Solvation and Hydrogen-Bonding Effects on Proton Wires

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 103, Issue 15, 1999, Pages 2891-2898

  Decornez, Hélène ^a   Drukker, Karen ^a   Hammes Schiffer, Sharon ^a  

^a UNIVERSITY OF NOTRE DAME   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 0000609352     PISSN: 10895639     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp984775u     Document Type: Article

References (61)

1. Baciou, L.; Michel, H. Biochemistry 1995, 34, 7967.
2. Martinez, S. E.; Huang, D.; Ponomarev, M.; Cramer, W. A.; Smith, J. L. Protein Sci. 1996, 5, 1081.
3. von Grotthus, C. J. D. Ann. Chim. LVIII 1806, 54.
4. Pomès, R.; Roux, B. Chem. Phys. Lett. 1995, 234, 416.
5. Pomès, R.; Roux, B. J. Phys. Chem. 1996, 100, 2519.
6. Pomès, R.; Roux, B. Biophys. J. 1998, 75, 33.
7. Lobaugh, J.; Voth, G. A. J. Chem. Phys. 1996, 104, 2056.
8. Schmitt, U.; Voth, G. A. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 5547.
9. Duan, X.; Scheiner, S. J. Mol. Struct. 1992, 270, 173.
10. Cheng, H.-P.; Barnett, R. N.; Landman, U. Chem. Phys. Lett. 1995, 237, 161.
11. Laasonen, K.; Sprik, M.; Parrinello, M.; Car, R. J. Chem. Phys. 1993, 99, 9080.
12. Tuckerman, M.; Laasonen, K.; Sprik, M.; Parrinello, M. J. Chem. Phys. 1995, 103, 150.
13. Tuckerman, M. E.; Marx, D.; Klein, M. L.; Parrinello, M. Science 1997, 275, 817.
14. Sagnella, D. E.; Laasonen, K.; Klein, M. L. Biophys. J. 1996, 71, 1172.
15. Kreuer, K.-D. Chem. Mater. 1996, 8, 610.
16. Schmidt, R. G.; Brickmann, J. Ber. Bunsen-Ges. Phys. Chem. 1997, 101, 1816.
17. Agmon, N. Chem. Phys. Lett. 1995, 244, 456.
18. Billeter, S. R.; van Gunsteren, W. F. Comput. Phys. Comm. 1997, 107, 61.
19. Vuilleumier, R.; Borgis, D. Chem. Phys. Lett. 1998, 284, 71.
20. Vuilleumier, R.; Borgis, D. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 4261.
21. Hammes-Schiffer, S. J. Chem. Phys. 1996, 105, 2236.
22. Drukker, K.; Hammes-Schiffer, S. J. Chem. Phys. 1997, 107, 363.
23. Drukker, K.; de Leeuw, S.; Hammes-Schiffer, S. J. Chem. Phys. 1998, 108, 6799.
24. Meyer, E. Protein Sci. 1992, 1, 1543.
25. Pomès, R.; Roux, B. Biophys. J. 1996, 71, 19.
26. Morillo, M.; Cukier, R. I. J. Chem. Phys. 1990, 92, 4833.
27. Suárez, A.; Silbey, R. J. Chem. Phys. 1991, 94, 4809.
28. Warshel, A.; Chu, Z. T. J. Chem. Phys. 1990, 93, 4003.
29. Aqvist, J.; Warshel, A. Chem. Rev. 1993, 93, 2523.
30. Truhlar, D. G.; Liu, Y.-P.; Schenter, G. K.; Garrett, B. C. J. Phys. Chem. 1994, 98, 8396.
31. Borgis, D.; Tarjus, G.; Azzouz, H. J. Phys. Chem. 1992, 96, 3188.
32. Borgis, D.; Tarjus, G.; Azzouz, H. J. Chem. Phys. 1992, 97, 1390.
33. Laria, D.; Ciccotti, G.; Ferrario, M.; Kapral, R. J. Chem. Phys. 1992, 97, 378.
34. Borgis, D.; Hynes, J. T. Chem. Phys. 1993, 170, 315.
35. Mavri, J.; Berendsen, H. J. C.; van Gunsteren, W. F. J. Phys. Chem. 1993, 97, 13469.
36. Mavri, J.; Berendsen, H. J. C. J. Phys. Chem. 1995, 99, 12711.
37. Staib, A.; Borgis, D.; Hynes, J. T. J. Chem. Phys. 1995, 102, 2487.
38. Ando, K.; Hynes, J. T. J. Mol. Liq. 1995, 64, 25.
39. Bala, P.; Lesyng, B.; McCammon, J. A. Chem. Phys. 1994, 180, 271.
40. Bala, P.; Grochowski, P.; Lesyng, B.; McCammon, J. A. J. Phys. Chem. 1996, 100, 2535.
41. Hammes-Schiffer, S.; Tully, J. C. J. Chem. Phys. 1994, 101, 4657.
42. Hammes-Schiffer, S.; Tully, J. C. J. Phys. Chem. 1995, 99, 5793.
43. Li, D.; Voth, G. A. J. Phys. Chem. 1991, 95, 10425.
44. Hwang, J.-K.; Warshel, A. J. Phys. Chem. 1993, 97, 10053.
45. Hwang, J.-K.; Chu, Z. T.; Yadav, A.; Warshel, A. J. Phys. Chem. 1991, 95, 8445.
46. Lobaugh, J.; Voth, G. A. Chem. Phys. Lett. 1992, 198, 311.
47. Lobaugh, J.; Voth, G. A. J. Chem. Phys. 1994, 100, 3039.
48. Azzouz, H.; Borgis, D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 7361.
49. Hammes-Schiffer, S. Advances in Classical Trajectory Methods; JAI Press Inc.: London, 1998; Vol. 3, pp 73-119.
50. Hammes-Schiffer, S. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 10443.
51. Tully, J. C. J. Chem. Phys. 1990, 93, 1061.
52. 53 This new method will be incorporated into future simulations.
53. Fang, J.-Y.; Hammes-Schiffer, S. J. Chem. Phys. (in press).
54. Morelli, J.; Hammes-Schiffer, S. Chem. Phys. Lett. 1997, 269, 161.
55. Fang, J.-Y.; Hammes-Schiffer, S. J. Chem. Phys. 1997,107, 8933.
56. Stillinger, F. H.; David, C. W. J. Chem. Phys. 1978, 69, 1473.
57. Weber, T. A.; Stillinger, F. H. J. Phys. Chem. 1982, 86, 1314.
58. Stillinger, F. H. J. Chem. Phys. 1979, 71, 1647.
59. Andersen, H. C. J. Comput. Phys. 1983, 52, 24.
60. Nosé, S. J. Chem. Phys. 1984, 87, 511.
61. Hoover, W. G. Phys. Rev. A 1984, 31, 1695.