Molecular dynamics study of a new rigidified 18-crown-6 derivative using a QM/MM method

International Journal of Quantum Chemistry

Volumn 60, Issue 6, 1996, Pages 1133-1141

  Thompson, Mark A ^a  

^a PACIFIC NORTHWEST NATIONAL LABORATORY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 0000182425     PISSN: 00207608     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/(SICI)1097-461X(1996)60:6<1133::AID-QUA3>3.0.CO;2-0     Document Type: Article

References (65)

1. G. Li and W. C. Still, J. Am. Chem. Soc. 115, 3804 (1993).
2. D. Live and S. I. Chan, J. Am. Chem. Soc. 98, 3769 (1975).
3. J.-M. Lehn, Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 27, 89 (1988).
4. D. J. Cram, Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 27, 1009 (1988).
5. J. Bourson, J. Pouget, and B. Valeur, J. Phys. Chem. 97, 4552 (1993).
6. J. D. Dunitz and P. Seiler, Acta. Cryst. B30, 2739 (1974).
7. E. P. Horwitz, M. L. Dietz, and D. E. Fisher, Solv. Extract. Ion Exchange 9, 1 (1991).
8. C. J. Pedersen, J. Am. Chem. Soc. 89, 2495 (1967).
9. C. J. Pedersen, J. Am. Chem. Soc. 89, 7017 (1967).
10. Z. Samec and P. Papoff, Anal. Chem. 62, 1010 (1990).
11. P. Seiler, M. Dobler, and J. D. Dunitz, Acta Cryst. B30, 2744 (1974).
12. J. D. Dunitz and P. Seiler, Acta Cryst. B30, 2750 (1974).
13. J. D. Dunitz, M. Dobler, P. Seiler, and R. P. Phizackerley, Acta. Cryst. B30, 2733 (1974).
14. M. Dobler, J. D. Dunitz, and P. Seiler, Acta Cryst. B30, 2741 (1974).
15. M. Dobler and R. P. Phizackerley, Acta Cryst. B30, 2746 (1974).
16. M. Dobler and R. P. Phizackerley, Acta Cryst. B30, 2748 (1974).
17. K. M. Doxsee, H. R. Wierman, and T. J. Weakley, J. Am. Chem. Soc. 114, 5165 (1992).
18. C. Srivanavit, J. I. Zink, and J. J. Kechter, J. Am. Chem. Soc. 99, 5876 (1977).
19. R. M. Izatt, J. S. Bradshaw, S. A. Nielsen, J. D. Lamb, and J. J. Christensen, Chem. Rev. 85, 271 (1985).
20. G. Gokel, Crown Ethers and Cryptands (Royal Society of Chemistry: Cambridge, 1991), Vol. 3.
21. T. Yamabe, K. Hori, K. Akagi, and K. Fukui, Tetrahedron 35 1065 (1979).
22. G. Wipff, P. Weiner, and P. Kollman, J. Am. Chem. Soc. 104, 3249 (1982).
23. K. Hori, H. Yamada, and T. Yamabe, Tetrahedron 39, 67 (1983).
24. G. Ranghino, S. Romano, J. M. Lehn, and G. Wipff, J. Am. Chem. Soc. 107, 7873 (1985).
25. A. E. Howard, U. C. Singh, M. Billeter, and P. A. Kollman, J. Am. Chem. Soc. 110, 6984 (1988).
26. T. P. Straatsma and J. A. McCammon, J. Phys. Chem. 91, 3631 (1989).
27. M. H. Mazor, J. A. McCammon, and T. P. Lybrand, J. Am. Chem. Soc. 112, 4411 (1990).
28. R. D. Hancock, Acc. Chem. Res. 23, 253 (1990).
29. L. X. Dang and P. A. Kollman, J. Am. Chem. Soc. 112, 5716 (1990).
30. Y. L. Ha and A. K. Chakraborty, J. Phys. Chem. 95, 10781 (1991).
31. Y. L. Ha and A. K. Chakraborty, J. Phys. Chem. 96, 6410 (1992).
32. E. T. Seidl and H. F. Schaeffer III, J. Phys. Chem. 95, 3589 (1991).
