Paramagnetic NMR studies of blue and purple copper proteins

Biospectroscopy

Volumn 5, Issue 5 SUPPL. 1, 1999, Pages

  Kolczak, Urszula ^a   Salgado, Jesús ^a,c   Siegal, Gregg ^a   Saraste, Matti ^b   Canters, Gerard W ^a  

^a LEIDEN UNIVERSITY   (Netherlands)

^b EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY   (Germany)

^c Inst F Molekularbiologie F   (Germany)

Author keywords

Azurin; Copper A; Paramagnetic NMR

Indexed keywords

AZURIN; BACTERIAL PROTEIN; CARBON; COPPER; CYTOCHROME C OXIDASE; DUROQUINOL OXIDASE; HISTIDINE; HYBRID PROTEIN; HYDROGEN; MAUC PROTEIN, METHYLOBACTERIUM EXTORQUENS; METALLOPROTEIN; OXIDOREDUCTASE;

ARTICLE; CHEMISTRY; ELECTRON SPIN RESONANCE; ELECTRON TRANSPORT; ENZYMOLOGY; ESCHERICHIA COLI; GENETICS; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; PARACOCCUS; PSEUDOMONAS AERUGINOSA; SITE DIRECTED MUTAGENESIS; THERMUS THERMOPHILUS;

AZURIN; BACTERIAL PROTEINS; CARBON ISOTOPES; COPPER; ELECTRON SPIN RESONANCE SPECTROSCOPY; ELECTRON TRANSPORT; ELECTRON TRANSPORT COMPLEX IV; ESCHERICHIA COLI; HISTIDINE; HYDROGEN; MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; METALLOPROTEINS; MUTAGENESIS, SITE-DIRECTED; OXIDOREDUCTASES; PARACOCCUS; PSEUDOMONAS AERUGINOSA; RECOMBINANT FUSION PROTEINS; THERMUS THERMOPHILUS;

EID: 0002340454     PISSN: 10754261     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/(sici)1520-6343(1999)5:5+3.0.co;2-h     Document Type: Article

References (79)

