Peptide characterization by mass spectrometry

Methods in Enzymology

Volumn 271, Issue , 1996, Pages 427-448

  Gillece Castro, Beth L ^a   Stults, John T ^a  

^a NONE

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

PROTEIN;

AMINO ACID ANALYSIS; AMINO ACID SEQUENCE; ARTICLE; DISULFIDE BOND; MASS SPECTROMETRY; PEPTIDE ANALYSIS; PRIORITY JOURNAL; PROTEIN DEGRADATION; PROTEIN MODIFICATION;

EID: 0029791596     PISSN: 00766879     EISSN: None     Source Type: Book Series    
DOI: 10.1016/s0076-6879(96)71020-0     Document Type: Article

References (73)

1. M. Barber, R. S. Bordoli, R. D. Sedgwick, and A. N. Tyler, Nature 293, 270 (1981).
2. W. E. Seifert, Jr., and R. M. Caprioli, Methods Enzymol. 270, Chap. 20, 1996.
3. W. Aberth, K. M. Straub, and A. L. Burlingame, Anal. Chem. 54, 2029 (1982).
4. C. M. Whitehouse, R. N. Dreyer, M. Yamashita, and J. B. Fenn, Anal Chem. 57, 675 (1985).
5. R. D. Smith, C. J. Berinaga, and H. R. Udseth, Anal. Chem. 60, 1948 (1988).
6. T. R. Covey, R. Bonner, B. Shushan, and J. D. Henion, Rapid Commun. Mass Spectrom. 2, 249 (1988).
7. J. B. Fenn. M. Mann, C. K. Meng. S. F. Wong, and C. M. Whitehouse. Science 246, 64 (1989).
8. M. Mann, Org. Mass Spectrom. 25, 575 (1990).
9. I. Jardine Nature (London) 345, 747 (1990).
10. S. K. Chowdhury, V. Katta, and B. T. Chait, Biochem. Biophys. Res. Commun. 167, 686 (1990).
11. C. M. Whitehouse and F. Banks, Jr., Methods Enzymol 270, Chap. 21, 1996.
12. K. M. Swiderek, T. D. Lee, J. E. Shively, Methods Enzymol. 271, Chap. 3, 1996 (this volume).
13. R. D. Smith. H. R. Udseth, J. H. Wahl, D. R. Goodlet, and S. A. Hofstadler, Methods Enzymol. 271, Chap. 19, 1996 (this volume).
14. B. S. Larsen and C. N. McEwen, J. Am. Soc. Mass Spectrom. 2, 205 (1991).
15. R. B. Cody, J. Tamura, and B. D. Musselman. Anal. Chem. 64, 1561 (1992).
16. K. D. Henry and F. W. McLafferty, Org. Mass Spectrom. 25, 490 (1990).
17. R. C. Beavis and B. T. Chait, Methods Enzymol. 270, Chap. 22, 1996.
18. M. Karas and F. Hillenkamp, Anal. Chem. 60, 2299 (1988).
19. F. Hillenkamp, M. Karas, R. Beavis, and B. T. Chait, Anal. Chem. 63, 1793 (1991).
20. S. Geromanos, P. Casteels, C. Elicone, M. Powell, and P. Tempst, in "Techniques in Protein Chemistry V" (J. W. Crabb and W. A. Jones, eds.), p. 143. Academic Press, San Diego. CA, 1994.
21. R. Wang, B. T. Chait, and S. B. H. Kent, in "Techniques in Protein Chemistry IV" (R. H. Angeletti, ed.), p. 471. Academic Press, San Diego. CA, 1993.
22. M. Billeci and J. T. Stults. Anal. Chem. 65, 1709 (1993).
23. W. J. Henzel, T. M. Billeci. J. T. Stults. S. C. Wong, C. Grimley, and C. Watanabe, Proc. Nat. Acad. Sci. U. S. A. 90, 5011 (1993).
24. K. R. Jennings and G. G. Dolnikowski, Methods Enzymol. 193, 37 (1990).
25. R. A. Yost and R. K. Boyd. Methods Enzymol. 193, 154 (1990).
26. R. N. Hayes and M. L. Gross, Methods Enzymol. 193, 237 (1990).
