Ultrafast spectroscopy of protein dynamics

Journal of Chemical Education

Volumn 75, Issue 5, 1998, Pages 559-564

  Hochstrasser, R M ^a  

^a UNIVERSITY OF PENNSYLVANIA   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 0000161584     PISSN: 00219584     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ed075p559     Document Type: Conference Paper

References (78)

1. Greene, B. I.; Hochstrasser, R. M.; Weisman, R. B.; Eaton, W. A. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1978, 75, 5525.
2. Moore, J. N.; Hansen, P. A.; Hochstrasser, R. M. Chem. Phys. Lett. 1987, 138, 110.
3. Anfinrud, P. A.; Han, C.; Hochstrasser, R. M. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1989, 86, 8387-8391.
4. Hansen, P. A.; Moore, J. N.; Hochstrasser, R. M. Chem. Phys. 1989, 131, 49.
5. Locke, B.; Lian, T.; Hochstrasser, R. M. Chem. Phys. 1991, 158, 409. Locke, B.; Lian, T.; Hochstrasser, R. M. Chem. Phys. 1995, 190, 155.
6. Locke, B.; Lian, T.; Hochstrasser, R. M. Chem. Phys. 1991, 158, 409. Locke, B.; Lian, T.; Hochstrasser, R. M. Chem. Phys. 1995, 190, 155.
7. Lim, M.; Jackson, T. A.; Anfinrud, P. A. Science 1995, 269, 962.
8. Dyer, R. B.; Einarsdottir, O.; Killough, P. M.; Lopez-Gariga, J. J.; Woodruff, W. H. J. Am Chem. Soc. 1989, 111, 7657.
9. Diller, R.; Cowen, B. R.; Maiti, S.; Iannone, M.; Bogomolni, R.; Hochstrasser, R. M. Biophys. J. 1992, 61, A533.
10. Diller, R.; Maiti, S.; Walker, G. C.; Cowen, B. R.; Pippenger, R.; Bogomolni, R. A.; Hochstrasser, R. M. Chem. Phys. Lett. 1995, 241, 109.
11. Maiti, S.; Cowen, B. R.; Diller, R.; Iannone, M.; Moser, C.; Dutton, P. L.; Hochstrasser, R. M. Biophys. J. 1992, 61, A100.
12. Maiti, S.; Walker, G. C.; Cowen, B. R.; Pippenger, R.; Moser, C. C.; Dutton, P. L.; Hochstrasser, R. M. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1994, 91, 10360-10364.
13. Hamm, P.; Zurek, M.; Mäntele, W.; Scheer, H.; Zinth, W. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1995, 92, 1826-1830.
14. Lim, M.; Jackson, T. A.; Anfinrud, P. A. J. Chem. Phys. 1995, 102, 4355.
15. Lim, M.; Jackson, T. A.; Anfinrud, P. A. J. Phys. Chem. 1996, 102, 12043.
16. Lian, T. S.; Locke, R. B.; Kholodenko, Y.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. 1995, 98, 11648.
17. Phillips, C. M.; Mizutani, Y.; Hochstrasser, R. M. Biophys. J. 1994, 66A, 398.
18. Phillips, C. M.; Mizutani, Y.; Hochstrasser, R. M. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1995, 92, 7292.
19. Williams, S.; Causgrove, T. P.; Gilmanshin, R.; Fang, K. S.; Callender, R. H.; Woodruff, W. H.; Dyer, R. B. Biochemistry 1996, 35, 691-697.
20. Wynne, K.; Haran, G.; Reid, G. D.; Moser, C. C.; Dutton, P. L.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. 1996, 100, 5140-5148.
21. Haran, G.; Wynne, K.; Xie, A.; He, Q.; Chance, M.; Hochstrasser, R. M. Chem. Phys. Lett. 1996, 261, 389-395.
22. Hochstrasser, R. M. Ultrafast Vibrational Spectroscopy of Molecular and Protein Dynamics; in Monographs on Chemistry in the 21st Century Series, IUPAC; El-Sayed, M. A., Ed.; Blackwell: Boston, 1995.
