Effective atomic charge model for solvent and ion screening effect in iterative calculation and application to Monte Carlo simulation

Journal of Physical Chemistry

Volumn 100, Issue 34, 1996, Pages 14520-14525

  Tazaki, Koichi ^a   Doi, Junta ^a  

^a UNIVERSITY OF TOKYO   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 0000786850     PISSN: 00223654     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp9536312     Document Type: Article

References (23)

1. Nicholls, A.; Honig, B. J. Comput. Chem. 1991, 12, 435.
2. Rogers, N.; Sternberg, M. J. Mol. Biol. 1984, 174, 527.
3. Nakamura, H.; Niahis, S. J. Phys. Soc. Jpn. 1987, 56, 1609.
4. Luty, B. A.; E. Davis, M.; McCammon, J. A. J. Comput. Chem. 1992, 13, 768.
5. Yoon, B. J.; M. Lenhoff, A. J. Phys. Chem. 1992, 96, 3130.
6. Gilson, M. K.; Honig, B. Proteins 1988, 4, 7.
7. Juffer, A. H.; Botta, E. F. F.; Keulen, ban B. A. M.; Ploeg, van de A.; Berendsen, H. J. C. J. Comput. Phys. 1991, 97, 144.
8. Davis, M. E.; McCammon, J. A. J. Comput. Chem. 1991, 12.
9. Niedermeier, C.; Schulten, K. Mol. Sim. 1992, 8, 361.
10. Gilson, M. K.; Davis, M. E.; Luty, B. A.; McCammon, J. A. J. Phys. Chem. 1993, 97, 3591.
11. Sharp, K. J. Comput. Chem. 1991. 12, 454.
12. Gilson, M. K.; McCammon, J. A.; Madura, J. D. J. Comput. Chem. 1995, 16, 1081.
13. Holst, M.; Kozack, R. E.; Saied, F.; Subramaniam, S. Proteins 1994, 18, 231.
14. Lee, B.; Richards, F. M. J. Mol. Biol. 1971, 55, 379.
15. Sharp, K.; Honig, B. Annu. Rev. Biophys. Biophys. Chem. 1990, 19, 301.
16. Schmidt, A. B.; Fine, R. M. Mol. Sim. 1994, 13, 347.
17. Marlow, G. E.; Perkyns, J. S.; Pettitt, B. M. Chem. Rev. 1993, 93, 2503.
18. Brooks, C. L., III; Case, D. A. Chem. Rev. 1993, 93, 2487.
19. Gould, I. R.; Hillier, I. H. J. Chem. Soc., Chem. Commun. 1993, 951, 952.
20. Smith, P. E.; Pettitt, B. M.; Karplus, M. J. Phys. Chem. 1993, 97, 6907.
21. Kneller, G. R.; Doster, W.; Settle, M.; Smith, J. C. J. Chem. Phys. 1992, 97.
22. Beglov, D.; Roux, B. J. Chem. Phys. 1994, 100, 9050.
23. Madison, V.; Kopple, K. D. J. Am. Chem. Soc. 1980, 102, 4855.