27. W. S. Hancock, A. Apffel, J. Chakel, T. M'Timkulu, and A. W. Guzetta, Methods Enzymol. 271, Chap. 17, 1996 (this volume).
28. R. S. Johnson and K. Biemann, Biol. Environ, Mass Spectrom. 18, 945 (1989).
29. K. Sato, T. Asada, M. Ishihara, F. Kunihiro, Y. Kammei, E. Kubota, C. E. Costello, S. A. Martin, H. A. Scoble, and K. Biemann, Anal. Chem. 59, 1652 (1987).
30. D. F. Hunt, J. R. Yates, III, J. Shabanowitz, S. Winston, and C. R. Hauer, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83, 6233 (1986).
31. J. J. Conboy and J. D. Henion, J. Am. Soc. Mass Spectrom. 3, 804 (1992).
32. M. J. Huddleston, M. F. Bean, and S. A. Carr, Anal. Chem. 65, 877 (1993).
33. W. J. Henzel, J. H. Bourell, and J. T. Stults, Anal. Biochem. 187, 228 (1990).
34. J. R. Yates, Methods Enzymol. 271, Chap. 15, 1996 (this volume); W. S. Hancock, A. Apffel, J. Chakel, C. Sounders, T. M'Timkulu, and A. W. Guzetta, Chap. 17, 1996 (this volume).
35. J. R. Yates, Methods Enzymol. 271, Chap. 15, 1996 (this volume); W. S. Hancock, A. Apffel, J. Chakel, C. Sounders, T. M'Timkulu, and A. W. Guzetta, Chap. 17, 1996 (this volume).
36. D. Marriott, B. Gillece-Castro, and C. M. Gorman, Mol. Endocrinol. 1441 (1992).
37. I. J. Amster, M. A. Baldwin, M. T. Cheng, C. J. Proctor, and F. W. McLafferty, J. Am. Chem. Soc. 105, 1654 (1983).
38. W. Heerma, J. P. Kamerling, A. J. Slotboom, G. J. M. van Scharrenburg, B. N. Green, and I. A. S. Lewis. Biol. Mass Spectrom. 10, 13 (1983).
39. T. Matsuo, H. Matsuda, S. Aimoto, Y. Shimonishi, T. Higuchi, and Y. Maruyama, Int. J. Mass Spectrom. Ion Process. 46, 423 (1983).
40. K. Eckart, H. Schwartz, K. B. Tomer, and M. L. Gross, J. Am. Chem. Soc. 107, 6765 (1985).
41. K. Biemann and H. A. Scoble, Science 237, 992 (1987).
42. E. A. Robinson, T. Yoshimura. E. J. Leonard, S. Tanaka, P. R. Griffin, J. Shabanowitz, D. F. Hunt, and E. Appella. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86, 1850 (1989).
43. S. A. Carr, B. N. Green, M. E. Heming, G. D. Roberts, R. J. Anderegg, and R. Vickers, in "Proceedings of 35th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics. Denver, CO, 1987."
44. S. Akashi, K. Hirayama, A. Murai, M. Arai, S. Murao, R. Takahashi, K.-i. Fukuhara. N. Oouchi, K. Tanaka, and I. Nojima, Biochemistry 26, 6483 (1987).
45. D. M. Desiderio, Int. J. Mass Spectrom. Ion Process. 74, 217 (1986).
46. H. R. Morris and P. Pucci. Biochem. Biophys. Res. Commun. 126, 1122 (1985).
47. M. Buko and B. A. Fraser, Biol. Mass Spectrom. 12, 577 (1985).
48. J. T. Stults, J. H. Bourell, E. Canova-Davis, V. T. Ling, G. R. Laramee, J. E. Winslow, P. R. Griffin, E. Rinderknecht, and R. L. Vandlen, Biomed. Environ. Mass Spectrom. 19, 655 (1990).
49. T. Krishnamurthy, L. Szafraniee, D. F. Hunt, J. Shabanowitz, J. R. Yates, III, C. R. Hauer, W. W. Carmichael, O. Skulberg, G. A. Codd, and S. Missler, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86, 770 (1989).