23. Cowen, B. R.; Hochstrasser, R. M. In Bioanalytical Application of FTIR Spectroscopy; Mantsch, H. H.; Chapman, D., Eds.; Wiley: New York, 1995; pp 107-129.
24. Walker, G. C.; Hochstrasser, R. M. In Laser Techniques in Chemistry; Meyers, A. B.; Rizzo, T. R., Eds.; Wiley: New York, 1995; pp 385-422.
25. Locke, B.; Diller, R.; Hochstrasser, R. M. In Biomolecular Spectroscopy; Clark, R. J. H.; Hester, R. E., Eds.; Wiley: New York, 1993; pp 1-47.
26. Krimm, S.; Bandekar, J. Adv. Protein Chem. 1986, 38, 181-364.
27. Infrared Spectroscopy of Biomolecules; Mantsch, H.; Chapman, D., Eds.; Wiley: New York, 1996.
28. Kumble, R.; Palese, S.; Visschers, R. W.; Dutton, P. L.; Hochstrasser, R. M. Chem. Phys. Lett. 1996, 261, 396-404.
29. Volk, M.; Kholodenko, Y; Gooding, E.; Lu, H.; DeGrado, W. F.; Hochstrasser, R. M. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 8607-8616.
30. Deisenhofer, J.; Epp, O.; Miki, K.; Huber, R.; Michel, H. J. Mol. Biol. 1984, 180, 385-398.
31. Deisenhofer, J.; Epp, O.; Miki, K.; Huber, R.; Michel, H. Nature 1985, 318, 618.
32. El-Kabbani, O.; Chang, C. H.; Tiede, D.; Norris, J.; Schiffer, M. Biochemistry 1991, 30, 5361.
33. Breton, J. Biochem. Biophys. Acta 1985, 810, 235-245.
34. Zinth, W.; Knapp, E. W.; Fischer, S. F.; Kaiser, W.; Deisenhofer, J.; Michel, H. Chem. Phys. Lett. 1985, 119, 1.
35. Interpretation of Optical Reaction Center Spectra; Scherer, P. O. J.; Fischer, S. F., Eds.;CRC: Boca Raton, FL, 1991.
36. Parson, W. W.; Warshel, A. J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, 6152.
37. Thompson, M. A.; Zerner, M. C.; Fajer, J. J. Phys. Chem. 1991, 95, 5693.
38. Thompson, M. A.; Zerner, M. C. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 8210.
39. Won, Y.; Friesner, R. A. J. Phys. Chem. 1988, 92, 2208.
40. Wraight, C. A.; Clayton, R. K. Biochem. Biophys. Acta 1973, 333, 246.
41. Woodbury, N. W.; Becker, M.; Middendorf, D.; Parson, W. W. Biochemistry 1985, 24, 7516.
42. Martin, J. L.; Breton, J.; Hoff, A. J.; Migus, A.; Antonetti, A. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1986, 83, 957-961.
43. Breton, J.; Martin, J.-L.; Migus, A.; Antonetti, A.; Orszag, A. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1986, 83, 5121-5125.
44. Breton, J.; Martin, J.-L.; Fleming, G. R.; Lambry, J.-C. Biochemistry 1988, 27, 8276-8284.
45. Kirmaier, C.; Holten, D. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1990, 87, 3552-3556.
46. Chan, C. K.; DiMagno, T. J.; Chen, L. X. Q.; Norris, J. R.; Fleming, G. R. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1991, 88, 11202.
47. Schmidt, C. A.; Kaiser, W.; Lauterwasser, C., Meyer, M.; Scheer, H.; Zinth, W. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1990, 90, 11757.
48. Vos, M. H.; Jones, M. R.; Hunter, C. N.; Breton, J.; Lambry, J.-C.; Martin, J.-L. Biochemistry 1994, 33, 6750-6757.
