Complete Assignment of Cytochrome c Resonance Raman Spectra via Enzymatic Reconstitution with Isotopically Labeled Hemes

Journal of the American Chemical Society

Volumn 115, Issue 26, 1993, Pages 12446-12458

  Hu, Songzhou ^a   Spiro, Thomas G ^a   Morris, Ian K ^b   Singh, Jai P ^b   Smith, Kevin M ^b  

^a PRINCETON UNIVERSITY   (United States)

^b UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 0027818118     PISSN: 00027863     EISSN: 15205126     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ja00079a028     Document Type: Article

References (93)

1. Spiro, T. G., Ed. Biological Applications of Raman Spectroscopy; Wiley: New York, 1988; Vol. III.
2. Abe, M. In Advances in Spectroscopy; Clark, R. J. H., Hester, R. E., Eds., Wiley: New York, 1986, Vol. 13, pp 347–393.
3. Kitagawa, T., Ozaki, Y. Struct. Bonding 1987, 64, 71–114.
4. Spiro, T. G., Czernuszewicz, R. S., Li, X.-Y. Coord. Chem. Rev. 1990, 100, 541–571.
5. Spiro, T. G.; Smulevich, G.; Su, C. Biochemistry 1990, 29, 4497–4508.
6. Procyk, A. D.; Bocian, D. F. Annu. Rev. Phys. Chem. 1992, 43, 465–496.
7. Spiro, T. G.; Strekas, T. C. Proc. Nat. Acad. Sci. U.S.A. 1972, 69, 2622–2626.
8. Strekas, T. C.; Spiro, T. G. Biochim. Biophys. Acta 1972, 278, 188–192.
9. Spaulding, L. D.; Chang, C. C.; Yu, N.-T.; Felton, R. H. J. Am. Chem. Soc. 1975, 97, 2517.
10. Parthasarathi, N.; Hansen, C.; Yamaguchi, S.; Spiro, T. G. J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, 3865–3871.
11. Prendergast, Κ.; Spiro, T. G. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 3793–3801.
12. Desbois, A.; Lutz, M.; Banerjee, R. Biochemistry 1979, 18, 1510–1518.
13. Babcock, G. T.; Callahan, P. M.; Ondrias, M. R.; Salmeen, I. Biochemistry 1981, 20, 959–966.
14. Choi, S.; Lee, J. J.; Wei, Y. H.; Spiro, T. G. J. Am. Chem. Soc. 1983, 105, 3692–3707.
15. Teraoka, J.; Kitagawa, T. J. Biol. Chem. 1981, 256, 3969–3977.
16. Abe, M.; Kitagawa, T.; Kyogoku, Y. J. Chem. Phys. 1978, 69, 4526–4534.
17. Li, X.-Y.; Czernuszewicz, R. S.; Kincaid, J. R.; Stein, P.; Spiro, T. G. J. Phys. Chem. 1990, 94, 47–61.
18. Li, X.-Y.; Czernuszewicz, R. S.; Kincaid, J. R.; Spiro, T. G. J. Am. Chem. Soc. 1989, 111, 7012–7023.
19. Lee, H.; Kitagawa, T.; Abe, M.; Pandey, P. Κ.; Leung, H.-K.; Smith, K. M. J. Mol. Struct. 1986, 146, 329–347.
20. Choi, S.; Spiro, T. G.; Langry, K. C.; Smith, K. M. J. Am. Chem. Soc. 1982, 104, 4337.
21. Choi, S.; Spiro, T. G.; Langry, K. C.; Smith, K. M.; Budd, L. D.; La Mar, G. N. J. Am. Chem. Soc. 1982, 104, 4345.
22. Willems, D. L.; Bocian, D. F. J. Phys. Chem. 1985, 89, 234–239.
23. Dickerson, R. E.; Kopka, M. L.; Borders, C. L., Jr.; Varnum, J. C.; Weinzierl, J. E.; Margoliash, E. J. Mol. Biol. 1967, 29, 77–95.
24. Dickerson, R. E.; Kopka, M. L.; Weinzierl, J. E.; Varnum, J. C.; Eisenberg, D.; Margoliash, E. J. Biol. Chem. 1967, 242, 3015–3018.
25. Takano, T.; Kallai, Ο. B.; Swanson, R.; Dickerson, R. E. J. Biol. Chem. 1973, 248, 5234–5255.