50. A. M. Falick and D. A. Maltby, Anal. Biochem. 182, 165 (1989).
51. D. S. Wagner, A. Salari, D. A. Gage, J. Leykam, J. Fetter, R. Hollingsworth, and J. T. Watson, Biol. Mass Spectrom. 20, 419 (1991).
52. J. T. Stults. J. Lai, S. McCune, and R. Wetzel, Anal. Chem. 65, 1703 (1993).
53. B. W. Gibson and P. Cohen. Methods Enzymol. 193, 480 (1990).
54. M. J. Huddleston, R. S. Annan, M. F. Bean, and S. A. Carr. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 4, 710 (1993).
55. T. Covey, B. Shushan, R. Bonner, W. Schroder, and F. Hucho, in "Methods in Protein Sequence Analysis" (H. Jörnvall, J. O. Hoög, and A. M. Gustavsson, eds.), p. 249. Birkhauser, Basel, Switzerland, 1991.
56. D. A. Sanders, B. L. Gillece-Castro, A. M. Stock, A. L. Burlingame, and J. D. E. Koshland, J. Biol. Chem. 264, 21770 (1989).
57. D. A. Sanders, B. L. Gillece-Castro, A. L. Burlingame, and J. D. E. Koshland, J. Bacteriol. 174, 5117 (1992).
58. K. F. Medzihradszky, B. L. Gillece-Castro, C. A. Settineri, R. R. Townsend, F. R. Masiarz, and A. L. Burlingame, Biomed. Environ. Mass Spectrom. 19, 777 (1990).
59. C. A. Settineri, K. F. Medzihradszky, F. R. Masiarz, A. L. Burlingame, C. Chu, and C. George-Nascimento, Biomed. Environ. Mass Spectrom. 19, 665 (1990).
60. R. S. Johnson and K. Biemann, Biochemistry 26, 1209 (1987).
61. K. F. Medzihradszky, B. F. Gibson, S. Kaur, Z. Yu, D. Medzihradszky, A. L. Burlingame, and N. M. Bass, Eur. J. Biochem. 327, 203 (1992).
62. S. C. Hall, D. M. Smith, F. R. Masiarz, V. W. Soo, H. M. Tran, L. B. Epstein, and A. L. Burlingame. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90, 1927 (1993).
63. D. F. Hunt, R. A. Henderson, J. Shabanowitz, K. Sakaguchi, H. Michel, N. Sevilir, A. L. Cox. E. Appelle, and V. H. Engelhard, Science 255, 1261 (1992).
64. E. L. Huczko, W. M. Bodnar, D. Benjamin, K. Sakaguchi, N. Z. Zhu, J. Shabanowitz, R. A. Henderson, E. Appella, D. F. Hunt, and V. H. Engelhard, J. Immmunol. 151, 2572 (1993).
65. A. M. Falick, W. M. Hines, K. F. Medzihradszky, M. A. Baldwin, and B. W. Gibson, J. Am. Soc. Mass Spectrom. 4, 882 (1993).
66. S. Guan, M. C. Wahl, and A. G. Marshall, Anal. Chem. 65, 3647 (1993).
67. R. C. Beavis and B. T. Chait. Methods Enzymol. 270, Chap. 22, 1996.
68. K. A. Cox, J. D. Williams, R. G. Cooks, and R. E. Kaiser Jr., Biol. Mass Spectrom. 21, 226 (1992).
69. V. M. Doroshenko and R. J. Cotter 7, 822 (1993).
70. J. C. Schwartz, and I. Jardine, Methods Enzymol. 270, Chap. 23, 1996.
71. R. S. Johnson, S. A. Martin, and K. Biemann, Int. J. Mass Spectrom. Ion Process. 86, 137 (1988).
72. L. M. Nuwaysir and T. Sakuma. unpublished results (1993).
73. V. Ling, A. W. Guzzetta, E. Canova-Davis, J. T. Stults, and W. S. Hancock, Anal. Chem. 63, 2909 (1991).