Relating the structure of HIV-1 reverse transcriptase to its processing step

Journal of Biomolecular Structure and Dynamics

Volumn 17, Issue SUPPL. 1, 2000, Pages 49-55

  Jernigan, R L ^a   Bahar, Ivet ^a,b   Covell, David G ^c   Atilgan, Ali Rana ^b   Erman, Burak ^d   Flatow, Daniel T ^a  

^a NATIONAL CANCER INSTITUTE   (United States)

^b BOGAZICI UNIVERSITY   (Turkey)

^c SAIC FREDERICK INC   (United States)

^d SABANCI UNIVERSITY   (Turkey)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DNA; RIBONUCLEASE H;

CHEMISTRY; GENETICS; HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS 1;

DNA; HIV-1; RIBONUCLEASE H;

EID: 0010675328     PISSN: 07391102     EISSN: 15380254     Source Type: Journal    
DOI: 10.1080/07391102.2000.10506603     Document Type: Article

References (23)

1. I. Bahar, A. R. Atilgan, and B. Erman, Fold. & Des. 2, 173-181 (1997).
2. I. Bahar, A. Wallqvist, D. G. Covell and R. L. Jernigan, Biochemistry 37, 1067-1075 (1998).
3. T. Haliloglu, I. Bahar and B. Erman, Phys. Rev. Lett. 79, 3090-3093 (1997).
4. I. Bahar, A. R. Atilgan, M. C. Demirel and B. Erman, Phys. Rev. Lett. 80, 2733-2736 (1998).
5. I. Bahar and R. L. Jernigan, J. Mol. Biol. 281, 871-884 (1998).
6. I. Bahar, B. Erman, R. L. Jernigan, A. R. Atilgan and D. G. Covell, J. Mol. Biol. 285, 1023-1037 (1999).
7. R. L. Jernigan, M. C. Demirel and I. Bahar, Int. J. Quant. Chem. (B. Pullman Memorial Volume) 75, 301-312 (1999).
8. M. M. Tirion, Phys. Rev. Lett. 77, 1905-1908(1996).
9. A. Kloczkowski, J. E. Mark and B. Erman, Macromolecules 22, 1423-1432 (1989).
10. A. M. Skalka and S. P. Goff, Eds., Reverse Transcriptase. (Cold Spring Harbor Laboratory Press, New York, 1993).
11. J. Ren, R. Esnouf, E. Garman, D. Somers, C. Ross, I. Kirby, J. Keeling, G. Darby, Y. Jones, D. Stuart and D. Stammers, Nature Struct. Biol. 2, 293-308 (1995).
12. R. G. Nanni, J. Ding, A. Jacobo-Molina, E. Arnold and S. H. Hughes, Pers. Drug Dis. & Des. 1, 129-150 (1993).
13. H. Gao, P. L. Boyer, E. Arnold and S. H. Hughes, J. Mol. Biol. 277, 559-572 (1998).
14. J. Jäger, S. J. Smerdon, J. Wang, D. C. Boisvert and T. A. Steitz, Structure 2, 869-876 (1994).
15. A. Jacobo-Molina, J. Ding, R. G. Nanni, A. D. J. Clark, X. Lu, C. Tantillo, R. Williams, G. Kamer, A. L. Ferris, P. Clark, A. Hizi, S. H. Hughes and E. Arnold, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90, 6320-6324 (1993).
16. J. Ding, K. Das, H. Moereels, L. Koymans, K. Andries, P. A. J. Janssen, S. H. Hughes, and E. Arnold, Nature Struct. Biol. 2, 407-415 (1995).
17. J. Ding, K. Das, C. Tantillo, W. Zhang, A. D. Clark Jr., S. Jessen, X. Lu, Y. Hsiou, A. Jacobo-Molina, K. Andries, R. Pauwels, H. Moereels, L. Koymans, P. A. J. Janssen, R. H. Smith Jr., M. K. Koepke, C. J. Michejda, S. H. Hughes and E. Arnold, Structure 3, 365-379 (1995).
18. K. Das, J. Ding, Y. Hsiou, A. D. Clark Jr., H. Moereels, L. Koymans, K. Andries, R. Pauwels, P. A. J. Janssen, P. L. Boyer, P. Clark, R. H. Smith Jr., M. B. K. Smith, C. J. Michejda, S. H. Hughes and E. Arnold, J. Mol. Biol. 264, 1085-1100 (1996).
19. D. W. Rodgers, S. J. Gamblin, B. A. Harris, S. Ray, J. S. Culp, B. Hellmig, D. J. Woolf, C. Debouck and S. C. Harrison, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 92, 1222-1226 (1995).
20. Y. Hsiou, J. Ding, K. Das, A. D. J. Clark, S. H. Hughes and E. Arnold, Structure 4, 853-860 (1996).
21. M. J. Chamberlin, in The Harvey Lectures, Ser. 88, 1-21 (1995).
22. W. K. Olson, K. M. Kosikov, A. Colasanti, A. A. Gorin and V. B. Zhurkin, in " Biological Physics: Third International Symposium", Eds. H. Frauenfelder, G. Hummer and R. Garcia, 14-36 (American Institute of Physics, N Y, 1999).
23. K. M. Kosikov, A. A. Gorin, V. B. Zhurkin and W. K. Olson, W. K., J. Mol. Biol. 289, 1301-1326 (1999).