TIM barrel fold: Structural, functional and evolutionary characteristics in natural and designed molecules

Biologia

Volumn 54, Issue 3, 1999, Pages 231-254

  Pujadas, Gerard ^a   Palau, Jaume ^a  

^a UNIVERSITAT ROVIRA I VIRGILI   (Spain)

Author keywords

Beta alpha barrel; Enzymatic activity; Glycoside hydrolases; Protein design; Protein evolution; TIM barrel; TIM DB

Indexed keywords

EID: 0012118303     PISSN: 00063088     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: None     Document Type: Article

References (165)

1. ANFINSEN, C. B. & SCHERAGA, H. A. 1975. Adv. Protein Chem. 29: 205-300.
2. BABBITT, P. C., HASSON, M. S., WEDEKIND, J. E., PALMER, D. R. J., BARRETT, W. C., REED, G. H., RAYMENT, L, RINGE, D., KENYON, G. L. & GERLT, J. A. 1996. Biochemistry 35: 16489-16501.
3. BABBITT, P. C., MRACHKO, G. T., HASSON, M. S., HUISMAN, G. W., KOLTER, R, RINGE, D., PETSKO, G. A., KENYON, G. L. & GERLT, J. A. 1995. Science 267: 1159-1161.
4. BAINBRIDGE, G., MADGWICK, P., PARMAR, S., MITCHELL, R., PAUL, M., PITTS, J., KEYS, A. J. & PARRY, M. A. J. 1995. J. Exp. Bot. 46: 1269-1276.
5. BANNER, D. W., BLOOMER, A. C., PETSKO, G. A., PHILLIPS, D. C., POGSON, C. L, WILSON, I. A., CORRAN, P. H., FURTH, A. J., MlLMAN, J. D., OFFORD, R. E., PRIDDLE, J. D. & WALEY, S. G. 1975. Nature 255: 609-614.
6. BEAUREGARD, M., GORAJ, K., GOFFIN, V., HEREMANS, K., GOORMAGHTIGH, E., RUYSSCHAERT, J. M. & MARTIAL, J. A. 1991. Protein Eng. 4: 745-749.
7. BIRKTOFT, J. J. & BLOW, D. M. 1972. J. Mol. Biol. 68:187-240.
8. BOLAM, D. N., HUGHES, N., VIRDEN, R., LAKEY, J. H., HAZLEWOOD, G. P., HENRISSAT, B., BRAITHWAITE, K. L. & GILBERT, H. J. 1996. Biochemistry 35: 16195-16204.
9. BORCHERT, T. V., ABAGYAN, R., JAENICKE, R. & WIERENGA, R. K. 1994. Proc. Natl. Acad. Sci.. U.S.A. 91: 1515-1518.
10. BORCHERT, T. V., ABAGYAN, R., KISHAN, K. V. R., ZEELEN, J. P. & WIERENGA, R. K. 1993. Structure 1: 205-213.
11. BORCHERT, T. V., KISHAN, K. V. R., ZEELEN, J. P., SCHLIEBS, W., THANKI, N., ABAGYAN, R., JAENICKE, R. & WIERENGA, R. K. 1995a. Structure 3: 669-679.
12. BORCHERT, T. V., ZEELEN, J. P., SCHLIEBS, W., CALLENS, M., MINKE, W., JAENICKE, R. & WIERENGA, R. K. 1995b. FEBS Lett. 367: 315-318.
13. BORK, P., GELLERICH, J., GROTH, H., HOOFT, R. & MARTIN F. 1995. Protein Sci.. 4: 268-274.
14. BRAITHWAITE, K. L., BARNA, T., SPURWAY, T. D., CHARNOCK, S. J., BLACK, G. W., HUGHES, N., LAKEY, J. H., VIRDEN, R., HAZLEWOOD, G. P., HENRISSAT, B. &: GILBERT, H. J. 1997. Biochemistry 36: 15489-15500.