33. Y. Sun and P. A. Kollman, J. Chem. Phys. 97, 5108 (1992).
34. Y. L. Ha and A. K. Chakraborty, J. Phys. Chem. 97, 11291 (1993).
35. R. Rencsok, T. A. Kaplan and J. F. Harrison, J. Phys. Chem. 92, 9758 (1993).
36. B. P. Hay, J. R. Rustad, and C. J. Hostetler, J. Am. Chem. Soc. 115, 11158 (1993).
37. F. T. H. Leuwerink, S. Harkema, W. J. Briels, and D. Feil, J. Comp. Chem. 14, 899 (1993).
38. T. J. Marrone, D. S. Hartsough, K. M. Merz, Jr., J. Phys. Chem. 98, 1341 (1994).
39. T. Kowall and A. Geiger, J. Phys. Chem. 98, 6216 (1994).
40. M. A. Thompson, E. D. Glendening, D. F. Feller, J. Phys. Chem. 98 10465 (1994).
41. M. A. Thompson, J. Phys. Chem. 99, 4794 (1995).
42. E. D. Glendening, D. Feller, and M. A. Thompson, J. Am. Chem. Soc. 116, 10657 (1994).
43. Y. L. Ha and A. K. Chakraborty, J. Phys. Chem. 98, 11193 (1994).
44. T. Kowall and A. Geiger, J. Phys. Chem. 99, 5240 (1995).
45. L. X. Dang, J. E. Rice, J. Caldwell, and P. A. Kollman, J. Am. Chem. Soc. 113, 2481 (1991).
46. L. X. Dang and P. A. Kollman J. Phys. Chem. 99, 55 (1995).
47. M. J. Field, P. A. Bash, and M. Karplus, J. Comp. Chem. 11, 700 (1990).
48. A. Warshel, M. Levitt, J. Mol. Biol. 103, 227 (1976).
49. U. C. Singh and P. A. Kollman, J. Comp. Chem. 7, 718 (1986).
50. J. Gao and X. Xia, Science 258, 631 (1992).
51. J. Gao, J. Phys. Chem. 96, 6432 (1992).
52. J. Gao, L. W. Chou, and A. Auerbach, Biophys. J. 65, 43 (1993).
53. R. V. Stanton, D. S. Hartsough, and K. M. Merz, Jr., J. Phys Chem. 97, 11868 (1993).
54. M. J. S. Dewar, E. G. Zoebisch, E. F. Healy, and J. J. P. Stewart, J. Am. Chem. Soc. 107, 3902 (1985).
55. J. A. Pople, D. P. Santry, and G. A. Segal, J. Chem. Phys. 43, S129 (1965).
56. H. J. C. Berendsen, J. R. Grigera, and T. P. Straatsma, J. Phys. Chem. 91, 6269 (1987).
57. M. J. Frisch, G. W. Trucks, M. Head-Gordon, P. M. W. Gill, M. W. Wong, J. B. Forsman, B. G. Johnson, H. B. Schlegel, M. A. Robb, E. S. Replogle, R. Gomperts, J. L. Andres, K. Raghavachari, J. S. Binkley, C. Gonzalez, R. L. Martin, D. J. Fox, D. J. Defrees, J. Baker, J. J. P. Stewart, J. A. Pople, GAUSSIAN 92, 1992, GAUSSIAN Inc., Pittsburgh.
58. M. A. Thompson, Argus 3.0, 1994, Pacific Northwest Laboratory, Richland, WA 99352; d3fO12@pnlg.pnl.gov.
59. M. A. Thompson, M. C. Zerner, and J. Fajer, J. Phys. Chem. 95, 5693 (1991).
60. M. A. Thompson and M. C. Zerner, J. Am. Chem. Soc. 113, 8210 (1991).
61. M. A. Thompson and J. Fajer, J. Phys. Chem. 96, 2933 (1992).
62. M. P. Allen and D. J. Tildesley, Computer Simulations of Liquids (Oxford University Press, New York, 1987).
63. J.-P. Ryckaert, G. Ciccotti, and H. J. C. Berendsen, J. Comp. Phys. 23, 327 (1977).
64. H. J. C. Berendsen, J. P. M. Postma, W. F. van Gunsteren, A. DiNola, and J. R. Haak, J. Chem. Phys. 81, 3684 (1984).
65. D. Mootz, A. Albert, S. Schaefgen, and D. Staben, J. Am. Chem. Soc. 116, 12045 (1994).