β-Sheet topology and the relatedness of proteins

Nature

Volumn 268, Issue 5620, 1977, Pages 495-500

  Richardson, Jane S ^a  

^a DUKE UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

PROTEIN;

MODEL;

EVOLUTION; PROBABILITY THEORY; PROTEIN CONFORMATION; TERMINOLOGY; THERMODYNAMICS;

EID: 0017387723     PISSN: 00280836     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1038/268495a0     Document Type: Article

References (45)

1. Chothia, C. J. molec. Biol. 75, 295-302 (1973).
2. Richardson, J. S. Proc. natn. Acad. Sci. U.S.A. 73, 2619-2623 (1976).
3. Sternberg, M. J. E. & Thornton, J. M. J. molec. Biol. 105, 367-382 (1976).
4. Chothia, C. & Levitt, M. Nature 261, 552-558 (1976).
5. Schulz, G. E. & Schirmer, R. H. Nature 250, 142-144 (1974).
6. Richardson, J. S., Richardson, D. C., Thomas, K. A., Silverton, E. W. & Davies, D. R, J. molec. Biol. 102, 221-235 (1976).
7. Rossman, M. G. & Argos, P. J. molec. Biol. 105, 75-96 (1976).
8. Fenna, R. E. & Matthews, B. W. Brookhaven Syrup. Biol. 28 (in the press).
9. Liljas, A. et al Nature new Biol. 235, 131-137 (1972).
10. Moras, D, et al. J. biol. Chem. 250, 9137-9162 (1975).
11. Poljak, R. J., Amzel, L. M., Chen, B. L., Phizackerly, R. P. & Saul, F. Proc. natn. Acad. Sci. U.S.A. 71, 3440-3444 (1974).
12. Richardson, J. S., Thomas, K. A., Rubin, B. H. & Richardson, D. C. Proc. natn. Acad. Sci. U.S.A. 72, 1349-1353 (1975).
13. Blake, C. C. F., Geisow, M. J., Swan, T. D. A., Rerat, C. & Rerat, B. J. molec. Biol. 88, 1-12 (1974).
14. Quicho, F. A. & Lipscomb, W. N. Adv. Protein Chem. 25, 1-78 (1971).
15. Banner, D. W. et al. Nature 255, 609-614 (1975).
16. Reeke, G. N., Jr., Becker, J. W. & Edelman, G. M. J. biol. Chem. 250, 1525-1547 (1975).
17. Alden, R. A., Birktoft, J. J., Kraut, J., Robertus, J. D. & Wright, C. S. Biochem. biophys. Res. Commun. 45, 337-344 (1971).
18. Birktoft, J. J. & Blow, D, M. J. molec. Biol. 68, 187-240 (1972).
19. Campbell, J. W., Watson, H. C. & Hodgson, G. I. Nature 250, 301-303 (1974).
20. Blake, C. C. F. Essays Biochem. 11, 37-79 (1975).
21. Watenpaugh, K. D., Sieker, L. C., Herriott, J. R. & Jensen, L. H. Acta Crystallogr. B29, 943-956 (1973).
22. Sweet, R. M., Wright, H. T., Janin, J., Chothia, C. H. & Blow, D. M. Biochemistry 13, 4212-4228 (1974).
23. Drenth, J., Jansonius, J. N., Koekoek, R. & Wolthres, B. G. Adv. Protein Chem. 25, 79-115 (1971).
24. Steitz, T. A. Coordinates in Protein Data Bank, (Brookhaven National Laboratory, Upton, Long Island, New York 1973).
25. Chandrasekhar, K., McPherson, A., Adams, M. J. & Rossmann, M. G. J. molec. Biol. 76, 503-528 (1973).
26. Branden, C. I. Coordinates in Protein Data Bank, Brookhaven National Laboratory, Upton, Long Island, New York (1973).
27. Low, B. W. et al. Proc. natn. Acad. Sci. U.S.A. 73, 2991-2994 (1976).
28. Mathews, F. S., Levine, M. & Argos, P. J. molec. Biol. 64, 449-464 (1972).
29. Holmgren, A. Soderberg, B. O., Eklund, H. & Brändén, C. I. Proc. natn. Acad. Sci. U.S.A. 72, 2305-2309 (1975).
30. Anderson, R. D. et al. Proc. natn. Acad. Sci. U.S.A. 69, 3189-3191 (1972).
31. Arnone, A. et al. J. biol. Chem. 246, 2302-2316 (1971).
32. Wyckoff, H. W. et al. J. biol. Chem. 245, 305-328 (1970).
33. Colman, P. M., Jansonius, J. N. & Matthews, B. W. J. molec. Biol. 70, 701-724 (1972).
34. Bergsma, J. et al. J. molec. Biol. 98, 637-643 (1975).
35. Schulz, G. E., Elzinga, M., Marx, F. & Schirmer, R. H. Nature 250, 120-123 (1974).
36. Tmoto, T., Johnson, L. M., North, A. C. T., Phillips, D. C. & Rupley, J. A. The Enzvmes 7, 665-868 (1972).
37. Matthews, B. W. & Remington, S. J. Proc. natn. Acad. Sci. U.S.A. 71, 4178-4182 (1974).
38. Carter, C. W. et al. J. biol. Chem. 249, 4212-4225 (1974).
39. Deisenhofer, J. & Steigemann, W. Acta Crystallogr. B31, 238-250 (1975).
40. Adman, E. T., Seiker, L. C. & Jensen, L. H. J. biol. Chem. 248, 3987-3996 (1973).
41. Bryant, T. N., Watson, H. C. & Wendell, P. L. Nature 247, 14-17 (1974).
42. Wetlaufer, D. B. Proc. natn. Acad. Sci. U.S.A. 70, 697-701 (1973).
43. Nagano, K. J. molec. Biol. 84, 337-372 (1974).
44. Ptitsyn, O. B. & Rashin, A. A. Biophys. Chem. 3, 1-20 (1975).
45. Tanaka, S. & Scheraga, H. A. Proc. natn. Acad. Sci. U.S.A. 72, 3802-380b (1975).