1H NMR investigations on the solution structure of the oligonucleotide 5′-d(ACCT5GATGT)-3′/5′-d(ACATCA 5GGT)-3′ and its interaction with tallimustine

Journal of the Chemical Society. Perkin Transactions 2

Volumn , Issue 1, 1998, Pages 149-158

  Ragg, Enzio ^a   Mazzini, Stefania ^a   Bortolini, Rita ^a   Mongelli, Nicola ^b   D'Alessio, Roberto ^b  

^a UNIVERSITY OF MILAN   (Italy)

^b PFIZER INC   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 0012870537     PISSN: 03009580     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/a702943h     Document Type: Article

References (52)

1. F. C. Giuliani, B. Barbieri, G. Pezzoni, E. Lazzari, F. M. Arcamone and N. Mongelli, Proc. Am. Ass. Cancer Res., 1988, 29, 329.
2. G. Pezzoni, M. Grandi, G. Biasoli, L. Capolongo, D. Ballinari, F. C. Giuliani, B. Barbieri, A. Pastori, E. Pesenti, N. Mongelli and F. Spreafico, Br. J. Cancer, 1991, 64, 1047.
3. R. D'Alessio, C. Geroni, G. Biasoli, E. Pesenti, M. Grandi and N. Mongelli, Bioorg. Med. Chem. Lett., 1994, 4, 1467.
4. D. Abigerges, G. P. Armand, L. Da Costa, E. Fadel, D. Mignard, C. Lhomme, M. G. Zurlo and D. Gandia, Proc. Am. Ass. Cancer Res., 1993, 34, 1589.
5. F. M. Arcamone, F. Animati, B. Barbieri, E. Configliacchi, R. D'Alessio, C. Geroni, F. C. Giuliani, E. Lazzari, M. Menozzi, N. Mongelli, N. S. Penco and M. A. Verini, J. Med. Chem., 1989, 32, 774.
6. C. L. Propst and T. J. Perun, Nucleic Acid Targeted Drug Design, Marcel Dekker, New York, 1992, p. 303.
7. M. D. Wyatt, M. Lee, B. J. Gabiras, R. L. Souhami and J. A. Hartley, Biochemistry, 1995, 34, 13 034.
8. M. Broggini, H. M. Coley, N. Mongelli, E. Pesenti, M. D. Wyatt, J. A. Hartley and M. D'Incalci, Nucleic Acids Res., 1995, 23, 81.
9. C. Szezylik, T. Skorski, N. C. Nicoladeis, L. Manzella, L. Malaguarnera, D. Venturelli, A. M. Gewirtz and B. Calabretta, Science, 1991, 253, 562.
10. F. X. Mahon, F. Belloc and J. Reiffers, Lancet, 1993, 341, 566.
11. J. Jeener, B. M. Meier, P. Bachmann and R. R. Ernst, J. Chem. Phys., 1979, 71, 4546.
12. S. Macura and R. R. Ernst, Mol. Phys., 1980, 41, 95.
13. L. Braunschweiler and R. R. Ernst, J. Magn. Res., 1983, 53, 521.
14. G. Otting, R. Grutter, W. Leupin, C. Minganti, K. N. Ganesh, B. S. Sproat, M. J. Gait and K. Wütrich, Eur. J. Biochem., 1987, 166, 215.
15. A. C. Wang, S. G. Kim, P. F. Flynn, E. Sletten and B. R. Reid, J. Magn. Reson., 1992, 100, 358.
16. K. Wüthrich, NMR of Proteins and Nucleic Acids, Wiley, New York, 1986.
17. P. Rajagopal, D. E. Gilbert, G. A. van der Marel, J. H. van boom and J. Feigon, J. Magn. Reson., 1988, 78, 526.
18. R. Boelens, T. M. G. Koning, G. A. van der Marel, J. H. van Boom and R. Kaptein, J. Magn. Reson., 1989, 82, 290.
19. A. Saran, D. Perahia and B. Pullman, Theor. Chim. Acta (Berlin), 1973, 30, 31.
20. R. E. Dickerson and H. R. Drew, J. Mol. Biol., 1981, 149, 761.
21. D. G. Gorenstein, Chem. Rev., 1994, 94, 1315.
22. R. E. Dickerson, J. Mol. Biol., 1983, 166, 419.
