Structural aspects of factor Xa inhibition

Current Pharmaceutical Design

Volumn 2, Issue 5, 1996, Pages 543-552

  Stubbs II, Milton T ^a,b  

^a MAX PLANCK INSTITUTE OF BIOCHEMISTRY   (Germany)

^b PHILIPPS UNIVERSITY MARBURG   (Germany)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 0001067684     PISSN: 13816128     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: None     Document Type: Article

References (68)

1. Weitz, J.; Hirsch, J.; J Lab. Clin. Med. 1993. 122, 364.
2. Bode, W.; Mayr, I.; Baumann, U.; Huber, R.; Stone, S.R ; Hofsteenge, J.. EMBO J., 1989, 8, 3467
3. Bode, W.; Turk, D.; Karshikov, A : Protein Sci., 1992, 1, 426
4. Stubbs, M.T.; Bode, W : Perspectives in Drug Discovery and Design. 1993, 1, 431.
5. Stubbs, M.T , Bode, W.; Trends Biochem. Sci., 1995, 20, 23
6. Stubbs, M.T.; Bode, W.; Curr Op Struct. Biol. 1994, 4, 823.
7. Davie, E.W.; Fujikawa, K.; Kisiel, W.; Biochemistry, 1991, 30: 10364.
8. Suzuki, H.; Harada, A.; Hayashi, Y.; Wada, K.; Asaka, J.-i.; Gotoh, B.: Ogasawara, T.; Nagai, Y.; FEBS Lett., 1991, 283, 281.
9. Mao, S.-S.; Perspectives in Drug Discovery and Design, 1993, 1, 423.
10. Padmanabhan, K.; Padmanabhan, K.P.; Tulinsky, A.; Park, C.H.; Bode, W.; Huber, R.; Kisiel, W. J Mol. Biol., 1993, 232, 947.
11. Stubbs, M.T ; Huber, R.; Bode, W.; FEBS Lett., 1995, 375, 103.
12. Brandstetter, H.; Kühne, A.; Bode, W ; Huber, R.; von der Saal, W.; Wirthensohn, K.; Engh, R.A.; J. Biol. Chem., 1996, in press.
13. Birktoft, J.J.; Norris, K ; Norris, F.; Thromb. Haemost., 1993, 69 679.
14. [13a] Burgering, M.J.M.; Orbons, L.P.M.; van der Doelen, A.; Mulders, J.; Theunissen, H.J M.; Visser, A.; Grootenhuis, P.D.J.; Bode, W.; Huber, R , Stubbs, M.T.; Submitted for publication.
15. Stassen, J.M., Lambeir, A.-M ; Matthyssens, G.; Ripka, W C.; Nyström, Å.; Sixma, J.J.; Vermylen, J.; Thromb. Haemost., 1995, 74, 646
16. Antuch, W ; Guntert, P.; Billeter, M ; Hawthorne, T , Grossenbacher, H.; Wuthrich, K.; FEBS Lett., 1994, 352, 251.
17. Lim-Wilby, M.S.L.; Hallenga, K.; de Maeyer, M.; Lasters, I.; Vlasuk, G.P.; Brunck, T.K.; Protein Science. 1995, 4, 178
18. Dunwiddie, C.T ; Neeper, M.P.; Nutt, E.M ; Waxman, L.; Smith, D.E.; Hofmann, K.J ; Lumma, P.K.; Garsky, V.M.; Vlasuk, G.P.; Biochemistry, 1992, 31, 12126.
19. Mao, S.-S.; Huang, J.; Welebob, C.; Neeper, M.P.; Garsky, V.M.; Shafer, J.A. Biochemistry, 1995, 34, 5098.
20. van de Locht, A.; Stubbs, M T.; Bode, W.; Friedrich, T.; Bollschweiler, C ; Hoffken, W.; Huber, R : EMBO J , 1996, in the press.