15. CHAN, H. S. & DILL, K. A. 1989. J. Chem. Phys. 90: 492-509.
16. CHOTHIA, C. 1988. Nature 333: 598-599.
17. CHOTHIA, C. & FINKELSTEIN, A. V. 1990. Annu. Rev. Biochem. 59: 1007-1039.
18. CHOTHIA, C. & JANIN, J. 1982. Biochemistry 21: 3955-3965.
19. COHEN, C. & PARRY, D. A. D. 1990. Proteins 7: 1-15.
20. COULSON, A. F. W. 1994. FEBS Lett. 354: 41-44.
21. CREIGHTON, T. E. 1988. Bioessays 8: 57-63.
22. DARBY, N. & CREIGHTON, T. E. 1995. In: "Protein Stability and Folding (Series: Methods in Molecular Biology)" 40: 219-252.
23. DAVIES, G. & HENRISSAT, B. 1995. Structure 3: 853-859.
24. DEGRADO, W. F. 1988. Adv. Protein Chem 39: 51-124.
25. DEGRADO, W. F., WASSERMANN, Z. R. & LEAR, J. D. 1989. Science 243: 622-628.
26. DEL-RIO, G., MORETT, E. & SOBERON, X. 1997. FEBS Lett. 416: 221-224.
27. DOMINGUEZ, R., SOUCHON, H., LASCOMBE, M. B. & ALZARI, P. M. 1996. J. Mol. Biol. 257: 1042-1051.
28. DURAND, P., LEHN, P., CALLEBAUT, L, FABREGA, S., HENRISSAT, B. &: MORNON, J. P. 1997. Glycobiology 7: 277-284.
29. EADS, J. C., OZTURK, D., WEXLER, T. B., GRUBMEYER, C. & SACCHETTINI, J. C. 1997. Structure 5: 47-58.
30. EBERHARD, M., TSAI-PFLUGFELDER, M., BOLEWSKA, K., HOMMEL, U. & KIRSCHNER, K. 1995. Biochemistry 34: 5419-5428.
31. EDER, J. & WILMANNS, M. 1992. Biochemistry 31: 4437-4444.
32. ERSKINE, P. T., SENIOR, N., AWAN, S., LAMBERT, R., LEWIS, G., TICKLE, L. J., SARWAR, M., SPENCER, P., THOMAS, P., WARREN, M. J., SHOOLINGINJORDAN, P. M., WOOD, S. P. & COOPER, J. B. 1997. Nat. Struct. Biol. 4: 1025-1031.
33. FARBER, G. K. 1993. Gurr. Opin. Struct. Biol. 3: 409-412.
34. FARBER, G. K. & PETSKO, G. A. 1990. Trends Biochem. Sci.. 15: 228-234.
35. FISHER, A. J., THOMPSON, T. B., THODEN, J. B., BALDWIN, T. O. & RAYMENT, I. 1996. J. Biol. Chem. 271: 21956-21968.
36. FOX, K. M. & KARPLUS, P. A. 1994. Structure 2: 1089-1105.
37. GARCÍA-VALLVÉ, S., ROJAS, A., PALAU, J. & ROMEU, A. 1998. Proteins 31: 214-223.
38. GOLDMAN, A., OLLIS, D. L. & STEITZ, T. A. 1987. J. Mol. Biol. 194: 143-153.
39. GORAJ, K., RENARD, A. MARTIAL, J. A. 1990. Protein Eng. 3: 259-266.
40. GOTTSCHALK, T. E., FIEROBE, H. P., MIRGORODSKAYA, E., CLARKE, A. J., TüLL, D., SIGURSKJOLD, B. W., CHRISTENSEN, T., PAYRE, N., FRANDSEN, T. P., JUGE, N., MCGUIRE, K. A., COTTAZ, S., ROEPSTORFF, P., DRIGUEZ, H., WILLIAMSON, G. & SVENSSON, B. 1998. Biochem. Soc. Trans. 26: 198-204.
