Phase Improvement by Multi-Start Simulated Annealing Refinement and Structure-Factor Averaging

Journal of Applied Crystallography

Volumn 31, Issue 5, 1998, Pages 798-805

  Rice, Luke M ^a   Shamoo, Yousif ^a   Brünger, Axel T ^a  

^a YALE UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 0001645813     PISSN: 00218898     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1107/S0021889898006645     Document Type: Article

References (36)

1. Adams, P. D., Pannu, N. S., Read, R. J. & Brünger, A. T. (1997). Proc. Natl Acad. Sci. USA, 94, 5018-5023.
2. Adams, P. D., Pannu, N. S., Read, R. J. & Brünger, A. T. (1998). In preparation.
3. Asselt, E. J. van., Perrakis, A., Kalk, K. H., Lamzin, V. S. & Dijkstra, B. W. (1998). Acta Cryst. D54, 58-73.
4. Branden, C. I. & Jones, A. T. (1990). Nature (London), 343, 687-689.
5. Bricogne, G. (1984). Acta Cryst. A40, 410-445.
6. Bricogne, G. (1997). Methods Enzymol. 276, 361-423.
7. Brünger, A. T. (1988). J. Mol. Biol. 203, 803-816.
8. Brünger, A. T. (1992). Nature (London), 355, 472-474.
9. Brünger, A. T., Adams, P. D., Clore, G. M., DeLano, W. L., Gros, P., Grosse-Kunstleve, R. W., Jiang, J.-S., Kuszewski, J., Nilges, M., Pannu, N. S., Read, R. J., Rice, L. M., Simonson, T. & Warren, G. L. (1998). Acta Cryst. D54, 905-921.
10. Brünger, A. T., Adams, P. D. & Rice, L. M. (1997). Structure, 5, 325-336.
11. Brünger, A. T., Kuriyan, J. & Karplus, M. (1987). Science, 235, 458-460.
12. Burling, F. T. & Brünger, A. T. (1994). Isr. J. Chem. 34, 165-175.
13. Gros, P., Betzel, C., Dauter, Z., Wilson, K. S. & Hol, W. G. J. (1989). J. Mol. Biol. 210, 347-367.
14. Gros, P., van Gunsteren, W. F. & Hol, W. G. J. (1990). Science, 249, 1149-1152.
15. Hendrickson, W. A. (1985). Methods Enzymol. 115, 252-270.
16. Hendrickson, W. A. (1991). Science, 254, 51-58.
17. Hodel, A., Kim, S.-H. & Brünger, A. T. (1992). Acta Cryst. A48, 851-859.
18. Jack, A. & Levitt, M. (1978). Acta Cryst. A34, 931-935.
19. James, M. N. G. & Sielecki, A. R. (1983). J. Mol. Biol. 163, 299-361.
20. Jiang, J.-S. & Brünger, A. T. (1994). J. Mol. Biol. 243, 100-115.
21. Kuriyan, J., Petsko, G. A., Levy, R. M. & Karplus, M. (1986). J. Mol. Biol. 190, 227-254.
22. Luzzati, V. (1952). Acta Cryst. 5, 802-810.
23. Murshudov, G. N., Vagin, A. A. & Dodson, E. J. (1997). Acta Cryst. D53, 240-255.
24. Nagai, K., Oubridge, C., Jessen, T. H., Li, J. & Evans, P. R. (1990). Nature (London), 348, 515-520.
25. Pannu, N. S., Murshudov, G. N., Dodson, E. J. & Read, R. J. (1998). Acta Cryst. D. In the press.
26. Pannu, N. S. & Read, R. J. (1996). Acta Cryst. A52, 659-668.
27. Perrakis, A., Sixma, T. K., Wilson, K. S. & Lamzin, V. S. (1997). Acta Cryst. D53, 448-455.
28. Read, R. J. (1986). Acta Cryst. A42, 140-149.
29. Read, R. J. (1990). Acta Cryst. A46, 900-912.
30. Read, R. J. (1997). Methods Enzymol. 278, 110-128.
31. Rice, L. M. & Brünger, A. T. (1994). Proteins, 19, 277-290.
32. Schiffer, C. A., Gros, P. & van Gunsteren, W. F. (1995). Acta Cryst. D51, 85-92.
33. Shamoo, Y., Krueger, U., Rice, L. M., Williams, K. R. & Steitz, T. A. (1997). Nat. Struct. Biol. 3, 215-222.
34. Sim, G. A. (1959). Acta Cryst. 12, 813-815.
35. Srinivasan, R. (1966). Acta Cryst. 19, 143-144.
36. Tronrud, D. E., Ten Eyck, L. F. & Matthews, B. W. (1987). Acta Cryst. A43, 489-500.