NMR and protein dynamics

International Journal of Quantum Chemistry

Volumn 59, Issue 4, 1996, Pages 315-332

  Smith, Lorna J ^a   Dobson, Christopher M ^a  

^a UNIVERSITY OF OXFORD   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 0010308364     PISSN: 00207608     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/(SICI)1097-461X(1996)59:4<315::AID-QUA6>3.0.CO;2-0     Document Type: Article

References (97)

1. M. Karplus and J. A. McCammon, CRC Crit. Rev. Biochem. 9, 293 (1981).
2. C. L. Brooks, M. Karplus, and B. M. Pettitt, Adv. Chem. Phys. 71, 1 (1988).
3. R. J. P. Williams, Eur. Biophys. J. 21, 393 (1993).
4. K. Wüthrich and G. Wagner, Trends Biochem. Sci. 3, 227 (1978).
5. O. Jardetzky, Acc. Chem. Res. 14, 291 (1981).
6. I. D. Campbell, C. M. Dobson, and R. J. P. Williams, Biochem. J. 231, 1 (1985).
7. G. Wagner, Curr. Opin. Struct. Biol. 3, 748 (1993).
8. C. M. P. van Mierlo, N. J. Darby, J. Keeler, D. Neuhaus and T. E. Creighton, J. Mol. Biol. 229, 1125 (1993).
9. C. Redfield, R. A. G. Smith, and C. M. Dobson, Nature Struct. Biol. 1, 23 (1994).
10. O. Jardetzky and G. C. K. Roberts, NMR in Molecular Biology (Academic Press, New York, 1981).
11. B. R. Gelin and M. Karplus, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 72, 2002 (1975).
12. K. Linderstrom-Lang, Chem. Soc. Spec. Publ. 2, 1 (1955).
13. P. Kraulis, J. Appl. Crystallogr. 24, 946 (1991).
14. H. Roder, G. Wagner, and K. Wüthrich, Biochemistry 24, 7396 (1985).
15. S. E. Radford, M. Buck, K. D. Topping, C. M. Dobson, and P. A. Evans, Proteins 14, 237 (1992).
16. A. J. Wand, H. Roder, and S. W. Englander, Biochemistry 25, 1107 (1986).
17. G. Otting and K. Wüthrich, J. Am. Chem. Soc. 111, 1871 (1989).
18. G. Otting, E. Liepinsh, and K. Wüthrich, Science 254, 974 (1991).
19. M. G. Kubinec and D. E. Wemmer, Curr. Opin. Struc. Biol. 2, 828 (1992).
20. G. M. Clore, A. Bax, P. T. Wingfield, and A. M. Gronenborn, Biochemistry 29, 5671 (1990).
21. G. Otting, E. Liepinsh, and K. Wüthrich, J. Am. Chem. Soc. 113, 4363 (1991).
22. I. D. Campbell, C. M. Dobson, and R. J. P. Williamson, Proceed. R. Soc. Lond., Ser. B 189, 503 (1975).
23. C. M. Dobson, G. R. Moore, and R. J. P. Williamson, FEBS Lett. 51, 60 (1975).
24. K. Wüthrich and G. Wagner, FEBS Lett. 50, 265 (1975).
25. I. D. Campbell, C. M. Dobson, G. R. Moore, S. J. Perkins, and R. J. P. Williamson, FEBS Lett. 70, 96 (1976).
26. J. M. Twyman and C. M. Dobson, J. Chem. Soc. Chem. Commun. 786 (1988).
27. J. M. Twyman and C. M. Dobson, Magn. Reson. Chem. 28, 163 (1990).
28. J. Fattah, J. M. Twyman, S. J. Heyes, D. J. Watkin, A. J. Edwards, K. Prout, and C. M. Dobson, J. Amer. Chem. Soc. 115, 5636 (1993).
29. P. A. Evans, C. M. Dobson, R. A. Kautz, G. Hatfull, and R. O. Fox, Nature 329, 266 (1987).
30. K. A. Higgins, D. J. Craik, J. G. Hall, and P. R. Andrews, Drug Design Deliv. 3, 159 (1988).
31. J. Kördel, S. Forsen, T. Drakenberg, and W. J. Chazin, Biochemistry 29, 4400 (1990).
