The Conformational Flexibility of Oxidized Cytochrome c Studied through Its Interaction with NH3 and at High Temperatures

European Journal of Inorganic Chemistry

Volumn , Issue 5, 1998, Pages 583-591

  Banci, Lucia ^a   Bertini, Ivano ^a   Spyroulias, Georgios A ^a   Turano, Paola ^a  

^a UNIVERSITY OF FLORENCE   (Italy)

Author keywords

Cytochrome c; Heme proteins; Hyperfine shift; Magnetic susceptibility anisotropy; NMR spectroscopy

Indexed keywords

AMINO ACIDS; CIRCULAR DICHROISM SPECTROSCOPY; CYANIDES; ELECTRON SPIN RESONANCE SPECTROSCOPY; LIGANDS; MAGNETIC ANISOTROPY; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY; PORPHYRINS; PROTEINS;

CONFORMATIONAL FLEXIBILITY; CYTOCHROME C; HEME-PROTEINS; HIGH PH; HIGHEST TEMPERATURE; HYPERFINE SHIFT; MAGNETIC SUSCEPTIBILITY ANISOTROPY; NMR-SPECTROSCOPY; OXIDIZED CYTOCHROME; SUSCEPTIBILITY ANISOTROPY;

MAGNETIC SUSCEPTIBILITY;

EID: 0000641398     PISSN: 14341948     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/(SICI)1099-0682(199805)1998:5<583::AID-EJIC583>3.0.CO;2-Y     Document Type: Article

References (90)