1. Adman, E. T. Adv Protein Chem 1991, 42, 145-197.
2. Adman, E. T. In Topics in Molecular and Structural Biology. Metalloproteins, Part 1; Harrison, P. M., Ed.; Macmillan: London, 1985; p 1-42.
3. Solomon, E. I.; Baldwin, M. J.; Lowery, M. D. Chem Rev 1992, 92, 521-542.
4. Guss, J. M.; Freeman, H. C. J Mol Biol 1983, 169, 521-563.
5. Baker, E. N. J Mol Biol 1988, 203, 1071-1095.
6. Guss, J. M.; Merritt, E. A.; Phizackerley, R. P.; Hedman, B.; Murata, M.; Hodgson, K. O.; Freeman, H. C. Science 1988, 241, 806-811.
7. Adman, E. T.; Turley, S.; Bramson, R.; Petratos, K.; Banner, D.; Tsernoglou, D.; Beppu, T.; Watanbe, H. J Biol Chem 1989, 264, 87-99.
8. Nar, H.; Messerschmidt, A.; Huber, R.; Van de Kamp, M.; Canters, G. W. J Mol Biol 1991, 221, 765-772.
9. Romero, A.; Nar, H.; Huber, R.; Messerschmidt, A.; Kalverda, A.; Canters, G. W.; Durley, R.; Mathews, F. S. J Mol Biol 1994, 236, 1196-1211.
10. Moore, J. M.; Case, D. A.; Chazin, W. J.; Gippert, G. P.; Havel, T. F.; Fowls, R.; Wright, P. E. Science 1988, 240, 314-317.
11. Moore, J. M.; Lepre, C. A.; Gippert, G. P.; Chazin, W. J.; Case, D. A.; Wright, P. E. J Mol Biol 1991, 221, 533-555.
12. Bagby, S.; Driscoll, P. C.; Harvey, T. S.; Hill, H. A. O. Biochemistry 1994, 33, 6611-6622.
13. Kalverda, A. P.; Wymenga, S. S.; van de Ven, F. J. M.; Hilbers, C. W.; Canters, G. W. J Mol Biol 1994, 240, 358-371.
14. Roberts, V. A.; Fisher, C. L.; Redford, S. M.; McRee, D. E.; Parge, H. E.; Getzoff, E. D.; Tainer, J. A. Free Rad Res Commun 1991, 12-13, 269-278.
15. Rompel, A.; Fischer, H.; Meiwes, D.; Büldt-Karentzopoulos, K.; Dillinger, R.; Tuczek, F.; Witzel, H.; Krebs, B. J Biol Inorg Chem 1999, 4, 5663.
16. Messerschmidt, A.; Rossi, A.; Ladenstein, R.; Huber, R.; Bolognesi, M.; Gatti, G.; Marchesini, A.; Petruzzelli, R.; Finazzi-Agro, A. J Mol Biol 1989, 206, 513-529.
17. Stevens, T. H.; Martin, C. T.; Want, H.; Brudvig, G. W.; Scholes, C. P.; Chan, S. J. J Biol Chem 1982, 257, 12106-12113.
18. Kroneck, P. M. H.; Antholine, W. E.; Kastrau, D. H. W.; Buse, G.; Steffens, G. C.; Zumft, W. G. FEBS Lett 1990, 268, 274-276.
19. van der Oost, J.; Lappalainen, P.; Musacchio, A.; Warne, A.; Lemieux, R.; Rumbley, J.; Gennis, R. B.; Aasa, R.; Pascher, T.; Malmstrom, B. G.; Saraste, M. EMBO J 1992, 11, 3209-3217.
20. Kelly, M.; Lappalainen, P.; Talbo, G.; Haltia, T.; van der Oost, J.; Saraste, M. J Biol Chem 1993, 268, 16781-16787.
21. van Wachenfeldt, C.; de Vries, S.; van der Oost, J. FEBS Lett 1994, 340, 109-113.
22. Slutter, C. E.; Sanders, D.; Wittung, P.; Malmström, B. G.; Aasa, R.; Richards, J. H.; Gray, H.; Fee, J. A. Biochemistry 1996, 35, 3387-3395.
23. Lappalainem, P.; Aasa, R.; Malmström, B. G.; Saraste, M. J Biol Chem 1993, 268, 26416-26421.
24. Salgado, J.; Warmerdam, G.; Bubacco, L.; Canters, G. W. Biochemistry 1998, 37, 7378-7389.
25. Saraste, M. Q Rev Biophys 1990, 23, 331-366.
26. Dennison, C.; Vijgenboom, E.; de Vries, S.; van der Oost, J.; Canters, G. W. FEBS Lett 1995, 365, 92-94.
27. Hay, M.; Richards, J. H.; Lu, Y. Proc Natl Acad Sci USA 1996, 93, 461-464.
28. Solomon, E. I.; Lowery, M. D. Science 1993, 259, 1579-1581.
29. Guckert, J. A.; Lowery, M. D.; Solomon, E. I. J Am Chem Soc 1995, 117, 2817-2844.
30. Farrar, J. A.; Neese, F.; Lappalainen, P.; Kroneck, P. M. H.; Saraste, M.; Zumft, W. G.; Thomson, A. J. J Am Chem Soc 1996, 118, 11501-11514.
31. Gamelin, D. R.; Randal, D. W.; Hay, M. T.; Houser, T. C. M.; Canters, G. W.; de Vries, S.; Tolman, W. B.; Lu, Y.; Solomon, E. I. J Am Chem Soc 1998, 120, 5246-5263.
32. Achim, C.; Bominaar, E. L.; Münck, E. J Biol Inorg Chem 1998, 3, 126-134.
33. Robin, M. B.; Day, P. Adv Inorg Chem Radiochem 1967, 10, 247-422.
34. Kroneck, P. M. H.; Antholine, W. E.; Riester, J.; Zumft, W. G. FEBS Lett 1988, 242, 70-74.
35. Antholine, W. E.; Kastrau, D. H. W.; Steffens, G. C. M.; Buse, G.; Zumft, W. G.; Kroneck, P. M. H. Eur J Biochem 1992, 209, 875-881.
36. Bertini, I.; Turano, P.; Vila, A. J. Chem Rev 1993, 93, 2833-2932.
37. Inubushi, T.; Becker, E. D. J Magn Reson 1983, 51, 128-133.
38. Kalverda, A. P.; Salgado, J.; Dennison, C.; Canters, G. W. Biochemistry 1996, 35, 3085-3092.
39. Salgado, J.; Kalverda, A. P.; Canters, G. W. J Biomol NMR 1997, 9, 299-305.