21. Stubbs, M.T ; Bode, W. Trends Cardiovasc Med., 1995, 5, 157.
22. Engh, R.A.; Huber, R.; Bode, W ; Schulze, A.J.; Trends in Biotechnology, 1995, 13, 503.
23. Mann, K G : Trends Biochem Sci., 1987, 12, 229.
24. Mann, K G.; Nesheim, M.E.; Church, W.R.; Haley, P ; Krishnaswamy, S.; Blood. 1990, 76, 1
25. Stubbs M T ; Bode W : Thrombosis Research, 1993, 69, 1.
26. Chen Z.G.; Bode W.; J Mol. Biol., 1983, 164, 283
27. Tidwell, R.R., Webster, W.P., Shaver, S R.; Geratz, J D.; Thromb Res., 1980, 19, 339.
28. Stürzebecher, J.; Stürzebecher, U.; Vieweg, H.; Wagner, G.; Hauptmann, J.; Markwardt, F.; Thromb. Res., 1989, 54, 245.
29. Katakura, S.; Nagahara, T ; Hara, T.; Iwamoto, M.; Biochem. Biophys. Res. Comm., 1993, 197, 965.
30. Hara, T.; Yokoyama, A.; Ishihara, H.; Yokoyama, Y ; Nagahara, T.; Iwamoto, M.; Thromb. Haemost., 1994, 71, 314.
31. Stubbs, M.T., Oschkinat, H.; Mayr, I.; Huber, R.; Angliker, H.; Stone, S.R.; Bode, W.; Eur. J. Biochem., 1992, 206, 187.
32. Katakura, S.; Nagahara, T.; Hara, T.; Kunitada, S.; Iwamoto, M.; Eur. J. Med. Chem., 1995, 30, 387.
33. Lin, Z.; Johnson, M.E.; FEBS Lett., 1995, 370, 1.
34. Brandstetter, H.; Turk, D.; Höfften, W.; Grosse, D.; Stürzebecher, J.; Martin, P.D.; Edwards, B.F.P.; Bode, W.; J. Mol. Biol., 1992, 226, 1085.
35. Broze, G.J. Jr; Thromb. Haemost., 1995, 74, 90.
36. Girard, T.J.; Warren, L.A.; Novotny, W.F.; Likert, K.M.; Brown, S.G.; Miletich, J.P.; Broze, G.J.Jr.; Nature, 1989, 338, 518.
37. Enjyoji, K.-i ; Miyata, T.; Kamikubo, Y.-i.; Kato, H.; Biochemistry, 1995, 34, 5725.
38. Valentin, S.; Nordfang, O ; Bregengard, C.; Wildgoose, P.; Blood Coagul. Fibrinol., 1993, 4, 713.
39. Petersen, L.C.; Bjørn, S.E.; Nordfang, O.: Thromb. Haemost., 1992, 67, 537.
40. Higuchi, D.A.; Wun, T.-C.; Likert, K.; Broze, G.J Jr.; Blood, 1992, 79, 1712
41. Wesselschmidt, R.; Likert, K.; Girard, T.; Wun, T.-C.; Broze, G.J.Jr.; Blood, 1991, 78, 2004.
42. Nordfang, O.; Bjørn, S.E.; Valentin, S.; Nielsen, L.S.; Wildgoose, P.; Beck, T C.; Hedner, U.; Biochemistry, 1991, 30, 10371.
43. Hamamoto, T.; Yamamoto, M.; Nordfang, O.; Petersen, J G.L.; Foster, D.; Kisiel, W.; J. Biol. Chem, 1993, 268, 8704.
44. Diaz-Collier, J.A.; Palmier, M.O ; Kretzmer, K.K., Bishop, B.F.; Combs, R.G ; Obukowicz, M.G.; Frazier, R.B.; Bild, G.S., Joy, W.D.; Hill, S.R.; Duffin, K.L.; Gustafson, ME; Junger, K.D.; Grabner, R.W.; Galluppi, G.R.; Wun, T.-C.; Thromb. Haemost., 1994, 71, 339.
45. Huang, Z.-F.; Wun, T.-C.; Broze, G J.; J. Biol. Chem , 1993, 268, 26950.
