HIV-1 protease tethered heterodimer-pepstatin-A complex: NMR characterization

Current Science

Volumn 79, Issue 12, 2000, Pages 1684-1695

  Panchal, S C ^a   Pillai, Bindu ^b   Hosur, M V ^b   Hosur, R V ^a  

^a TATA INSTITUTE OF FUNDAMENTAL RESEARCH   (India)

^b BHABHA ATOMIC RESEARCH CENTRE   (India)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 0001655594     PISSN: 00113891     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: None     Document Type: Article

References (53)

1. Seelmeier, S., Schmidt, H., Turk, V. and Helm, K. V. D., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1988, 85, 6612-6616.
2. Kohl, N. E., Emini, E. A., Schlief, W. A., Davis, L. J., Heimbach, J., Dixon, R. A. F., Scolnick, E. M. and Sigal, I. S., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1988, 85, 4686-4690.
3. McQuade, T. J., Tomasselli, G., Liu, L., Karacostas, V., Moss, B., Sawyer, T. K., Heinrkson, R. L. and Tarpley, W. G., Science, 1990, 247, 454-456.
4. Lapatto, R., Blundell, T., Hemmings, A., Overington, J., Wilderspin, A. F., Wood, S., Merson, J. R., Whittle, P. J., Danley, D. E., Geoghegan, K. F., Hawrylik, S. J., Lee, S. E., Scheld, K. G. and Hobart, P. M., Nature, 1989, 342, 299-302.
5. Navia, M. A., Fitzgerald, P. M. D., McKeever, B. M., Leu, C., Heimbach, J. C., Herber, W. K., Sigal, I. S., Darke, P. L. and Springer, J. P., Nature, 1989, 337, 615-620.
6. Wlodawer, A., Miller, M., Jaskolski, M., Sathyanarayana, B. K., Baldwin, E., Webber, I. T., Selk, L. M., Clawson, L., Schneider, J. and Kent, S. B. H., Science, 1989, 245, 616-621.
7. Davies, D. R., Annu. Rev. Biophys. Chem., 1990, 19, 189-215.
8. Wlodawer, A. and Erickson, J. W., Annu. Rev. Biochem., 1993, 62, 543-585.
9. Clercq, E. D., J. Med. Chem., 1995, 38, 2491-2517.
10. Erickson, J. W. and Burt, S. K., Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol., 1996, 36, 545-571.
11. Wlodawer, A. and Vondrasek, J., Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct., 1998, 27, 249-284.
12. Ridky, T. and Leis, J., J. Biol. Chem., 1995, 270, 29621-29623.
13. Condra, J. H., Schleif, W. A., Blahy, O. M., Gabryelski, L. J., Graham, D. J., Quintero, J. C., Rhodes, A., Robbins, H. L., Roth, E., Shivapraksh, M., Titus, D., Yang, T., Teppler, H., Squires, K. E., Deustsch, P. J. and Emini, E. A., Nature, 1995, 374, 569-571.
14. Coffin, J. M., Science, 1995, 267, 483-489.
15. Babé, L. M., Pichuantes, S. and Craik, C. S., Biochemistry, 1991, 30, 106-111.
16. McPhee, F., Good, A. C., Kuntz, I. D. and Craik, C. S., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1996, 93, 11477-11481.
17. Babé, L. M., Rosé, J. and Craik, C. S., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1995, 92, 10069-10073.
18. Bhat, T. N., Baldwin, E. T., Liu, B., Chen, Y. E. and Erickson, J. W., Natl. Struct. Biol., 1994, 1, 552-556.
19. Cheng, Y. E., Yin, F. H., Foundling, S., Blomstrom, D. and Kettner, C. A., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1990, 87, 9660-9664.
20. Dilanni, C. L., Davis, L. J., Holloway, M. K., Herber, W. K., Darke, P. L., Kohl, N. E. and Dixon, R. A. F., J. Biol. Chem., 1990, 265, 17348-17354.
21. Kräusslich, H., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1991, 88, 3213-3217.
22. Patterson, C. E., Seetharam, R., Kettner, C. A. and Cheng, Y. E., J. Virol., 1992, 66, 1228-1231.
23. Griffiths, J. T., Tomchak, L. A., Mills, J. S., Graves, M. C., Cook, N. D., Dunn, B. M. and Kay, J., J. Biol. Chem., 1994, 269, 4787-4793.
