Translational diffusion in lipid bilayers: Dynamic free-volume theory and molecular dynamics simulation

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 103, Issue 2, 1999, Pages 385-394

  Xiang, Tian Xiang ^a  

^a UNIVERSITY OF UTAH   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 0000011123     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp9836731     Document Type: Article

References (79)

1. Cone, R. A. Nature New Biol. 1972, 236, 39.
2. Peters, R.; Cherry, R. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1982, 79, 4317.
3. Lakowicz, J. R. Spectroscopy in Biochemistry; Chemical Rubber: Boca Raton, FL, 1981; Vol. 1.
4. Vrentas, J. S.; Vrentas, C. M. J. Polym. Sci., Polym. Lett. 1990, 28, 379.
5. Moscicki, J. K.; Shin, Y.-K.; Freed, J. H. J. Chem. Phys. 1993, 99, 634.
6. Stein, W. D. Transport and Diffusion Across Cell Membranes; Academic Press: Orlando, FL, 1986.
7. Vaz, W. L. C.; Clegg, R. M.; Hallmann, D. Biochemistry 1985, 24, 781.
8. Almeida, P. F. F.; Vaz, W. L. C.; Thompson, T. E. Biochemistry 1992, 31, 6739.
9. Xiang, T.-X.; Anderson, B. D. Biophys. J. 1997, 72, 223.
10. Xiang, T.-X.; Anderson, B. D. Biophys. J. 1998, 75, 2658.
11. Cohen, M. H.; Turnbull, D. J. Chem. Phys. 1959, 31, 1164.
12. Macedo, P. B.; Litovitz, T. A. J. Chem. Phys. 1965, 42, 245.
13. Vrentas, J. S.; Duda, J. L. J. Polm. Sci. 1977, 15, 403.
14. Fujita, H. Polym. J. 1991, 23, 1499.
15. Zielinski, J. M.; Duda, J. L. AIChE J. 1992, 38, 405.
16. Chapman, S.; Cowling, T. G. The mathematical theory of nonuniform gases; Cambridge University Press: Cambridge, 1970.
17. Bueche, F. Physical properties of polymers; Interscience: New York, 1962.
18. Vrentas, J. S.; Jarzebski, C. M.; Duda, J. L. AIChE J. 1975, 21, 894.
19. Wu, J. C.; Peppas, N. A. J. Polym. Sci. Part B: Polym. Phys. 1993, 31, 1503.
20. Krishna Pant, P. V.; Boyd, R. H. Macromolecules 1993, 26, 679.
21. Xiang, T.-X. J. Chem. Phys. 1998, 109, 7876.
22. Xiang, T.-X. Biophys. J. 1993, 65, 1108.
23. Bassolino-Klimas, D.; Alper, H. E.; Stouch, T. R. Biochemistry 1993, 32, 12624.
24. Bassolino-Klimas, D.; Alper, H. E.; Stouch, T. R. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 4118.
25. Marrink, S.-J.; Berendsen, H. J. C. J. Phys. Chem. 1994, 98, 4155.
26. Marrink, S. J.; Berendsen, H. J. C. J. Phys. Chem. 1996, 100, 16729.
27. Jin, B.; Hopfinger, A. J. Pharm. Res. 1996, 13, 1786.
28. Marqusee, J. A.; Dill, K. A. J. Chem. Phys. 1986, 85, 434.
29. Xiang, T.-X.; Anderson, B. D. Biophys. J. 1994, 66, 561.
30. Pohorille, A.; Cieplak, P.; Wilson, M. A. Chem. Phys. 1996, 204-337, 337.
31. Vertenstein, M.; Ronis, D. J. Chem. Phys. 1987, 87, 5457.
32. Huertas, M. L.; Cruz, V.; Cascales, J. J. L.; Acuna, A. U.; de la Torre, J. G. Biophys. J. 1996, 71, 1428.
33. Tildesley, D. J.; Madden, P. A. Mol. Phys. 1983, 48, 129.
34. Kubo, R. J. Phys. Soc. Jpn. 1957, 12, 570.
35. Kubo, R. Rep. Prog. Phys. 1966, 29, 255.
36. Zwanzig, R. Annu. Rev. Phys. Chem. 1965, 16, 67.
37. Allen, M. P.; Tildesley, D. J. Computer simulation of liquids; Clarendon Press: Oxford, 1992.