32. C. Grathwohl and K. Wüthrich, Biopolymers 20, 2623 (1981).
33. L. A. Svensson, E. Thulin, and S. Forsén, J. Mol. Biol. 223, 601 (1992).
34. G. Otting, E. Liepinsh, and K. Wüthrich, Biochemistry 32, 3571 (1993).
35. U. K. Nowak, X. Li, A. J. Teuten, R. A. G. Smith, and C. M. Dobson, Biochemistry 32, 298 (1993).
36. S. J. Landry, J. Zeilstra-Ryalls, O. Fayet, C. Georgopoulos, and L. M. Gierasch, Nature 364, 255 (1993).
37. R. N. Perham, Biochemistry 30, 8501 (1991).
38. C. M. Dobson, Curr. Opin. Struct. Biol. 2, 6 (1992).
39. P. A. Evans, K. D. Topping, D. N. Woolfson, and C. M. Dobson, Proteins 9, 248 (1991).
40. D. Neri, M. Billeter, G. Wider, and K. Wüthrich, Science 257, 1559 (1992).
41. K. J. Lumb and P. S. Kim, J. Mol. Biol. 236, 412 (1994).
42. H. Christensen and R. H. Pain, Eur. Biophys. J. 19, 221 (1991).
43. V. E. Bychkova and O. B. Ptitysn, Chemtracts-Biochem. Mol. Biol. 4, 133 (1993).
44. J. Baum, C. M. Dobson, P. A. Evans, and C. Hanley, Biochemistry 28, 7 (1989).
45. M. F. Jeng, S. W. Englander, G. A. Elove, A. J. Wand, and H. Roder, Biochemistry 29, 10433 (1990).
46. A. T Alexandrescu, P. A. Evans, M. Pitkeathly, J. Baum, and C. M. Dobson, Biochemistry 32, 1707 (1993).
47. O. B. Ptitsyn, R. H. Pain, G. V. Semisotnov, E. Zerovnik, and O. I. Razgulgaev, FEBS Lett. 262, 20 (1990).
48. G. Wagner, Prog. NMR Spectrosc, 22, 101 (1990).
49. M. Karplus, J. Chem. Phys. 30, 11 (1959).
50. A. Pardi, M. Billeter, and K. Wüthrich, J. Mol. Biol. 180, 741 (1984).
51. L. J. Smith, M. J. Sutcliffe, C. Redfield, and C. M. Dobson, Biochemistry 30, 986 (1991).
52. C. Redfield and C. M. Dobson, Biochemistry 29, 7201 (1990).
53. S. Ludvigsen, K. V. Anderson, and F. M. Poulsen, J. Mol. Biol. 217, 731 (1991).
54. L. E. Kay, B. Brooks, S. W. Sparks, D. A. Torchia, and A. Bax, J. Am. Chem. Soc. 111, 5488 (1989).
55. G. W. Vuister and A. Bax, J. Am. Chem. Soc. 115, 7772 (1993).
56. M. Rico, J. Santoro, C. Gonzalez, M. Bruix, J. L. Neira, and J. L. Nieto, Appl. Magn. Reson. 4, 385 (1993).
57. C. A. McPhalen and M. N. G. James, Biochemistry 26, 261 (1987).
58. R. X. Xu, E. T. Olejniczak, and S. W. Fesik, FEBS Lett. 305, 137 (1992).
59. K. Nagayama and K. Wüthrich, Eur. J. Biochem. 115, 653 (1981).
60. K. D. Berndt, P. Güntert, L. P. M. Orbons, and K. Wüthrich, J. Mol. Biol. 227, 757 (1992).
61. J. C. Hoch, C. M. Dobson, and M. Karplus, Biochemsitry 24, 3831 (1985).
62. G. Lipari and A. Szabo, J. Am. Chem. Soc. 104, 4546 (1982).
63. G. M. Clore, A. Szabo, A. Bax, L. E. Kay, P. C. Driscoll, and A. M. Gronenborn, J. Am. Chem. Soc. 112, 4989 (1990).
64. L. E. Kay, D. A. Torchia, and A. Bax, Biochemistry 28, 8972 (1989).
65. G. M. Clore, P. C. Driscoll, P. T. Wingfield, and A. M. Gronenborn, Biochemistry 29, 7387 (1990).
66. G. Barbato, M. Ikura, L. E. Kay, R. W. Pastor, and A. Bax, Biochemistry 31 5269 (1992).
67. J. Kördel, N. J. Skelton, M. Akke, A. G. Palmer, and W. J. Chazin, Biochemistry 31, 4856 (1992).
68. D. M. Schneider, M. J. Dellwo, and A. J. Wand, Biochemistry 31, 3645 (1992).