41. GROMIHA, M. M. & SELVARAJ, S. 1997. J. Biol. Phys. 23: 209-217.
42. HAMPELE, I. C., DARCY, A., DALE, G. E., KOSTREWA, D., NIELSEN, J., OEFNER, C., PAGE, M. G. P., SCHONFELD, H. J., STUBER, D. & THEN, R. L. 1997. J. Mol. Biol. 268: 21-30.
43. HARRIS, G. W., PICKERSGILL, R. W., CONNERTON, I., DEBEIRE, P., TOUZEL, J.P., BRETON, C. & PEREZ, S. 1997. Proteins 29: 77-86.
44. HECHT, M. H., RICHARDSON, J. S., RICHARDSON, D. C. & OGDEN, R. C. 1990. Science 249: 884-891.
45. HEINZ, D. W., ESSEN, L. O. & WILLIAMS, R. L. 1998. J. Mol. Biol. 275: 635-650.
46. HELIN, S., KAHN, P. C., GUHA, B. L., MALLOWS, D. G. & GOLDMAN, A. 1995. J. Mol. Biol. 254: 918-941
47. HENNIG, M., PFEFFERHENNIG, S., DAUTER, Z., WILSON, K. S., SCHLESIER, B. & NONG, V. H. 1995a. Acta Cryst. B51: 177-189.
48. HENNIG, M., JANSONIUS, J. N., TERWISSCHA VAN SCHELTINGA, A. C., DUKSTRA, B. W. & SCHLESIER, B. 1995b.. J. Mol. Biol. 254: 237-246.
49. HENNIG, M., SCHLESIER, B., DAUTER, Z., PFEFFER, S., BETZEL, C., HOHNE, W. E. & WILSON, K. S. 1992. FEBS Lett. 306: 397-408.
50. HENRISSAT, B. 1991. Biochem. J. 280: 309-316.
51. HENRISSAT, B. & BAIROCH, A. 1993. Biochem. J. 293: 781-788.
52. HENRISSAT, B. & BAIROCH, A. 1996. Biochem. J. 316: 695-696.
53. HENRISSAT, B., CALLEBAUT, I., FABREGA, S., LEHN, P., MORNON, J. P. & DAVIES, G. 1995. Proc. Natl. Acad. Sci.. U.S.A. 92: 7090-7094.
54. HENRISSAT, B. & DAVIES, G. 1997. Curr. Opin. Struct. Biol. 7: 637-644.
55. HOOFT, R. W. W., SANDER, C., SCHARF, M. & VRIEND, G. 1996. CABIOS 12: 525-529.
56. HOUBRECHTS, A., MOREAU, B., ABAGYAN, R., MAINFROID, V., PREAUX, G., LAMPROYE, A., PONCIN, A., GOORMAGHTIGH, E., RUYSSCHAERT, J. M., MARTIAL, J. A. & GORAJ, K. 1995. Protein Eng. 8: 249-259.
57. HWANG, K. Y., SONG, H. K., CHANG, C., LEE, J., LEE, S. Y., KIM, K. K., CHOE, S., SWEET, R. M. & SUH, S. W. 1997. Mol. Cells. 7: 251-258.