38. Muller-Plathe, F.; Rogers, S. C.; Gunsteren, W. F. v. J. Chem. Phys. 1993, 98, 9895.
39. Katz, Y. Biochim. Biophys. Acta 1981, 647, 119.
40. Xiang, T.-X.; Anderson, B. D. J. Pharm. Sci. 1994, 83, 1511.
41. Kennedy, R. R.; Stokes, J. W.; Downing, P. Anaesth. Intensive Care 1992, 20, 66.
42. Xiang, T.-X.; Anderson, B. D. J. Chem. Phys. 1995, 103, 8666.
43. Nagle, J. F. Biophys. J. 1993, 64, 1476.
44. Toxvaerd, S. J. Chem. Phys. 1990, 93, 4290.
45. Wiener, M. C.; White, S. H. Biophys. J. 1992, 61, 434.
46. Edholm, O.; Nyberg, A. M. Biophys. J. 1992, 63, 1081.
47. Jacobs, R. E.; Hudson, B. S.; Andersen, H. C. Biochemistry 1977, 16, 4349.
48. Pierotti, R. A. Chem. Rev. 1976, 76, 717.
49. Karaborni, S.; Toxvaerd, S.; Olsen, O. H. J. Phys. Chem. 1992, 96, 4965.
50. Peters, G. H.; Toxvaerd, S.; Sverndsen, A.; Olsen, O. H. J. Chem. Phys. 1994, 100, 5996.
51. Berendsen, H. J. C.; Postma, J. P. M.; van Gunsteren, W. F.; DiNola, A.; Haak, J. R. J. Chem. Phys. 1984, 81, 3684.
52. Frenkel, J. Kinetic theory of liquids; Dover: New York, 1955.
53. Williams, M. L.; Landel, R. F.; Ferry, J. D. J. Am. Chem. Soc. 1955, 77, 3701.
54. Sceats, M. G.; Dawes, J. M. J. Chem. Phys. 1985, 83, 1298.
55. Turnbull, D.; Cohen, M. H. J. Chem. Phys. 1961, 34, 120.
56. Pastor, R. W.; Venable, R. M. J. Chem. Phys. 1988, 89, 1128.
57. Choi, K.; Jo, W. H. Macromolecules 1995, 28, 8598.
58. Trauble, H. J. Membr. Biol. 1971, 4, 193.
59. DeYoung, L. R.; Dill, K. A. Biochemistry 1988, 27, 5281.
60. Boden, N.; Jones, S. A.; Sixl, F. Biochemistry 1991, 30, 2146.
61. Seelig, A.; Seelig, J. Biochemistry 1974, 13, 4839.
62. Padilla, P.; Toxvaerd, S. J. Phys. Chem. 1991, 94, 5650.
63. Dix, J. A.; Kivelson, D.; Diamond, J. A. J. Membr. Biol. 1978, 40, 315.
64. Evans, D. F.; Tominaga, T.; Chan, C. J. Solution Chem. 1979, 8, 461.
65. Bondi, A. J. Phys. Chem. 1954, 58, 929.
66. Saffman, P. G.; Delbruck, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1975, 72, 3111.
67. Hughes, B. D.; Pailthope, B. A.; White, L. R.; Sawyer, W. H. Biophys. J. 1982, 37, 673.
68. Venable, R. M.; Zhang, Y.; Hardy, B. J.; Pastor, R. W. Science 1993, 262, 223.
69. Brown, M. F. J. Chem. Phys. 1984, 80, 2808.
70. Xiang, T.-X.; Anderson, B. D. J. Membr. Biol. 1994, 140, 111.
71. Potts, R. O.; Guy, R. H. Pharm. Res. 1995, 12, 1628.
72. Johnson, M. E.; Berk, D. A.; Blankschtein, D. B.; Golan, D. E.; Jain, R. K.; Langer, R. S. Biophys. J. 1996, 71, 2656.
73. Powell, R. J.; Hildebrand, J. H. J. Chem. Phys. 1971, 55, 4715.
74. Hildebrand, J. H.; Lamoreaux, R. H. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1974, 71, 3321.
75. Lieb, W. R.; Stein, W. D. Nature 1969, 224, 240.
76. Coughlin, C. S.; Mauritz, K. A.; Storey, R. F. Macromolecules 1990, 23, 3187.
77. Weiner, S. J.; Kollman, P. A.; Case, D. A.; Singh, U. C.; Ohio, C.; Alagona, G.; Profeta, J.; Weiner, P. J. Am. Chem. Soc. 1984, 106, 765.
78. van der Ploeg, P.; Berendsen, H. J. C. J. Chem. Phys. 1982, 76, 3271.
79. Nakanishi, K.; Voigt, E. M.; Hildebrand, J. H. J. Chem. Phys. 1964, 42, 1860.