69. R. Powers, G. M. Clore, S. J. Stahl, P. T. Wingfield, and A. M. Gronenborn, Biochemistry 31, 9150 (1992).
70. H. Berlung, H. Kovacs, K. Dahlman-Wright, J.-A. Gustafsson, and T. Härd, Biochemistry, 31, 12001 (1992).
71. J. W. Peng and G. Wagner, Biochemistry 31, 8571 (1992).
72. M. J. Stone, W. J. Fairbrother, A. G. Palmer, J. Reizer, M. H. Saier, and P. E. Wright, Biochemistry 31, 4394 (1992).
73. C. Redfield, J. Boyd, L. J. Smith, R. A. G. Smith, and C. M. Dobson, Biochemistry 31, 10431 (1992).
74. M. J. Stone, K. Chandrasekhar, A. Holmgren, P. E. Wright, and H. J. Dyson, Biochemistry 32, 426 (1993).
75. K. L. Constantine, M. S. Friedrichs, V. Goldfarb, P. D. Jeffrey, S. Sheriff, and L. Mueller, Proteins 15, 290 (1993).
76. N. A. Farrow, R. Muhandrian, A. U. Singer, S. M. Pascal, C. M. Kay, G. Gish, S. E. Shoelson, T. Pawson, J. D. Forman-Kay, and L. E. Kay, Biochemistry 33, 5984 (1994).
77. M. Buck, J. Boyd, C. Redfield, D. A. MacKenzie, D. J. Jeenes, D. B. Archer, and C. M. Dobson, Biochemistry 34, 4041 (1995).
78. L. J. Smith, C. Redfield, J. Boyd, G. M. P. Lawrence, R. G. Edwards, R. A. G. Smith, and C. M. Dobson, J. Mol. Biol. 224, 899 (1992).
79. L. J. Smith, C. Redfieid, R. A. G. Smith, C. M. Dobson, G. M. Clore, A. M. Gronenborn, M. R. Walter, T. L. Nagabushan, and A. Wlodawer, Nature Struct. Biol. 1, 301 (1994).
80. A. Wlodawer, A. Pavlovsky, and A. Gustchina, FEBS Lett, 309, 59 (1992).
81. M. Ikura, G. M. Clore, A. M. Gronenborn, G. Zhu, C. B. Klee, and A. Bax, Science 256, 632 (1992).
82. C. Chen, Y. Feng, J. H. Short, and A. J. Wand, Arch. Biochem. Biophys. 306, 510 (1993).
83. M. Akke, N. J. Skelton, J. Kördel, A. G. Palmer, and W. J. Chazin, Biochemistry 32, 9832 (1993).
84. J. W. Cheng, C. A. Lepre, and J. M. Moore, Biochemistry 33, 4093 (1994).
85. A. G. Palmer III, M. Rance, and P. E. Wright, J. Am. Chem. Soc. 113, 4371 (1991).
86. L. K. Nicholson, L. E. Kay, D. M. Baldisseri, J. Arango, P. E. Young, A. Bax, and D. A. Torchia, Biochemistry 31, 5253 (1992).
87. S. J. Matthews, S. K. Jandu, and R. J. Leatherbarrow, Biochemistry 32, 657 (1993).
88. R. Powers, G. M. Clore, D. S. Garrett, and A. M. Gronenborn, J. Magn. Reson. Ser. B 101, 325 (1993).
89. R. M. Levy, C. M. Dobson, and M. Karplus, Biophys. J. 39, 107 (1982).
90. E. T. Olejniczak, C. M. Dobson, M. Karplus, and R. M. Levy, J. Am. Chem. Soc. 106, 1923 (1984).
91. I. Chandrasekhar, G. M. Clore, A. Szabo, A. M. Gronenborn, and B. R. Brooks, J. Mol. Biol. 226, 239 (1992).
92. A. G. Palmer and D. A. Case, J. Am. Chem. Soc. 114, 9059 (1992).
93. J. Kördel and O. Teleman, J. Am. Chem. Soc. 114, 4934 (1992).
94. M. A. L. Eriksson, H. Berglund, T. Hard, and L. Nilsson, Proteins 17, 375 (1993).
95. S. G. Hyberts, M. S. Goldberg, T. F. Havel, and G. Wagner, Protein Sci. 1, 736 (1992).
96. L. Li, C. J. Falzone, P. E. Wright, and S. J. Benkovic, Biochemistry 31, 7826 (1992).
97. M. S. Searle, D. H. Williams, and U. Gerhard, J. Am. Chem. Soc. 114, 10697 (1992).