26. Takano, T.; Dickerson, R. E. J. Mol. Biol. 1981, 153, 79–94.
27. Takano, T.; Dickerson, R. E. J. Mol. Biol. 1981, 153, 95–115.
28. Louie, G.; Brayer, G. D. J. Mol. Biol. 1990, 214, 527–555.
29. Berghuis, A. M.; Brayer, G. D. J. Mol. Biol. 1992, 223, 959–976.
30. McLendon, G. Acc. Chem. Res. 1988, 21, 160–167.
31. Mauk, A. G. Struct. Bonding 1991, 75, 131–157.
32. Hildebrandt, P.; English, A. M.; Smulevich, G. Biochemistry 1992, 31, 2384–2392.
33. Yu, N.-T.; Srivastava, R. B. J. Raman Spectrosc. 1980, 9, 166–171.
34. Teale, F. W. J. Biochim. Biophys. Acta 1959, 35, 543.
35. Kenner, G. W.; Smith, K. M.; Sutton, M. J. Tetrahedron Lett. 1973, 1303–1306.
36. Budd, D. L.; La Mar, G. N.; Langry, K. C.; Smith, K. M.; Nayyir-Mazhir, R. J. Am. Chem. Soc. 1979, 101, 6091–6096.
37. Basile, G.; Bello, C. D.; Taniuchi, H. J. Biol. Chem. 1980, 255, 7181–7191.
38. Fisher, W. R.; Taniuchi, H.; Anfinsen, C. B. J. Biol. Chem. 1973, 248, 3188–3195.
39. Tzagoloff, A. J. Biol. Chem. 1969, 244, 5020–5026.
40. Korb, H.; Neupert, W. Eur. J. Biochem. 1978, 91, 609–620.
41. Zimmermann, R.; Paluch, U.; Neupert, W. FEBS Lett. 1979, 108, 141–146.
42. Hennig, B.; Neupert, W. Eur. J. Biochem. 1981, 721, 203–212.
43. Taniuchi, H.; Basile G.; Taniuchi, M.; Veloso, D. J. Biol. Chem. 1983, 258, 10963–10966.
44. Veloso, D.; Juillerat, M.; Taniuchi, H. J. Biol. Chem. 1984, 259, 6067–6073.
45. Visco, C.; Taniuchi, H.; Berlett, B. S. J. Biol. Chem. 1985, 260, 6133–6138.
46. Nicholson, D. W.; Kohler, H.; Neupert, W. Eur. J. Biochem. 1987, 164, 147–157.
47. Dumont, M. E.; Ernst, J. F.; Hampsey, D. M.; Sherman, F. EMBO J. 1987, 6, 235–241.
48. Nicholson, D. W.; Hergersberg, C.; Neupert, W. J. Biol. Chem. 1988, 263, 19034–19042.
49. Dumont, M. E.; Ernst, J. F.; Hampsey, D. M.; Sherman, F. J. Biol. Chem. 1988, 263, 15928–15937.
50. Nicholson, D. W.; Neupert, W. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1989, 86, 4340–4344.
51. Gonzales, D. H.; Neupert, W. J. Bioenerg. Biomembr. 1990, 22, 753–768.
52. Hakvoort, T. B. M.; Sprinkle, J. R.; Margoliash, E. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1990, 87, 4996–5000.
53. Stuart, R. A.; Nicholson, D. W.; Wienhues, U.; Neupert, W. J. Biol. Chem. 1990, 265, 20210–20219.
54. Morton, R. Κ.; Sturtevant, J. M. J. Biol. Chem. 1964, 239, 1614–1624.
55. Errede, B. J.; Kamen, M. D. Biochemistry 1978, 17, 1015–1027.
56. Sherman, F.; Taber, H.; Campbell, W. J. Mol. Biol. 1965, 13, 21–39.
57. Friedman, J. M.; Rousseau, D. L. Chem. Phys. Lett. 1978, 55, 488–492.
58. Strekas, T. C.; Spiro, T. G. Biochim. Biophys. Acta 1974, 351, 237–245.
59. Kitagawa, T.; Ozaki, Y.; Teraoka, J.; Kyogoku, Y.; Yamanaka, T. Biochim. Biophys. Acta 1977, 494, 100–114.
60. Kitagawa, T.; Ozaki, Y.; Kyogoku, Y.; Horio, T. Biochim. Biophys. Acta 1977, 495, 1–11.
61. Forster, M.; Hester, R. E.; Cartling, B.; Wilbrandt, R. Biophys. J. 1982, 38, 111–116.