58. JANECEK, S. 1993a. Int. J. Biol. Macromol. 15: 317-318.
59. JANECEK, S. 1993b. FEBS Lett. 316: 23-26.
60. JANECEK, S. 1994. FEBS Lett. 353: 119-123.
61. JANECEK, S. 1995. Protein Sci.. 4: 1239-1242.
62. JANECEK, S. 1996a. J. Evol. Biol. 9: 1017-1021.
63. JANECEK, S. 1996b. Biochem. J. 319: 1005-1006.
64. JANECEK, S. 1996c. Protein Sci.. 5: 1136-1143.
65. JANECEK, S. 1997. Int. J. Biol. Macromol. 21: 277-280.
66. JANECEK, S. & BALAZ, S. 1993. J. Protein Chem. 12: 509-514.
67. JANECEK, S. & BALAZ, S. 1995. Protein Eng. 8: 809-813.
68. JANECEK, S. & BATEMAN, A. 1996. Biologia, Bratislava 51: 613-628.
69. JANECEK, S., MACGREGOR, E. A. & SVENSSON, B. 1995. Biochem. J. 305: 685-686.
70. JANECEK, S., SVENSSON, B. & HENRISSAT, B. 1996. Chem. Listy 90: 590-591.
71. JENKINS, J., LO-LEGGIO, L., HARRIS, G. & PICKERSGILL, R. 1995. FEBS Lett. 362: 281-285.
72. JEZ, J. M., BENNETT, M. J., SCHLEGEL, B. P., LEWIS, M. & PENNING, T. M. 1997. Biochem. J. 326: 625-636.
73. JEZ, J. M. & PENNING, T. M. 1998. Biochemistry 37: 9695-9703.
74. KANAYA, S., KATSUDA, C., KIMURA, S., NAKAI, T., KITAKUNI, E., NAKAMURA, H., KATAYANAGI, K., MORIKAWA, K. & IKEHARA, M. 1991. J. Biol. Chem. 226: 6038-6044.
75. KE, H. 1992. J. Mol. Biol. 228: 539-550.
76. KISHAN, R., ZEELEN, J. P., NOBLE, M. E. M., BORCHERT, T. V., MAINFROID, V., GORAJ, K., MARTIAL, J. A. & WIERENGA, R. K. 1994. Protein Eng. 7: 945-951.
77. KITA, A., KASAI, S. & MIKI, K. 1995. J. Biochem. 117: 575-578.
78. KITA, A., KASAI, S., MIYATA, M. & MIKI, K. 1996. Acta Crystallogr. D 52: 77-86.
79. KOHLHOFF, M., DAHM, A. & HENSEL, R. 1996. FEBS Lett. 383: 245-250.
80. KOIVULA, A., REINIKAINEN, T., RUOHONEN, L., VALKEAJARVI, A., CLAEYSSENS, M., TELEMAN, O., KLEYWEGT, G. J., SZARDENINGS, M., ROUVINEN, J., JONES, T. A. & TEERI, T. T. 1996. Protein Eng. 9: 691-699.
81. KRAULIS, P. J. 1991. J. Appl. Crystallogr. 24: 946-950.
82. LARSEN, T. M., BENNING, M. M., WESENBERG, G. E., RAYMENT, I. & REED, G. H. (1997). Arch. Biochem. Biophys. 345: 199-206.
83. LASTERS, I. 1990. Protein Eng. 4: 133-135.
84. LASTERS, I., WODAK, S. J., ALARD, P. & VAN CUTSEM, E. 1988. Proc. Natl. Acad. Sci.. U.S.A. 85: 3338-3342.
85. LASTERS, L, WODAK, S. J. & Pio, F. 1990. Proteins 7: 249-256.
86. LEBIODA, L., STEC, B. & BREWER J. M. 1989. J. Biol. Chem. 264: 3685-3693.
87. LESK, A. M., BRäNDEN, C. I. & CHOTHIA, C. 1989. Proteins 5: 139-148.
88. LEVINE, M., MUIRHEAD, H., STAMMERS, D. K. & STUART, D. I. 1978. Nature 271: 626-630.
89. LINDQVIST, Y., BRÄNDEN, C. I., MATHEWS, F. S. & LEDERER, F. 1991. J. Biol. Chem. 266: 3198-3207.
90. LONBERG, N. & GILBERT, W. 1985. Cell 40: 81-90.
91. LUGER, K., HOMMEL, U., HEROLD, M., HOFSTEENGE, J. & KIRSCHNER, K. 1989. Science 243: 206-210.
92. LUGER, K., SZADKOWSKI, H. & KIRSCHNER, K. 1990. Protein Eng. 3: 249-258.
93. MACGREGOR, E. A. & SVENSSON, B. 1989. Biochem. J. 259: 145-152.
94. MAINFROID, V., GORAJ, K., RENTIERDELRUE, F., HOUBRECHTS, A., LOISEAU, A., GOHIMONT, A. C., NOBLE, M. E. M., BORCHERT, T. V., WIERENGA, R. K. & MARTIAL, J. A. 1993. Protein Eng. 6: 893-900.