46. Petersen, L.C.; Bjørn, S.E ; Olsen, O.H.; Nordfang, O.; Norris, F.; Norns, K.; Eur. J. Biochem., 1996, 235, 310.
47. Day, K.K ; Welsch, D J.. Throm. Res., 1992, 68, 369.
48. De Maeyer, M ; Lambeir, A.-M.; Laroche, Y.; Lasters, I.; Lauwereys, M.; Matthyssens, M.; Stanssens, P ; Ripka, W.; Vlasuk, G.; Thromb. Haemost., 1993, 69, 888.
49. De Maeyer, M.; Lambeir, A.-M.; Laroche, Y.; Lasters, I.; Lauwereys, M.; Matthyssens, M ; Stanssens, P ; Ripka, W.; Vlasuk, G.; Thromb. Haemost, 1993, 69, 889
50. Huber, R ; Kukla, D , Bode, W., Schwager, P.; Bartels, K.; Deisenhofer, J.; Steigemann, W.; J Mol. Biol. 1974, 89, 73.
51. Bode W.; Huber R.; 1992. Eur. J. Biochem, 1992,. 204, 433.
52. Laskowski, M.; Kato, I. Ann Rev. Biochem., 1980, 49, 593.
53. Waxman, L ; Smith, D E.; Arcun, K.E.; Vlasuk, G.P : Science, 1990, 248, 593.
54. Vlasuk, G P.; Thromb. Haemostasis, 1993, 70, 212.
55. Jordan, S P , Mao, S.-S.; Lewis, S.D ; Shafer, J A.; Biochemistry, 1992, 57, 5374.
56. Krishnaswamy, S.; Vlasuk, G.P.; Bergum, P.W.; Biochemistry, 1994, 33, 7897.
57. Dunwiddie, C.T.; Smith, D.E.; Nutt, E.M.; Vlasuk, G.P.; Thromb. Res , 1991, 64, 787.
58. Schaffer, L.W.; Davidson, J.T.; Vlasuk, G.P ; Siegl, P K.S.; Circulation, 1991, 84, 1741
59. Vlasuk, G P.; Ramjit, D., Fujita, T ; Dunwiddie, C.T.; Nutt, E.M.; Smith, D.E ; Shebuski, R.J. Thromb. Haemostasis, 1991, 65, 257.
60. Sitko, G R.; Ramjit, D.R.; Stabilito, H.; Lehman, D ; Lynch, J.J.; Vlasuk, G.P.; Circulation , 1992, 85, 805
61. Rydel, T.J.; Ravichandran, K.G.; Tulinsky, A ; Bode, W.; Huber, R.; Roitsch, C.; Fenton, J W.II.; Science, 1990, 249, 277.
62. Grutter, M.G.; Priestle, J.P.; Rahuel, J ; Grossenbacher, H.; Bode, W.; Hofsteenge, J.; Stone, S.R.:, EMBO J., 1990, 9, 2361
63. Szyperski, T ; Güntert, P.; Stone, S.R.; Tulinsky, A.; Bode, W.; Huber, R.; Wuthnch, K.; J. Mol. Biol , 1992, 228, 1206.
64. van de Locht, A.; Lamba, D.; Bauer, M.; Huber, R.; Friedrich, T.; Kröger, B ; Hofften, W.; Bode, W.; EMBO J. 1995, 14, 5149.
65. Nagahara, T : Yokoyama, Y.; Inamura, K.; Katakura, S.; Komoriya, S.; Yamaguchi, H.; Hara, T , Iwamoto, M.: J. Med. Chem., 1994, 37, 1200.
66. Kraulis, P.J.; J. Appl. Crystallogr., 1991, 24, 946.
67. Turk, D. Weiterentwicklung eines Programms fur Molekülgraphik und Elektronendichte-Manipulation und seine Anwendung auf verschiedene Protein-Strukturaufklärungen. Ph.D. Thesis, Technische Universität Munchen, 1992
68. Barton, G.J.; Protein Engineering, 1993, 1, 37.