1. M. E. P. Murphy, B. T. Nall, G. D. Brayer, J. Mol. Biol. 1992, 227, 160-176.
2. G. W. Bushnell, G. V. Louie, G. D. Brayer, J. Mol. Biol. 1990, 214, 585-595.
3. H. Ochi, Y. Hata, N. Tanaka, M. Kakudo, T. Sakuri, S. Achara, Y. Morita, J. Mol. Biol. 1983, 166, 407-418.
4. A. M. Berghuis, G. D. Brayer, J. Mol. Biol. 1992, 223, 959-976.
5. G. V. Louie, G. D. Brayer, J. Mol. Biol. 1990, 214, 527-555.
6. T. Takano, R. E. Dickerson, J. Mol. Biol. 1981, 153, 95-155.
7. T. Takano, R. E. Dickerson, J. Mol. Biol. 1981, 153, 79-94.
8. P. Baistrocchi, L. Banci, I. Bertini, P. Turano, K. L. Bren, H. B. Gray, Biochemistry 1996, 35, 13788-13796.
9. L. Banci, I. Bertini, K. L. Bren, H. B. Gray, P. Sompornpisut, P. Turano, Biochemistry 1997, 36, 8992-9001.
10. L. Banci, I. Bertini, H. B. Gray, C. Luchinat, T. Reddig, A. Rosato, P. Turano, Biochemistry 1997, 36, 9867-9877.
11. P. X. Qi, D. L. Di Stefano, A. J. Wand, Biochemistry 1994, 33, 6408-6417.
12. P. X. Qi, R. A. Beckman, A. J. Wand, Biochemistry 1996, 35, 12275-12286.
13. A. Schejter, P. George, Biochemistry 1965, 3, 1045-1049.
14. G. Taler, A. Schejter, G. Navon, I. Vig, E. Margoliash, Biochemistry 1995, 34, 14209-14212.
15. G. R. Moore, G. W. Pettigrew, Cytochromes c; Evolutionary, Structural and Physicochemical Aspects, Springer-Verlag, Berlin, 1990.
16. H. Theorell, A. Akesson, J. Am. Chem. Soc. 1941, 63, 1804-1811.
17. P. B. Barker, A. G. Mauk, J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 3619-3624.
18. D. W. Dixon, X. Hong, S. E. Woehier, Biophys. J. 1989, 56, 339-351.
19. T. Jordan, J. C. Eads, T. G. Spiro, Protein Sci. 1995, 4, 716-728.
20. J. Babul, E. Stellwagen, Biopolymers 1971, 10, 2359-2361.
21. J. Babul, E. Stellwagen, Biochemistry 1972, 11, 1195-1200.
22. T. Y. Tsong, Biochemistry 1975, 14, 1542-1547.
23. K. Muthukrishnan, B. T. Nall, Biochemistry 1991, 30, 4706-4710.
24. W. Colon, L. P. Wakem, F. Sherman, H. Roder, Biochemistry 1997, 36, 12535-41.
25. B. T. Nall in Cytochrome c. A Multidisciplinary Approach (Eds.: R. A. Scott, A. G. Mauk), University Science Books, Sausalito, CA, 1996,chapter 4.
26. M. T. Wilson, C. Greenwood, in Cytochrome c. A Multidisciplinary Approach (Eds.: R. A. Scott, A. G. Mauk), University Science Books, Sausalito, CA, 1996, chapter 19.
27. A. V. Xavier, D. L. Turner, H. Santos, Methods Enzymol. 1993, 227, 1-16.
28. H. Santos, D. L. Turner, Eur. J. Biochem. 1992, 206, 721-728.
29. H. Santos, D. L. Turner, Biochim. Biophys. Acta 1988, 954, 277-286.
30. Y. Q. Feng, H. Roder, S. W. Englander, Biophys. J. 1990, 57, 15-22.
31. G. Williams, N. J. Clayden, G. R. Moore, R. J. P. Williams, J. Mol. Biol. 1985, 183, 447-460.
32. Y. Gao, J. Boyd, G. J. Pielak, R. J. P. Williams, Biochemistry 1991, 30, 1928-1934.
33. D. L. Turner, R. J. P. Williams, Eur. J. Biochem. 1993, 211, 555-562.
34. X. Hong, D. W. Dixon, FEBS Lett. 1989, 246, 105-108.
35. L. L. Pearce, A. L. Gartner, M. Smith, A. G. Mauk, Biochemistry 1989, 28, 3152-3156.
36. J. Angstrom, G. M. Moore, R. J. P. Williams, Biochim. Biophys. Acta 1982, 703, 87-94.
37. D. L. Brautigan, B. A. Feinberg, B. M. Hoffman, E. Margoliash, J. Peisach, W. E. Blumberg, J. Biol. Chem. 1977, 252, 574-582.
38. D. O. Lambeth, K. L. Campbell, R. Zand, G. Palmer, J. Biol. Chem. 1973, 248, 8130-8136.
39. L. A. Davis, A. Schejter, G. P. Hess, J. Biol. Chem. 1974, 249, 2624-2632.
40. Y. Looze, E. Polastro, M. Deconinck, J. Leonis, Int. J. Peptide Protein Res. 1978, 12, 233-236.
41. C. Greenwood, M. T. Wilson, Eur. J. Biochem. 1971, 22, 5-10.
42. N. Osheroff, D. Borden, W. H. Koppenol, E. Margoliash, J. Biol. Chem. 1980, 255, 1689-1697.
43. H. T. Smith, F. Millet, Biochemistry 1980, 19, 1117-1120.
44. G. Gupta, S. H. Koenig, Biochem. Biophys. Res. Commun. 1971, 45, 1134-1143.
45. J. B. Wooten, J. S. Cohen, I. Vig, A. Schejter, Biochemistry 1981, 20, 5394-5402.
46. K. E. Falk, P. A. Jovall, J. Angstrom, Biochem. J. 1981, 193, 1021-1024.
47. P. M. A. Gadsby, J. Peterson, N. Foote, C. Greenwood, A. J. Thomson, Biochem. J. 1987, 246, 43-54.
48. T. Kitagawa, Y. Ozaki, J. Teroaka, Y. Kyogoku, T. Yamanaka, Biochim. Biophys. Acta 1977, 494, 100-114.