95. MAINFROID, V., MANDE, S. C., HOL, W. G. J., MARTIAL, J. A. & GORAJ, K. 1996a. Biochemistry 35: 4110-4117.
96. MAINFROID, V., TERPSTRA, P., BEAUREGARD, M., FRERE, J. M., MANDE, S. C., HOL, W. G. J., MARTIAL, J. A. & GORAJ, K. 1996b. J. Mol. Biol. 257: 441-456.
97. MATSUMURA, M., BECKTEL, W. J., LEVITT, M. & MATTHEWS, B.W. 1989a. Proc. Natl. Acad. Sci.. U.S.A. 86: 6562-6566.
98. MATSUMURA, M., SIGNOR, G. & MATTHEWS, B. W. 1989b. Nature 342: 291-293.
99. MCLACHLAN, A. D. 1979. J. Mol. Biol. 128: 49-79.
100. MIAN, I. S. 1998. Blood. Cells. Mol. Dis. 24: 83-100.
101. MOORE, S. A., JAMES, M. N. G, O'KANE, D. J. & LEE, J. 1993. EMBO J. 12: 1767-1774.
102. MOORE, S. A. & JAMES, M. N. G. 1995. J. Mol. Biol. 249: 195-214.
103. MUIRHEAD, H. 1983. Trends Biochem. Sci.. 8: 326-330.
104. MURZIN, A. G., BRENNER, S. E., HUBBARD, T. & CHOTHIA, C. 1995. J. Mol. Biol. 247: 536-540.
105. MURZIN, A. G., LESK, A. M. & CHOTHIA, C. 1992. J. Mol. Biol. 223: 531-543.
106. MURZIN, A. G., LESK, A. M. & CHOTHIA, C. 1994a. J. Mol. Biol. 236: 1369-1381.
107. MURZIN, A. G., LESK, A. M. & CHOTHIA, C. 1994b. J. Mol. Biol. 236: 1382-1400.
108. NOVOTNY, J., BRUCCOLERI, R. E. & NEWELL, J. 1984. J. Mol. Biol. 177: 567-573.
109. ORENGO, C. A., MICHIE, A. D., JONES, S., JONES, D. T., SWINDELLS, M. B. & THORNTON, J. M. 1997. Structure 5: 1093-1108.
110. PERRAKIS, A., TEWS, I., DAUTER, Z., OPPENHEIM, A. B., CHET, I., WILSON, K. S. & VORGIAS, C. E. 1994. Structure 2: 1169-1180.
111. PERRY, L. J. &: WETZEL, R. 1984. Science 226: 555-557.
112. PICKERSGILL, R., HARRIS, G., LO-LEGGIO, L., MAYANS, O. & JENKINS, J. 1998. Biochem. Soc. Trans. 26: 190-198.
113. PUJADAS, G. & PALAU, J. 1997. Protein Sci.. 6: 2409-2417.
114. PUJADAS, G., RAMIREZ, F. M., VALERO, R. & PALAU, J. 1996. Proteins 25: 456-472.
115. RAINA, S. MISSIAKAS, D. 1997. Annu. Rev. Microbiol. 51: 179-202.
116. RAINE, A. R. C., SCRUTTON, N. S. & MATHEWS, F. S. 1994. Protein Sci.. 3: 1889-1892.
117. RAMAGE, R. T., READ, B. A. & TABITA, F. R. 1998. Arch. Biochem. Biophys. 349: 81-88.
118. RAO, V. H., GUAM, C. D. & VAN ROEY, P. 1995. Structure 3: 449-457.
119. RAYCHAUDHURI, S., YOUNAS, F., KARPLUS, P. A., FAERMAN, C. H. &: RIPOLL, D. R. 1997. Protein Sci. 6: 1849-1857.
120. REARDON, D. & FARBER, G. K. 1995. FASEB J. 9: 497-503.
121. RICHARDSON, J. S. 1981. Advan. Protein Chem. 34: 167-339.
122. RICHARDSON, J. S., KNELLER, D., OSGUTHORPE, D. & SHARP, M. 1987. Heidelberg: European Molecular Biology Laboratory (Sander, C., ed), 21-39.