62. Cartling, B. Biophys. J. 1983, 43, 191–205.
63. Myer, Y. P.; Srivastava, R. B.; Kumar, S.; Raghavendra, K. J. Protein Chem. 1983, 2, 13–42.
64. Uno, T.; Nishimura, Y.; Tsuboi, M. Biochemistry 1984, 23, 6802–6808.
65. Hildebrandt, P.; Stockburger, M. J. Phys. Chem. 1986, 90, 6017–6024.
66. Verma, A. L.; Kimura, Κ.; Nakamura, A.; Yagi, T.; Inokuchi, H.; Kitagawa, T. J. Am. Chem. Soc. 1988, 110, 6617–6623.
67. Hildebrandt, P.; Stockburger, M. Biochemistry 1989, 28, 6722–6728.
68. Hildebrandt, P.; Stockburger, M. Biochemistry 1989, 28, 6710–6721.
69. Larsen, R. W.; Chavez, M. D.; Nunez, D. J.; Davidson, M. W.; Knaff, D. B.; Krulwich, T. A.; Ondrias, M. R. Arch. Biochem. Biophys. 1990, 283, 266–270.
70. Hildebrandt, P. Biochim. Biophys. Acta 1990, 1040, 175–186.
71. Heibel, G.; Griebenow, Κ.; Hildebrandt, P. Biochim. Biophys. Acta 1991, 1060, 196–202.
72. Heimburg, T.; Hildebrandt, P.; Marsh, D. Biochemistry 1991, 30, 9084–9089.
73. Wand, A. J.; DeStefano, D. L.; Feng, Y.; Roder, H.; Englander, S. W. Biochemistry 1989, 28, 195–203.
74. Feng, Y.; Roder, H.; Englander, S. W. Biochemistry 1990, 29, 3494–3504.
75. Feng, Y.; Englander, S. W. Biochemistry 1990, 29, 3505–3509.
76. Friedman, J. M.; Hochstrasser, R. M. Chem. Phys. 1973, 1, 457–467.
77. Friedman, J.; Hochstrasser, R. M. Chem. Phys. Lett. 1975, 32, 414–419.
78. Friedman, J. M.; Hochstrasser, R. M. J. Am. Chem. Soc. 1976, 98, 4043–4048.
79. Valance, W. G.; Strekas, T. C. J. Phys. Chem. 1982, 86, 1804–1808.
80. Srivastava, R. B.; Pace, C.; Yu, N.-T. J. Raman Spectrosc. 1981, 11, 20–23.
81. Schweitzer-Stenner, R.; Bobinger, U.; Dreybrodt, W. J. Raman Spectrosc. 1990, 22, 65–78.
82. Kitagawa, T.; Abe, M.; Ogoshi, H. J. Chem. Phys. 1978, 69, 4516–4525.
83. Willems, D. L.; Bocian, D. F. J. Am. Chem. Soc. 1984, 106, 880–890.
84. Mitchell, M. L.; Li, X.-Y.; Kincaid, J. R.; Spiro, T. G. J. Phys. Chem. 1987, 91, 4690.
85. Champion, P. M.; Stallard, B.; Wagner, G. C.; Gunsalus, I. C. J. Am. Chem. Soc. 1982, 104, 5469.
86. Bangcharoenpaurpong, O.; Champion, P. M.; Hall, Κ.; Hager, L. P. Biochemistry 1986, 25, 2374.
87. Ozols, J.; Strittmatter, P. J. Biol. Chem. 1964, 239, 1018–1023.
88. Harbury, H. A.; Loach, P. A. J. Biol. Chem. 1960, 235, 3640.
89. Shelnut, J. A.; Medforth, C. J.; Berber, M. D.; Barkigia, K. M.; Smith, K. M. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 4077–4087.
90. Shelnut, J. A.; Majumder, S. A.; Sparks, L. D.; Hobbs, J. D.; Medforth, C. J.; Senge, M. O.; Smith, K. M.; Miura, M.; Luo, L.; Quirke, J. M. E. J. Raman Spectrosc. 1992, 23, 523–529.
91. Barkigia, K. M.; Berber, M. D.; Fajer, J.; Medforth, C. J.; Renner, M. W.; Smith, K. M. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 8851–8857.
92. Shelnut, J. A.; Cheung, L. D.; Cheng, C. C.; Yu, N.-T.; Felton, R. H. J. Chem. Phys. 1977, 66, 3387.
93. Spiro, T. G.; Burke, J. M. J. Am. Chem. Soc. 1976, 98, 5482–5489.