49. J. C. Ferrer, J. G. Guillemette, R. Bogumil, S. C. Inglis, M. Smith, A. G. Mauk, J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 7507-7508.
50. W. Shao, Y. Yao, G. Liu, W. Tang, Inorg. Chem. 1993, 32, 6112-6114.
51. W. Shao, J. Sun, Y. Yao, W. Tang, Inorg. Chem. 1995, 34, 680-687.
52. Y. P. Myer, Biochemistry 1972, 11, 4203-4208.
53. S. E. J. Rigby, G. R. Moore, J. C. Gray, P. M. A. Gadsby, S. J. George, A. J. Thomson, Biochem. J. 1988, 256, 571-577.
54. Y. Q. Feng, H. Roder, S. W. Englander, A. J. Wand, D. L. Di Stefano, Biochemistry 1989, 28, 195-203.
55. G. N. La Mar, J. S. de Ropp, K. M. Smith, K. C. Langry, J. Biol. Chem. 1980, 255, 6646-6652.
56. J. D. Satterlee, J. E. Erman, G. N. La Mar, K. M. Smith, K. C. Langry, Biochim. Biophys. Acta 1983, 743, 246-255.
57. L. Banci, I. Bertini, P. Turano, M. Tien, T. K. Kirk, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1991, 88, 6956-6960.
58. J. S. de Ropp, G. N. La Mar, H. Wariishi, M. H. Gold, J. Biol. Chem. 1991, 266, 15001-15008.
59. L. Banci, I. Bertini, E. A. Pease, M. Tien, P. Turano, Biochemistry 1992, 31, 10009-10017.
60. K. L. Bren, H. B. Gray, L. Banci, I. Bertini, P. Turano, J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 8067-8073.
61. T. Pascher, J. P. Chesick, J. R. Winkler, H. B. Gray, Science 1996, 271, 1558-1560.
62. J. R. Winkler, P. Wittung, I Leckner, B. G. Malmström, H. B. Gray, Proc. Natl. Acad Sci. USA 1997, 94, 4246-4249.
63. K. L. Bren, H. B. Gray, L. Banci, I. Bertini, P. Turano, Chem. Biol. 1995, 2, 355-363.
64. L. Banci, I. Bertini, K. L. Bren, H. B. Gray, P. Sompornpisut, P. Turano, Biochemistry 1995, 34, 11385-11398.
65. L. Banci, I. Bertini, K. L. Bren, M. A. Cremonini, H. B. Gray, C. Luchinat, P. Turano, JBIC 1996, 1, 117-126.
66. L. Banci, I. Bertini, G. Gori Savellini, A. Romagnoli, P. Turano, M. A. Cremonini, C. Luchinat, H. B. Gray, Proteins Struct. Funct. Genet. 1997, 29, 68-76.
67. F. A. Walker, J. Buehler, J. T. West, J. L. Hinds, J. Am. Chem. Soc. 1983, 105, 6923-6929.
68. F. A. Walker, U. Simonis, in NMR of Paramagnetic Molecules (Eds.: L. J. Berliner, J. Reuben), Plenum Press, New York, 1993.
69. N. V. Shokhirev, F. A. Walker, J. Phys. Chem. 1995, 99, 17795-17804.
70. F. A. Walker, M. Benson, J. Phys. Chem. 1982, 86, 3495-3499.
71. F. A. Walker, D. Reis, V. L. Balke, J. Am. Chem. Soc. 1984, 106, 6888-6898.
72. R. G. Shulman, S. H. Glarum, M. Karplus, J. Mol. Biol. 1971, 57, 93-115.
73. D. L. Turner, C. A. Salgueiro, P. Schenkels, J. LeGall, A. V. Xavier, Biochim. Biophvs. Acta 1995, 1246, 24-28.
74. D. L. Turner, Eur. J. Biochem. 1995, 227, 829-837.
75. L. Banci, A. Rosato, P. Turano, JBIC 1996, 1, 364-367.
76. S. D. Emerson, G N. La Mar, Biochemistry 1990, 29, 1556-1566.
77. K. Rajarathnam, G. N. La Mar, M. L. Chiu, S. G. Sugar, J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 9048-9058.
78. L. Banci, R. Pierattelli, D. L. Turner, Eur. J. Biochem. 1996, 232, 522-527.
79. R. L. Void, J. S. Waugh, M. P. Klein, D. E. Phelps, J. Chem. Phys. 1968, 48, 3831-3832.
80. T. Inubushi, E. D. Becker, J. Magn. Reson. 1983, 51, 128-133.
81. L. Banci, I. Bertini, C. Luchinat, M. Piccioli, A. Scozzafava, P. Turano, Inorg. Chem. 1989, 28, 4650-4656.
82. S. Macura, K. Wüthrich, R. R. Ernst, J. Magn. Reson. 1982, 47, 351-357.
83. A. Bax, D. G. Davis, J. Magn. Reson. 1985, 65, 355-360.
84. C. Eccles, P. Güntert, M. Billeter, K. Wüthrich, J. Biomol. NMR 1991, 1, 111-130.
85. R. H. Holm, C. J. Hawkins, in NMR of Paramagnetic Molecules. Principles and Applications (Eds.: G. N. La Mar, W. D. Horrocks, Jr., R. H. Holm), Academic Press, New York, 1973, chapter 7.
86. I. Bertini, C. Luchinat, NMR of Paramagnetic Molecules in Biological Systems, Benjamin/Cummings, Menlo Park, CA, 1986,
87. I. Bertini, C. Luchinat, "NMR of Paramagnetic Substances", Coord. Chem. Rev. 150, Elsevier, Amsterdam, 1996, p. 1
88. I. Bertini, P. Turano, "NMR of Paramagnetic Macromolecules", NATO ASI Series (Ed.: G. N. La Mar), Kluwer Academic, Dordrecht, 1994.
89. H. M. McConnell, R. E. Robertson, J. Chem. Phys. 1958, 29, 1361-1365.
90. A. J. Wand, D. L. Di Stefano, Y. Q. Feng, H. Roder, S. W. Englander, Biochemistry 1989, 28, 186-194.