40. Bertini, I.; Ciurli, S.; Dikiy, A.; Gasanov, R.; Luchinat, C.; Martini, G.; Safarov, N. J Am Chem Soc 1999, 121, 2037-2046.
41. Pfenninger, S.; Antholine, W. E.; Barr, M. E.; Hyde, J. S.; Kroneck, P. M. H.; Zumft, W. G. Biophys J 1995, 69, 2761-2769.
42. Bertini, I.; Bren, K. L.; Clemente, A.; Fee, J. A.; Gray, H. B.; Luchinat, C.; Malmström, B. G.; Richards, J. H.; Sanders, D.; Slutter, G. E. J Am Chem Soc 1996, 118, 11658-11659.
43. Dennison, C.; Berg, A.; de Vries, S.; Canters, G. W. FEBS Lett 1996, 394, 340-344.
44. Dennison, C.; Berg, A.; Canters, G. W. Biochemistry 1997, 36, 3262-3269.
45. Luchinat, C.; Soriano, A.; Djinovic-Carugo, K.; Saraste, M.; Malmström, B. G.; Bertini, I. J Am Chem Soc 1997, 119, 11023-11027.
46. Bertini, I.; Luchinat, C. In Coordination Chemistry Reviews; Lever, A. B., Ed.; Elsevier: Amsterdam, 1996; Vol. 150, p 1-300.
47. Kurland, R. J.; McGarvey, B. R. J Magn Reson 1970, 2, 286-301.
48. La Mar, G. N. In NMR of Paramagnetic Molecules; Principles and Applications; LaMar, G. N.; Horrocks, W. D., Jr.; Holm, R. H., Eds.; Academic Press: New York, 1973; p 85-126.
49. Bertini, I.; Luchinat, C. NMR of Paramagnetic Molecules in Biological Systems; Benjamin Cummings; Menlo Park, CA, 1986.
50. Larsson, S.; Kaellebring, B.; Wittung, P.; Malmström, B. G. Proc Natl Acad Sci USA 1995, 92, 7167-7171.
51. Neese, F.; Zumft, W. G.; Antholine, W. E.; Kroneck, P. M. H. J Am Chem Soc 1996, 118, 8692-8699.
52. Neese, F.; Kappl, R.; Hüttermann, J.; Zumft, W. G.; Kroneck, P. M. H. J Biol Inorg Chem 1998, 3, 53-67.
53. Andrew, C. R.; Lappalainen, P.; Saraste, M.; Hay, M. T.; Lu, Y.; Dennison, C.; Canters, G. W.; Fee, J. A.; Slutter, C. E.; Nakamura, N.; Sanders-Loehr, J. J Am Chem Soc 1995, 117, 10759-10760.
54. de Boer, E.; Colpa, J.-P.; Lazdins, D.; Karplus, M. J Chem Phys 1967, 47, 3098-3100.
55. Gurbiel, R. J.; Fann, Y. C.; Surerus, K. K.; Werst, M. M.; Musser, S. M.; Doan, P. E.; Chan, S. I.; Fee, J. A.; Hoffman, B. M. J Am Chem Soc 1993, 115, 10888-10894.
56. Wilmanns, M.; Lappalainen, P.; Kelly, M.; Sauer-Eriksson, E.; Saraste, M. Proc Natl Acad Sci USA 1995, 92, 11955-11959.
57. Farrar, J. A.; Lappalainen, P.; Zumft, W. G.; Saraste, M.; Thomson, A. J. Eur J Biochem 1995, 232, 294-303.
58. Iwata, S.; Ostermeier, C.; Ludwig, B.; Michel, H. Nature 1995, 376, 660-669.
59. Wittekind, M.; Mueller, L. J Magn Reson B 1993, 101, 201-205.
60. Kay, L. E.; Ikura, M.; Tschudin, R.; Bax, A. J Magn Reson 1990, 89, 496-514.
61. Farmer, B. T.; Venters, R. A.; Spicer, L. D.; Wittekind, M. G.; Müller, L. J Biomol NMR 1992, 2, 195-202.
62. Grzesiek, S.; Bax, A. J Am Chem Soc 1992, 114, 6291-6293.
63. Muhandiram, D. R.; Kay, L. E. J Magn Reson B 1994, 103, 203-216.
64. Kalverda, A. P. Ph.D. Thesis, University of Leiden, The Netherlands, 1996.
65. Adman, E. T.; Canters, G. W.; Hill, H. A. O.; Kitchen, N. A. FEBS Lett 1982, 143, 287-292.
66. Ugurbil, K.; Mitra, S. Proc Natl Acad Sci USA 1985, 82, 2039-2043.
67. van de Kamp, M.; Hali, F. C.; Rosato, N.; Finazzi Agro, A.; Canters, G. W. Biochim Biophys Acta 1990, 1019, 283-292.
68. van de Kamp, M.; Canters, G. W.; Andrew, C. R.; Sanders-Loehr, J.; Bender, C. J.; Peisach, J. Eur J Biochem 1993, 218, 229-238.
69. Corin, A. F.; Bersohn, R.; Cole, P. E. Biochemistry 1983, 22, 2032-2038.
70. Salgado, J.; Jimenez, H. R.; Donaire, A.; Moratal, J. M. Eur J Biochem 1995, 231, 358-369.
71. Coremans, J. W. A.; Poluektov, O. G.; Groenen, E. J. J.; Canters, G. W.; Nar, H.; Messerschmidt, A. J Am Chem Soc 1994, 116, 3097-3101.
72. Larsson, S.; Broo, A.; Sjölin, L. J Phys Chem 1995, 99, 4860-4865.
73. Bertini, I.; Capozzi, F.; Luchinat, C.; Piccioli, M.; Vila, A. J. J Am Chem Soc 1994, 116, 651-660.
74. Bertini, I.; Donaire, A.; Felli, I. C.; Luchinat, C.; Rosato, A. Inorg Chem 1997, 36, 4798-4803.
75. Donaire, A.; Salgado, J.; Moratal, J. M. Biochemistry 1998, 37, 8659-8673.
76. The BioMagResBank data base can be found at http://www.bmrb.wisc.edu/.
77. Coremans, J. W. A.; Poluektov, O. G.; Groenen, E. J. J.; Canters, G. W.; Nar, H.; Messerschmidt, A. J Am Chem Soc 1996, 118, 12141-12153.
78. Hoitink, C. Ph.D. Thesis, University of Leiden, The Netherlands, 1993.
79. Nagayama, K.; Kumar, A.; Wüthrich, K.; Ernst, R. R. J Magn Reson 1980, 40, 321-329.