49. Schmidt, S.; Arlt, T.; Hamm, P.; Huber, H.; Naegele, T.; Wachtweitl, J.; Meyer, M.; Scheer, H.; Zinth, W. Chem. Phys. Lett. 1994, 223, 116.
50. van Grondelle, R.; Dekker, J. P.; Gillbro, T.; Sundstrom, V. Biochem. Biophys. Acta 1994, 1187, 1.
51. Karrasch, S.; Bullough, P. A.; Ghosh, R. EMBO J. 1995, 14, 631.
52. McDermott, G.; Prince, S. M.; Freer, A. A.; Hawthornthwaite-Lawless, A. M.; Papiz, M. Z.; Cogdell, R. J.; Isaacs, N. W. Nature 1995, 374, 517.
53. Visser, H. M.; Somsen, O. J. G.; van Mourik, F.; Lin, S.; van Stokkum, I. H. M.; van Grondelle, R. Biophys. J. 1995, 69, 1083.
54. Bradforth, S. E.; Jimenez, R.; van Mourik, F.; van Grondelle, R.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. 1995, 99, 16179.
55. Jimenez, R.; Dikshit, S. N.; Bradforth, S. E.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. 1996, 100, 6825 (1996).
56. Oesterhelt, D.; Stoeckenius, W. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1973, 70, 2853.
57. Mathies, R. A.; Lin, S. W.; Ames, J. B.; Pollard, W. T. Annu. Rev. Biophys. Biophys. Chem. 1991, 20, 491-518.
58. Polland, H.-J.; Franz, M. A.; Zinth, W.; Kaiser, W.; Koelling, E.; Oesterhelt, D. Biophys. J. 1986, 49, 651-662.
59. Petrich, J. W.; Breton, J.; Martin, J. L.; Antonetti, A. Chem. Phys. Lett. 1987, 137, 369-375.
60. Dobler, J.; Zinth, W.; Kaiser, W.; Oesterhelt, D. Chem. Phys. Lett. 1988, 144, 215.
61. Pollard, W. T.; Cruz, C. H. B.-Ë.; Shank, C. V.; Mathies, R. A. J. Chem. Phys. 1989, 90, 199.
62. Lozier, R. H.; Bogomolni, R. A.; Stoeckenius, W. Biophys. J. 1975, 15, 955.
63. Doig, S. J.; Reid, P. J.; Mathies, R. A. J. Phys. Chem. 1991, 95, 6372-6379.
64. Myers, A. B.; Harris, R. A.; Mathies, R. A. J. Chem. Phys. 1983, 79, 603.
65. Atkinson, G. H.; Brack, T. L.; Blanchard, D.; Rumbles, G. Chem. Phys. 1989, 131, 1.
66. van den Berg, R.; Jang, D. L.; Bitting, H. C.; El-Sayed, M. A. Biophys. J. 1990, 55, 135.
67. Ujj, L.; Bolodin, B. L.; Popp, A.; Delaney, J. K.; Atkinson, G. H. Chem. Phys. 1994, 182, 291.
68. Shreve, A. P.; Mathies, R. A. J. Phys. Chem. 1995, 99, 7285.
69. Blanchard, D.; Gilmore, D. A.; Brack, T. L.; Lemaire, H.; Hughes, D.; Atkinson, G. H. Chem. Phys. 1991, 154, 155.
70. Du, M.; Fleming, G. R. Biophys. Chem. 1993, 48, 101-111.
71. Kandori, H.; Yoshihara, K.; Tomioka, H.; Sasabe, H.; Shicida, Y. Chem. Phys. Lett. 1993, 211, 385.
72. Logunov, S. L.; Song, L.; El-Sayed, M. A. J. Phys. Chem. 1994, 98, 10674.
73. Birge, R. R.; Findsen, L. A.; Pierce, B. M. J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, 5041.
74. Robb, M. A.; Bernardi, F.; Olivucci, M. Pure Appl. Chem. 1995, 67, 783.
75. Englander, S. W.; Mayne, L. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 1992, 21, 243.
76. Kim, P. S.; Baldwin, R. L. Annu. Rev. Biochem. 1990, 59, 631-660.
77. Sali, A.; Shakhnovich, E.; Karplus, M. Nature 1994, 369, 248-251.
78. Skolnick, J.; Kolinski, A.; Godzik, A. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1993, 90, 2099-2100.