Molecular dynamics algorithms for path integrals at constant pressure

Journal of Chemical Physics

Volumn 110, Issue 7, 1999, Pages 3275-3290

  Martyna, Glenn J ^a   Hughes, Adam ^a   Tuckerman, Mark E ^b  

^a INDIANA UNIVERSITY   (United States)

^b NEW YORK UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 0000394907     PISSN: 00219606     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1063/1.478193     Document Type: Article

References (49)

1. R. P. Feynman, Statistical Mechanics (Benjamin, Reading, 1972).
2. B. J. Berne and D. Thirumalai, Annu. Rev. Phys. Chem. 37, 401 (1986).
3. M. E. Tuckerman, B. J. Berne, G. J. Martyna, and M. L. Klein, J. Chem. Phys. 99, 2796 (1993).
4. M. B. Tuckerman, D. Marx, M. L. Klein, and M. Parrinello, J. Chem. Phys. 104, 5579 (1996).
5. G. J. Martyna and J. Cao, J. Chem. Phys. 104, 2028 (1996).
6. J. Cao and G. A. Voth, J. Chem. Phys. 99, 10070 (1993).
7. J. Cao and G. A. Voth, J. Chem. Phys. 100, 5106 (1994).
8. H. C. Andersen, J. Chem. Phys. 72, 2384 (1980).
9. M. Parrinello and A. Rahman, J. Chem. Phys. 80, 860 (1984).
10. G. J. Martyna, D. J. Tobias, and M. L. Klein, J. Chem. Phys. 101, 4177 (1994).
11. M. P. Allen and D. J. Tildesley, Computer Simulations of Liquids (Claredon, Oxford, 1989).
12. M. Marchi, M. Sprik, and M. L. Klein, J. Phys. Chem. 94, 431 (1990).
13. D. Scharf, G. J. Martyna, and M. L. Klein, J. Chem. Phys. 99, 8997 (1993).
14. R. Car and M. Parrinello, Phys. Rev. Lett. 55, 2471 (1985).
15. D. Marx and M. Parrinello, Z. Phys. B 95, 143 (1994).
16. J. Cao, Phys. Rev. E 49, 3907 (1994).
17. L. S. Schulman, Techniques and Applications of Path Integration (Wiley, New York, 1981).
18. D. Chandler and P. G. Wolynes, J. Chem. Phys. 74, 4078 (1981).
19. A. Hughs and G. J. Martyna (to be submitted).
20. R. W. Hall and B. J. Berne, J. Chem. Phys. 81, 3641 (1984).
21. D. McQuarrie, Statistical Mechanics (Harper and Row, New York, 1976).
22. S. Nosé and M. L. Klein, Mol. Phys. 50, 1055 (1983).
23. J. V. Lill and J. Q. Broughton, Phys. Rev. B 46, 12068 (1992).
24. J. P. Ryckaert and G. Ciccotti, J. Chem. Phys. 78, 7368 (1983).
25. M. F. Herman, E. J. Bruskin, and B. J. Berne, J. Chem. Phys. 76, 5150 (1982).
26. J. Cao and B. J. Berne, J. Chem. Phys. 99, 2902 (1993).
27. C. Chakravarty, M. C. Gordillo, and D. M. Ceperley, J. Chem. Phys. 109, 2123 (1998).
28. G. J. Martyna, M. L. Klein, and M. E. Tuckerman, J. Chem. Phys. 97, 2635 (1992).
29. M. E. Tuckerman, G. J. Martyna, and M. L. Klein, J. Chem. Phys. 97, 2635 (1992).
30. D. Scharf, G. Martyna, and M. L. Klein, Low Temp. Phys. 19, 365 (1993).
31. J. J. Morales and M. J. Nuevo, J. Comput. Chem. 16, 105 (1995).
32. S. E. Feller, Y. Zhang, R. W. Pastor, and B. R. Brooks, J. Chem. Phys. 103, 4613 (1995).
33. J. A. Barker, J. Chem. Phys. 70, 2914 (1978).
34. E. L. Pollock and D. M. Ceperley, Phys. Rev. B 30, 2555 (1984).
35. A. D. Klemm and R. G. Storer, Aust. J. Phys. 26, 43 (1973).
36. D. Thirumalai, E. J. Bruskin, and B. J. Berne, J. Chem. Phys. 79, 5063 (1983).
37. G. J. Martyna, M. E. Tuckerman, D. J. Tobias, and M. L. Klein, Mol. Phys. 87, 1117 (1996).
38. M. E. Tuckerman, G. J. Martyna, and B. J. Berne, J. Chem. Phys. 97, 1990 (1992).
39. Steve Plimpton, J. Comput. Phys. 117, 1 (1995).
40. A. Hughs, M. E. Tuckerman, S. Samuelson, D. J. Tobias, D. Yarne, M. L. Klein, and G. J. Martyna (to be submitted).
41. I. F. Silvera and V. V. Goldman, J. Chem. Phys. 69, 4209 (1978).
42. R. D. Goodwin, D. E. Diller, H. M. Roder, and L. A. Weber, J. Res. Natl. Bur. Stand., Sect. A 67A, 173 (1963).
43. B. N. Esel'son, Yu. P. Blagoi, V. V. Grigor'ev, V. G. Manzhelii, S. A. Mikhailenko, and N. P. Neklyudov, Properties of Liquid and Solid Hydrogen (Israel Program for Scientific Translations, Jerusalem. 1971). Translated from Russian by Ch. Niesenbaum.
44. A. MacKerell, Jr., D. Bashford, M. Bellott, R. L. Dumbrack, J. D. Evanseck, M. J. Field, S. Fischer, H. Guo, S. Ha, D. Joseph-McCarthy, L. Kcuhnir, K. Kuczera, F. T. K. Lau, C. Mattos, S. Michnick, T. Ngo, D. T. Nguyen, B. Prodhom, W. E. Reiher III, B. Rous, M. Schlenkrich, J. C. Smith, R. Stote, J. Straub, M. Watanabe, J. Wiorkiewicz-Kuczera, D. Yin, and M. Karplus, J. Phys. Chem. B 102, 3586 (1998).
45. A. Hughs and G. J. Martyna (to be submitted).
46. M. Sprik, M. Klein, and D. Chandler, J. Chem. Phys. 83, 3942 (1985).
47. M. Sprik, M. Klein, and D. Chandler, Phys. Rev. B 31, 4234 (1985).
48. D. F. Coker, D. Thirumalai, and B. J. Berne, J. Chem. Phys. 86, 5689 (1987).
49. P. G. Bergmann and J. L. Lebowitz, Phys. Rev. 99, 578 (1955).