123. RICHARDSON, J. S. &: RICHARDSON, D. C. 1989. Trends Biochem. Sci.. 14: 304-309.
124. RIETVELD, A. W. M. &: FERREIRA, S. T. 1998. Biochemistry 37: 933-937.
125. ROJAS A., GARCIA-VALLVÉ, S., PALAU, J. & ROMEU, A. 1999. Biologia, Bratislava 54: 255-277.
126. RONDEAU, J. M., TÊTE-FAVIER, F., PODJARNY, A., REYMANN, J. M., BARTH, P., BIELLMANN, J. F. & MORAS, D. 1992. Nature 355: 469-472.
127. ROWLAND, P., NIELSEN, F. S., JENSEN, K. F. & LARSEN, S. 1997. Structure 5: 239-252.
128. SALEMME, F. R. 1981. J. Mol. Biol. 146: 143-156.
129. SALEMME, F. R. & WEATHERFORD, D. W. 1981a. J. Mol. Biol. 146: 101-117.
130. SALEMME, F. R. & WEATHERFORD, D. W. 1981b. J. Mol. Biol. 146: 119-141.
131. SANDER, C. 1991. Curr. Opin. Struct. Biol. 1: 630-637.
132. SANDER, C., VRIEND, G., BAZAN, F., HOROVITZ, A., NAKAMURA, H., RIBAS, L., FINKELSTEIN, A. V., LOCKHART, A., MERKL, R., PERRY, L. J., EMERY, S. C., GABORIAUD, C., MARKS, C., MOULT, J., VERLINDE, C., EBERHARD, M., ELOFSSON, A., HUBBARD, T. J. P., REGAN, L., BANKS, J., JAPPELLI, R., LESK, A. M. &: TRAMONTANO, A. 1992. Proteins 12: 105-110.
133. SAUER, R. T., HEHIR, K., STEARMAN, R. S., WEISS, M. A., JEITLER-NILSSON, A., SUCHANEK, E. G. & PABO, C.O. 1986. Biochemistry 25: 5992-5998.
134. SCHLIEBS, W., THANKI, N., ERITJA, R. & WIERENGA, R. 1996. Protein Sci.. 5: 229-239.
135. SCHLIEBS, W., THANKI, N., JAENICKE, R. & WIERENGA, R. K. 1997. Biochemistry 36: 9655-9662.
136. SCRUTTON, N. S. 1994. Bioessays 16: 115-122.
137. SELVARAJ, S. & GROMIHA, M. M. 1998. J. Protein Chem. 17: 407-415.
138. SONG, H. K., HWANG, K. Y., CHANG, C. & Sun, S. W. 1996. In: PARK, K. H., ROBYT, J. F. & CHOI, Y. D. (eds) Enzymes for carbohydrate engineering (In: Prog. Biotechnol., V.12) pp. 163-170, Elsevier, Amsterdam.
139. STAMPER, C. G. F., MOROLLO, A. A. & RINGE, D. 1998. Biochemistry 37: 10438-10445.
140. STEFFENS, P., NONG, V. H., HILLMER, S., SAALBACH, I. & MUNTZ, K. 1997. Planta 203: 44-50.
141. STEHLIN, C., DAHM, A. & KIRSCHNER, K. 1997. FEBS Lett. 403: 268-272.
142. STERNER, R., DAHM, A., DARIMONT, B., IVENS, A., LIEBL, W. & KIRSCHNER, K. 1995. EMBO J. 14: 4395-4402.
143. STERNER, R., KLEEMANN, G. R., SZADKOWSKI, H., LUSTIG, A., HENNIG, M. & KIRSCHNER, K. 1996. Protein Sci.. 5: 2000-2008.
