover, T., Cram, S., Hanash, S., Genomics, in press.