Solvent effects on the secondary structures of proteins

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 104, Issue 11, 2000, Pages 2498-2503

  Park, Changmoon ^a,b   Carlson, Matt J ^a   Goddard III, William A ^a  

^a CALIFORNIA INSTITUTE OF TECHNOLOGY   (United States)

^b Chungnam National University   (South Korea)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 0006264872     PISSN: 10895639     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp9911189     Document Type: Article

References (38)

1. Taylor, W. R.; Thornton, J. M. J. Mol. Biol. 1984, 173, 487.
2. Finkelstein, A. V.; Reva, B. A. Nature 1991, 351, 497.
3. Bowie, J. U.; Luthy, R.; Eisenberg, D. Science 1991, 253, 164.
4. Jones, D. T.; Taylor, W. R.; Thornton, J. M. Nature 1992, 358, 86.
5. Fasman, G. D. Prediction of Protein Structure and the Principles of Protein Conformation; Plenum: New York, 1989.
6. Chou, P. Y.; Fasman, G. D. Biochemistry 1978, 13, 222.
7. Poland, D.; Scheraga, H. A. Theory of Helix-Coil Transitions in Biopolymers; Academic: New York, 1970.
8. Lockhart, D. J.; Kim, P. S. Science 1992, 257, 947.
9. Diaz, H.; Tsang, K. Y.; Choo, D.; Kelly, J. W. Tetrahedron 1993, 49, 3533.
10. Tsang, K. Y.; Diaz, H.; Graciani, N.; Kelly, J. W. J. Am. Chem. Soc. 1994, 166, 3988.
11. Gould, I. R.; Kollman, P. A. J. Phys. Chem. 1992, 96, 9255.
12. Schafer, L.; Klimkovsky, V. J.; Momany, F. A.; Chuman, H.; van Alsenoy, C. Biopolymers 1984, 23, 2335.
13. Tobias, D. J.; Brooks, C. L., III. J. Phys. Chem. 1992, 96, 3864.
14. Pettitt, B. M.; Karplus, M. Chem. Phys. Lett. 1985, 121, 194.
15. Pettitt, B. M.; Karplus, M. J. Phys. Chem. 1988, 92, 3994.
16. Anderson, A.; Hermans, J. Proteins 1988, 3, 262.
17. Greeley, B. H.; Russo, T. V.; Mainz, D. T.; Friesner, R. A.; Langlois, J.-M.; Goddard, W. A., III; Donnelly, R. E.; Ringnalda, M. N. J. Chem. Phys. 1994, 101, 4028.
18. Ringnalda, M. N.; Langlois, J.-M.; Greeley, B. H.; Murphy, R. B.; Russo, T. V.; Cortis, C.; Muller, R. P.; Marten, B.; Donnelley, R. E., Jr.; Mainz, D. T.; Wright, J. R.; Pollar, T. W.; Gao, Y.; Won, Y.; Miller, G. H.; Goddard, W. A., III; Friesner, R. A. PS-GVB, v2.24; 1995.
19. Tannor, D. J.; Marten, B.; Murphy, R.; Friesner, R. A.; Stikoff, D.; Nicholls, A.; Ringnalda, M.; Goddard, W. A., III; Honig, B. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 11875.
20. McAllister, M. A.; Perzel, A.; Csaszar, P.; Viviani, W.; Rivail, J.-L.; Csizmadia, I. G. J. Mol. Struct. (Theochem) 1993, 288, 161.
21. Klimkowski, V. J.; Schafer, L.; Momany, F. A.; van Alsenoy, C. J. Mol. Struct. 1985, 124, 143.
22. Schafer, L.; van Alsenoy, C.; Klimkowski, V. J.; Scarsdale, J. N. J. Chem. Phys. 1982, 76, 1439.
23. Schafer, J. N.; van Alsenoy, C.; Klimkowski, V. J.; Schafer, L.; Momany, F. A. J. Am. Chem. Soc. 1983, 105, 3438.
24. Perzel, A.; Farkas, O.; Csizmadia, I. G. J. Am. Chem. Soc. 1996, 111, 7809.
25. Perzel, A.; Angyan, J. G.; Kajtar, M.; Viviani, W.; Rivail, J.-L.; Marcoccia, J.-F.; Csizmadia, I. G. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 6256.
26. Chiou, J.-S.; Tatara, T.; Sawamura, S.; Kaminoh, Y.; Kamaya, H.; Shibata, A.; Udea, I. Biochim. Biophys. Acta 1992, 1119, 211.
27. Lyu, P. C.; Lif, M. I.; Marky, L. A.; Kallenbach, N. R. Science 1990, 250, 669.
28. Carrier, D.; Manisch, H. H.; Wong, P. T. T. Biochemistry 1990, 29, 254.
29. Carrier, D.; Manisch, H. H.; Wong, P. T. T. Biopolymers 1990, 29, 837.
30. Cantor, C. R.; Schimmel, P. R. Biophysical Chemistry Part I: The Conformation of Biological Macromolecules; W. H. Freeman and Company: San Francisco, 1980.
31. Richardson, J. S.; Richardson, D. C. Science 1988, 240, 1648.
32. Walgers, R.; Lee, T. C.; Goodwin, A. C. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 5073.
33. Luo, P.; Baldwin, R. L. Biochemistry 1997, 36, 8413.
34. Zhang, H.; Kaneko, K.; Nguyen, J. T.; Livshits, T. L.; Baldwin, M. A.; Cohen, F. E.; James, T. L.; Prusiner S. B. J. Mol. Biol. 1995, 250, 514.
35. Plaxco, K. W.; Morton, C. J.; Grimshaw, S. B.; Jones, J. A.; Pitkeathly, M.; Campbel, I. D.; Dobson, C. M. J. Biomol. NMR 1997, 10, 221.
36. Prusiner, S. B. Science 1991, 252, 1515.
37. Mayo, S. L.; Olafson, B. D.; Goddard, W. A., III. J. Phys. Chem 1990, 94, 8897.
38. Rappe, A. K.; Casewit, C. J.; Colwell, K. S.; Goddard, W. A., III; Skiff, W. M. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 10024.