23. C. R. Calladine. J. Mol. Biol., 1982, 161, 343.
24. M. Katahira, H. Sugeta, Y. Kyogoku, S. Fujisawa and R. Tomita, Nucleic Acids Res., 1988, 16, 8619.
25. M. Katahira, H. Sugeta and Y. Kyogoku, Nucleic Acids Res., 1990, 18, 613.
26. M. Coll, C. A. Frederick, A. H. J. Wang and A. Rich, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1987, 84, 8385.
27. W. Saenger, Principles of Nucleic Acid Structure, Springer-Verlag, New York, 1984. p. 266 and references therein.
28. (a) K. Zakrzewska and B. Pullman, Nucleic Acids Res., 1983, 11, 8841;
29. (b) R. Lavery, A. Pullman and B. Pullman, Theor. Chim. Acta, 1982, 62, 93;
30. (c) K. W. Kohn, J. A. Hartley and W. B. Mattes, Nucleic Acids Res., 1987, 15, 10 531.
31. D. Neuhaus and M. P. Williamson, The Nuclear Overhauser Effect in Structural and Conformational Analysis, VCH, New York, 1986, p. 175.
32. S. Mazzini, G. Musco and E. Ragg, Magn. Reson. Chem., 1994, 32, 139.
33. J. G. Pelton and D. Wemmer, Biochemistry, 1988, 27, 8088.
34. T. J. Dwyer, B. H. Geierstanger, Y. Bathini, J. W. Lown and D. E. Wemmer, J. Am. Chem. Soc., 1992, 114, 5911.
35. J. G. Pelton and D. E. Wemmer, J. Am. Chem. Soc., 1990, 112, 1393.
36. R. E. Klevit, D. E. Wemmer and B. Reid, Biochemistry, 1986, 25, 3296.
37. P. G. Schutz and P. B. Dervan, J. Am. Chem. Soc., 1983, 105, 7748.
38. R. P. Hertzberg and P. B. Dervan, J. Am. Chem. Soc., 1982, 104, 313.
39. (a) M. L. Kopka, C. Yoon, D. Goodsell, P. Pjura and R. E. Dickerson, J. Mol. Biol., 1985, 183, 553;
40. (b) M. L. Kopka, C. Yoon, D. Goodsell, P. Pjura and R. E. Dickerson, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1985, 82, 1376.
41. M. Coll, J. Aymami, G. A. van der Marel, J. H. van Boom, A. Rich and A. H. J. Wang, Biochemistry, 1989, 28, 310.
42. A. Blasko, K. A. Browne and T. C. Bruice, J. Am. Chem. Soc., 1994, 116, 3726.
43. (a) L. A. Marky and K. J. Breslauer, Biopolymers, 1987, 26, 1601;
44. (b) D. M. Crothers, Biopolymers, 1971, 10, 2147.
45. K. J. Breslauer, R. Frank, H. Blocker and L. A. Marky, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1986, 83, 3746.
46. (a) L. A. Marky and K. J. Breslauer, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1987, 84, 4359;
47. (b) K. J. Breslauer, D. P. Remeta, W. Y. Chou, R. Ferrante, J. Curry, D. Zaunczkowski, J. G. Snyder and L. A. Marky, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1987, 84, 8922.
48. E. L. Fish, M. L. Lane and J. N. Vournakis, Biochemistry, 1988, 27, 6026.
49. M. Fontana, M. Lestingi, C. Mondello, A. Braghetti, A. Montecucco and G. Ciarrocchi, Anti-Cancer Drug Des., 1992, 7, 131.
50. C. J. O'Connor, W. A. Denny, J. Y. Fan, G. Lance Gravatt, B. A. Grigor and D. J. McLennan, J. Chem. Soc., Perkin Trans. 2, 1991, 1933.
51. J. A. Hartley, S. M. Forrow and R. L. Souhami, Biochemistry, 1990, 29, 2985.
52. T. A. Gourdie, K. K. Valu, G. Lance Gravatt, T. J. Boritzki, B. C. Baguley, L. P. G. Wakelin, W. R. Wilson, P. D. Woodgate and W. A. Denny, J. Med. Chem., 1990, 33, 1177.