24. Darke, P. L., Jordan, S. P., Hall, D. L., Zugay, J. A., Shafer, J. A. and Kuo, L. C., Biochemistry, 1994, 33, 98-105.
25. Grant, S. K., Deckman, I. C., Gulp, J. S., Minnich, M. D., Brooks, I. S., Hensley, P., Debouck, C. and Meek, T. D., Biochemistry, 1992, 31, 9491-9501.
26. Louis, J. M., Clore, G. M. and Gronenborn, A. M., Natl. Struct. Biol., 1999, 6, 868-875.
27. Tomasselli, A. G., Hui, J. O., Sawyer, T. K., Staples, D. J., Bannow, C., Reardon, I. M., Howe, W. J., DeCamp, D. L., Craik, C. S. and Heinrkson, R. L., J. Biol. Chem., 1990, 265, 14675-14683.
28. Yamazaki, T., Nicholson, L. K., Torchia, D. A., Stahl, S. J., Kaufman, J. D., Wingfield, P. T., Domaille, P. J. and Campbell-Burk, S., Eur. J. Biochem., 1994, 219, 707-712.
29. Freedberg, D. I., Wang, Y., Stahl, S. J., Kaufman, J. D., Wingfield, P. T., Kiso, Y. and Torchia, D. A., J. Am. Chem. Soc., 1998, 120, 7916-7923.
30. Fitzgerald, P. M. D., McKeever, B. M., VanMiddlesworth, J. F., Springer, J. P., Heimbach, J. C., Leu, C., Herber, W. K., Dixon, R. A. F. and Darke, P. L., J. Biol. Chem., 1990, 265, 14209-14219.
31. Loo, J. A., Holler, T. P., Foltin, S. K., McConnell, P., Banotai, C. A., Home, N. M., Mueller, W. T., Stevenson, T. I. and Mack, D. P., Proteins: Struct. Funct. Genet., 1998, 2, 28-37.
32. Todd, M. J., Semo, N. and Freire, E., J. Mol. Biol., 1998, 283, 475-488.
33. Bodenhausen, G. and Ruben, D. J., Chem. Phys. Lett., 1980, 69, 185-189.
34. Kay, L. E., Ikura, M., Tschudin, R. and Bax, A., J. Magn. Reson., 1990, 89, 496-514.
35. Grzesiek, S. and Bax, A., J. Magn. Reson., 1992, 96, 432-440.
36. Grzesiek, S. and Bax, A., J. Magn. Reson., 1992, 99, 201-207.
37. Grzesiek, S. and Bax, A., J. Am. Chem. Soc., 1992, 114, 6291-6293.
38. Marion, D., Driscoll, P. C., Kay, L. E., Wingfield, P. T., Bax, A., Gronenborn, A. M. and Clore, G. M., Biochemistry, 1989, 28, 6150-6156.
39. Marion, D., Kay, L. E., Sparks, S. W., Torchia, D. A. and Bax, A., J. Am. Chem. Soc., 1989, 111, 1515-1517.
40. Bax, A. and Subramanian, S., J. Magn. Reson., 1986, 67, 565-569.
41. Lee, B. and Richards, F. M., J. Mol. Biol., 1971, 55, 379-400.
42. Wishart, D. S. and Sykes, B. D., J. Biomol. NMR, 1994, 4, 171-180.
43. Hvidt, A. and Nielsen, S. O., Adv. Protein. Chem., 1966, 21, 287-386.
44. Bahar, I., Wallqvist, A., Covell, D. G. and Jernigan, R. L., Biochemistry, 1998, 37, 1067-1075.
45. Sivaraman, T., Kumar, T. K. S. and Yu, C., Biochemistry, 1999, 28, 9899-9905.
46. Beatrice, M. P., Huyghues-Despointes, B. M. P., Scholtz, J. M. and Pace, C. N., Natl. Struct. Biol., 1999, 6, 910-912.
47. Katoh, E., Yamazaki, T., Kiso, Y., Wingfield, P. T., Stahl, S. J., Kaufman, J. D. and Torchia, D. A., J. Am. Chem. Soc., 1999, 121, 2607-2608.
48. Luque, I., Todd, M. J., Gómez, J., Semo, N. and Freire, E., Biochemistry, 1998, 37, 5791-5797.
49. Ishima, R., Wingfield, P. T., Stahl, S. J., Kaufman, J. D. and Torchia, D. A., J. Am. Chem. Soc., 1998, 120, 10534-10542.
50. Todd, M. J. and Freire, E., Proteins: Struct. Funct. Genet., 1999, 36, 147-156.
51. Ishima, R., Freedberg, D. I., Wang, Y., Louis, J. M. and Torchia, D. A., Structure, 1999, 7, 1047-1055.
52. Tawa, G. J., Topol, I. A., Burt, S. K. and Erickson, J. W., J. Am. Chem. Soc., 1998, 120, 8856-8863.
53. Persichini, T., Colasanti, M., Lauro, G. M. and Ascenzi, P., Biochem. Biophys. Res. Commun., 1998, 250, 575-576.