144. SVENSSON, B. 1994. Plant Mol. Biol. 25: 141-157.
145. TANAKA, T., ANAGUCHI, H., HAYASHI, M., FUKUHARA, K., HUBBARD, T. J. P., NAKAMURA, H. & IKEHARA, M. 1991. Proc. 12th Am. Pept. Symp. 376-377.
146. TANAKA, T., KIMURA, H., HAYASHI, M., FUJIYOSHI, Y., FUKUHARA, K.I. & NAKAMURA, H. 1994a. Protein Sci.. 3: 419-427.
147. TANAKA, T., HAYASHI, M., KIMURA, H., OOBATAKE, M. & NAKAMURA, H. 1994b. Biophys. Chem. 50: 47-61.
148. TANAKA, T., KURODA, Y., KIMURA, H., KIDOKORO, S. & NAKAMURA, H. 1994c. Protein Eng. 7: 969-976.
149. TERWISSCHA VAN SCHELTINGA, A. C., HENNIG, M. & DIJKSTRA, B. W. 1996. J. Mol. Biol. 262: 243-257.
150. TEWS, I., TERWISSCHA VAN SCHELTINGA, A. C., PERRAKIS, A., WILSON, K. S. & DIJKSTRA, B. W. 1997. J. Am. Chem. Soc. 119: 7954-7959.
151. TSUJI, T., CHRUNYK, B. A., CHEN, X. W. & MATT-HEWS, C. R. 1993.Biochemistry 32: 5566-5575.
152. URFER, R. & KIRSCHNER, K. 1992. Protein Sci.. 1: 31-45.
153. VAN ROEY, P., RAO, V., PLUMMER, T. H. & TARENTINO, A. L. 1994. Biochemistry 33: 13989-13996.
154. VILLAFRANCA, J. E., HOWELL, E. E., OATLEY, S. J., XUONG, N. H. & KRAUT, J. 1987. Biochemistry 26: 2182-2189.
155. VTYURIN, N. h PANOV, V. 1995. Proteins 21: 256-260.
156. WATANABE, K., KITAMURA, K., IHA, H. & SUZUKI, Y. 1990. Eur. J. Biochem. 192: 609-620.
157. WEDEKIND, J. E., REED, G. H. & RAYMENT, I. 1994. Biochemistry 33: 9333-9342.
158. WETZEL, R. 1987. Trends Biochem. Sci.. 12: 478-482.
159. WHITBY, F. G., LUECKE, H., KUHN, P., SOMOZA, J. R., HUETE-PEREZ, J. A., PHILLIPS, J. D., HILL, C. P., FLETTERICK, R. J. & WANG, C. C. 1997. Biochemistry 36: 10666-10674.
160. WHITLOW, M., HOWARD, A. J., FINZEL, B. C., POULOS, T. L., WINBORNE, E. & GILLILAND, G. L. 1991. Proteins 9: 153-173.
161. WILMANNS, M., HYDE, C. C., DAVIES, D. R., KIRSCHNER, K. & JANSONIUS, J. N. 1991. Biochemistry 30: 9161-9169.
162. WIND, R. D., UITDEHAAG, J. C. M., BUITELAAR, R. M., DIJKSTRA, B. W. & DUKHUIZEN, L. 1998. J. Biol. Chem. 273: 5771-5779.
163. WODAK, S. J., LASTERS, L, PIO, F. & CLAESSENS, M. 1990. Biochem. Soc. Symp. 57: 99-121.
164. YUTANI, K., OGASAHARA, K. & SUGINO, Y. 1980. J. Mol. Biol. 144: 455-465.
165. ZVERLOV, V. V., LIEBL, W., BACHLEITNER, M. & SCHWARZ, W. H. 1998. FEMS Microbiol. Lett. 164: 337-343.