Molecular dynamics simulation of fluorination effects on a phospholipid bilayer

Journal of Chemical Physics

Volumn 111, Issue 21, 1999, Pages 9864-9870

  Smondyrev, A M ^a   Berkowitz, M L ^a  

^a University of North Carolina at Chapel Hill   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 0001363842     PISSN: 00219606     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1063/1.480323     Document Type: Article

References (29)

1. J. M. DeSimone, Z. Guan, and C. S. Elsbernd, Science 257, 945 (1992).
2. M. P. Krafft and J. G. Riess, Biochimie 80, 489 (1998).
3. F. Frezard, C. Santaella, M. J. Montisci, P. Vierling, and J. G. Riess, Biochim. Biophys. Acta 1194, 61 (1994).
4. C. Santaella, F. Frezard, P. Vierling, and J. G. Riess, FEBS Lett. 336, 481 (1993).
5. V. Ravily, L. Clary, C. Santaella, P. Vierling, and G. Duportail, Chem. Phys. Lipids 90, 75 (1997).
6. W. L. Jorgensen, J. Chandrasekhar, J. D. Madura, R. W. Impey, and M. L. Klein, J. Chem. Phys. 79, 926 (1983).
7. A. M. Smondyrev and M. L. Berkowitz, J. Comput. Chem. 20, 531 (1999).
8. J. P. Ryckaert and A. Bellemans, Chem. Phys. Lett. 30, 123 (1975).
9. M. E. Schmidt, S. Shin, and S. A. Rice, J. Chem. Phys. 104, 2101 (1995).
10. W. Smith and T. R. Forester, DL_POLY is a package of molecular simulation routines written by W. Smith and T. R. Forester, copyright The Council for the Central Laboratory of the Research Councils, Daresbury Laboratory at Daresbury, Nr. Warrington, United Kingdom, 1996.
11. H. I. Petrache, S. Tristram-Nagle, and J. F. Nagle, Chem. Phys. Lipids 95, 83 (1998).
12. T. J. McIntosh, S. A. Simon, P. Vierling, C. Santaella, and V. Ravily, Biophys. J. 71, 1853 (1996).
13. C. G. T. Tiddy, Modern Trends of Colloidal Science in Chemistry and Biology (Birkhauser Verlag, Basel, 1985).
14. J. P. Douliez, A. Léonard, and E. J. Dufourc, J. Phys. Chem. 100, 18450 (1996).
15. E. Egberts and H. J. C. Berendsen, J. Chem. Phys. 89, 3718 (1988).
16. V. Ravily, L. Clary, C. Santaella, P. Vierling, and G. Duportail, Chem. Phys. Lipids 90, 75 (1997).
17. A. J. Robinson, W. G. Richards, P. J. Thomas, and M. M. Hann, Biophys. J. 67, 2345 (1994).
18. S.-W. Chiu, M. Clark, V. Balaji, S. Subramaniam, H. L. Scott, and E. Jakobsson, Biophys. J. 69, 1230 (1995).
19. A. M. Smondyrev and M. L. Berkowitz, J. Chem. Phys. 110, 3981 (1999).
20. J. P. Douliez, A. Léonard, and E. J. Dufourc, Biophys. J. 68, 1727 (1995).
21. S. Shin, N. Collazo, and S. A. Rice, J. Chem. Phys. 98, 3469 (1992).
22. M. Pasenkiewicz-Gierula, Y. Takaoka, H. Miyagawa, K. Kitamura, and A. Kusumi, J. Phys. Chem. 101, 3677 (1997).
23. V. Vogel and D. Mobius, J. Colloid Interface Sci. 126, 408 (1988).
24. D. M. Taylor, O. N. de Oliveira, Jr., and H. Morgan, J. Colloid Interface Sci. 139, 508 (1990).
25. GAUSSIAN 98, M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, V. G. Zakrzewski, J. A. Montgomery, R. E. Stratmann, J. C. Burant, S. Dapprich, J. M. Millam, A. D. Daniels, K. N. Kudin, M. C. Strain, O. Farkas, J. Tomasi, V. Barone, M. Cossi, R. Cammi, B. Mennucci, C. Pomelli, C. Adamo, S. Clifford, J. Ochterski, G. A. Petersson, P. Y. Ayala, Q. Cui, K. Morokuma, D. K. Malick, A. D. Rabuck, K. Raghavachari, J. B. Foresman, J. Cioslowski, J. V. Ortiz, B. B. Stefanov, G. Liu, A. Liashenko, P. Piskorz, I. Komaromi, R. Gomperts, R. L. Martin, D. J. Fox, T. Keith, M. A. Al-Laham, C. Y. Peng, A. Nanayakkara, C. Gonzalez, M. Challacombe, P. M. W. Gill, B. G. Johnson, W. Chen, M. W. Wong, J. L. Andres, M. Head-Gordon, E. S. Replogle, and J. A. Pople, Gaussian, Inc., Pittsburgh PA, 1998.
26. M. A. Habib and J. O. Bockris, Langmuir 2, 388 (1986).
27. A. M. Smondyrev and M. L. Berkowitz, Biophys. J. 76, 2472 (1999).
28. D. J. Hirsh, N. Lazaro, L. R. Wright, J. M. Boggs, T. J. McIntosh, J. Schaefer, and J. Blazyk, Biophys. J. 75, 1858 (1998).
29. M. E. Schmidt, S. Shin, and S. A. Rice, J. Chem. Phys. 104, 2101 (1996).